มีโปรแกรมซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บหลายสิบโปรแกรม แต่แต่ละโปรแกรมมีข้อดีและข้อเสียของตัวเอง ตัวอย่างเช่นบางโปรแกรมอนุญาตให้เรียกดูแบบร่วมสนับสนุนเสียงขั้นสูงและถ่ายโอนไฟล์จากคอมพิวเตอร์เครื่องหนึ่งไปยังอีกเครื่องหนึ่ง อย่างไรก็ตามสิ่งที่สำคัญกว่าคุณสมบัติการทำงานคือความเข้ากันได้ของระบบปฏิบัติการ มีโปรแกรมซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บสำหรับMicrosoft®, Linux®และ Mac OS®ซึ่งบางโปรแกรมไม่สามารถทำงานร่วมกันได้ ท้ายสุดโปรแกรมเหล่านี้สามารถเป็นอิสระหรือชำระด้วยค่าธรรมเนียมแบบครั้งเดียวหรือรายเดือนและจำนวนผู้ใช้โปรแกรมในครั้งเดียวถูก จำกัด ไว้
ซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บบางประเภทมีคุณสมบัติที่หนักกว่าซอฟต์แวร์อื่น ๆ ตัวอย่างเช่นการค้นหาแบบร่วมเป็นคุณลักษณะยอดนิยมที่อนุญาตให้ผู้ใช้คอมพิวเตอร์หลักคลิกที่ลิงค์ของเว็บไซต์และผู้เข้าร่วมประชุมทั้งหมดจะแสดงผลลัพธ์ บางโปรแกรมอนุญาตการถ่ายโอนไฟล์โดยไม่ต้องแท็บห่างจากการประชุมผ่านเว็บเนื่องจากอินเทอร์เฟซถูกสร้างขึ้นเพื่อส่งไฟล์อย่างรวดเร็ว ฟีเจอร์หนึ่งที่มีความต้องการเพิ่มขึ้นคือความเข้ากันได้กับสมาร์ทโฟนซึ่งช่วยให้บุคคลเข้าร่วมการประชุมผ่านวิดีโอผ่านโทรศัพท์มือถือ
ซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บไม่สามารถใช้ร่วมกับระบบปฏิบัติการคอมพิวเตอร์ทุกเครื่องได้ หากผู้จัดการประชุมเลือกโปรแกรมMicrosoft®เท่านั้นทุกคนที่มี Mac OS®และLinux®จะถูกแยกออกจากการประชุมเนื่องจากความเข้ากันไม่ได้ของระบบ โปรแกรมซอฟต์แวร์การประชุมออนไลน์จำนวนมากเข้ากันได้กับระบบปฏิบัติการคอมพิวเตอร์ยอดนิยมอย่างไรก็ตามเช่น Adobe Acrobat Connect®, Microsoft Live Meeting®และ IBM Lotus Sametime Unyte®
ในขณะที่บางโปรแกรมซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บให้บริการฟรี แต่หลาย บริษัท เลือกที่จะคิดค่าบริการ บางครั้งค่าธรรมเนียมถูกจัดโครงสร้างเพื่อให้ บริษัท ขนาดเล็กที่มีพนักงานน้อยจ่ายมากน้อยกว่า บริษัท ที่ต้องการประชุมกับคนหลายร้อยคน ตัวอย่างเช่นการประชุมแบบไม่ จำกัด กับ 15 คนอาจเป็นหนึ่งในสามของค่าใช้จ่ายในการประชุมกับ 100 คน ค่าธรรมเนียมเหล่านี้ไม่สามารถใช้ได้ทันทีและสามารถขอรับใบเสนอราคาที่กำหนดเองได้โดยโทรหรือส่งอีเมลถึง บริษัท
การค้นหาโปรแกรมซอฟต์แวร์การประชุมผ่านเว็บราคาไม่แพงที่สามารถจัดการระบบปฏิบัติการทั้งหมดและมีคุณสมบัติที่ต้องการทั้งหมดอาจเป็นงานที่น่ากังวล โดยทั่วไปแล้วซอฟต์แวร์ขัดเงามากที่มีคุณสมบัติที่ดีและความจุสูงไม่ได้มาในราคาที่น้อย ค่าใช้จ่ายนี้อาจถูกชดเชยด้วยการเดินทางที่ลดลงเนื่องจาก บริษัท ไม่จำเป็นต้องส่งพนักงานออกไปหลายร้อยไมล์และจ่ายค่าตั๋วเครื่องบินอาหารและที่พักให้แก่พนักงานอีกต่อไป
