ซอฟต์แวร์พันธมิตรโอเพ่นซอร์สใช้สำหรับจัดการการเชื่อมต่อระหว่างธุรกิจและ บริษัท ในเครือและเพื่อช่วยส่งค่าคอมมิชชั่นไปยัง บริษัท ในเครือ โปรแกรมควรจะสามารถตั้งค่าคอมมิชชั่นสำหรับผลิตภัณฑ์ดังนั้น บริษัท ในเครือจึงรู้ว่าพวกเขาจะทำเงินได้เท่าไหร่ คุณสมบัติการรายงานมีความสำคัญต่อซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ซโอเพนซอร์สเพราะช่วยให้ผู้ใช้ทราบว่ามีการทำธุรกรรมจำนวนเท่าใดควรจะจ่ายเงินให้พันธมิตรใดและปริมาณการรับส่งข้อมูลที่เข้ามาคุณสมบัติการชำระเงิน ดังนั้นจึงไม่มีพันธมิตรใดจะรู้สึกโกง โปรแกรมพันธมิตรต้องมีเอกสารที่ดีและชุมชนผู้ใช้ที่ใช้งานอยู่เพราะโปรแกรมโอเพ่นซอร์สอาจไม่มีการสนับสนุนทางเทคนิคอย่างเป็นทางการ
เมื่อธุรกิจสร้างโปรแกรมพันธมิตรนั้นจะกำหนดเปอร์เซ็นต์ค่าคอมมิชชันที่จ่ายให้กับ Affiliate ทุกครั้งที่มีการขายผลิตภัณฑ์ เพื่อให้แน่ใจว่า บริษัท ในเครือรู้อย่างชัดเจนว่าพวกเขาจะทำเงินได้เท่าไรสำหรับแต่ละผลิตภัณฑ์โปรแกรมโอเพนซอร์ซโอเพนซอร์สควรจะสามารถอนุญาตให้ผู้ใช้ตั้งค่าคอมมิชชั่นได้ นอกเหนือจากเปอร์เซ็นต์แล้วพันธมิตรยังสามารถกำหนดค่าคอมมิชชั่นสำหรับการขายครั้งเดียวหรือตลอดอายุการเป็นสมาชิกของผู้ซื้อในเว็บไซต์การสมัครสมาชิก
ธุรกิจต้องติดตาม บริษัท ในเครือเพื่อทราบเมื่อมีการขาย คุณสมบัติการรายงานที่มีประสิทธิภาพเป็นสิ่งจำเป็นในซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ส ไม่เช่นนั้นธุรกิจอาจลืมจ่ายเงินให้กับ Affiliate ซึ่งอาจทำให้เกิดปัญหาได้ การติดตามนี้จะช่วยให้ธุรกิจทราบว่า บริษัท ในเครือใดที่ทำงานได้ดีที่สุดเพื่อให้พวกเขาสามารถรับโบนัสเพื่อให้แน่ใจว่าพวกเขาจะนำยอดขายมาสู่ บริษัท ต่อไป คุณสมบัติการติดตามยังช่วยให้มั่นใจว่าบุคคลที่เหมาะสมได้รับค่าคอมมิชชั่น
หลังจากการขายหรือการเป็นสมาชิกเสร็จสิ้นธุรกิจมีภาระผูกพันที่จะต้องจ่ายพันธมิตรที่นำลูกค้าเข้ามา เพื่อตอบสนอง บริษัท ในเครือที่แตกต่างกันควรมีโมดูลวิธีการชำระเงินที่แตกต่างกันในซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ส สิ่งนี้ทำให้ธุรกิจสามารถใช้เช็คการโอนทางอิเล็กทรอนิกส์การโอนเงินผ่านธนาคารและวิธีการอื่น ๆ เพื่อชำระเงินให้กับพันธมิตร
ซอฟต์แวร์โอเพ่นซอร์สบางตัวไม่ได้สร้างขึ้นด้วยมาตรฐานเดียวกันกับซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ซเนื่องจากธุรกิจมักจะไม่สนับสนุนโครงการและนักพัฒนาไม่ได้ทำเงินในโปรแกรม ผู้ใช้ควรเลือกซอฟต์แวร์โอเพนซอร์ซโอเพนซอร์ซที่ทำหน้าที่เหมือนโปรแกรมโอเพนซอร์สแบบมืออาชีพ ชุมชนผู้ใช้ที่ใช้งานอยู่จะช่วยให้มั่นใจได้ว่าผู้ใช้มีหลายคนที่สามารถช่วยในกรณีที่โปรแกรมทำงานผิดพลาดหรือทำงานผิดปกติ


