บูตเซกเตอร์คือส่วนของฮาร์ดดิสก์หรือฟลอปปี้ดิสก์ที่มีรหัสเก็บไว้เพื่อบู๊ตโปรแกรมพิเศษและเพื่ออ้างอิงคุณสมบัติสำคัญอื่น ๆ เพื่อให้ดิสก์ทำงานได้ มีหลายประเภท แต่มีสองประเภทหลัก: มาสเตอร์บูตเรคคอร์ดและบันทึกปริมาณการบูต มาสเตอร์บูตเรคคอร์ดมีอยู่ในไดรฟ์ที่ได้รับการแบ่งพาร์ติชันและมักจะพบพาร์ติชันที่ใช้งานอยู่และรันไดรฟ์ข้อมูลบูตของตัวเอง ในทางกลับกันปริมาณบูตบันทึกมักจะมีรหัสเพื่อเรียกใช้ระบบปฏิบัติการบนคอมพิวเตอร์
ฮาร์ดดิสก์ไดรฟ์ประกอบด้วยมาสเตอร์บูตเรกคอร์ดเป็นบูตเซกเตอร์แรกของพวกเขาในขณะที่ฟลอปปีดิสก์หรือดิสก์ USB มักจะประกอบด้วยไดรฟ์ข้อมูลบันทึกบูตเป็นเซกเตอร์สำหรับเริ่มระบบแรกเนื่องจากไม่สามารถแบ่งพาร์ติชันได้ ไบออสของคอมพิวเตอร์ซึ่งเป็นชิ้นส่วนที่ทำงานก่อนสิ่งอื่นใดจะตรวจสอบเซ็กเตอร์ของไดรฟ์นี้ทันทีไม่ว่าจะเป็นไดรฟ์หลักหรือไดรฟ์ข้อมูลสำหรับคำแนะนำเกี่ยวกับสิ่งที่ต้องทำต่อไป บูตเซกเตอร์อาจมีคำแนะนำในการทำสิ่งที่ค่อนข้างซับซ้อนซึ่งมีการใช้งานสำหรับสิ่งต่าง ๆ เช่นให้ผู้ใช้มีตัวเลือกในการเรียกใช้ระบบปฏิบัติการหนึ่งในหลาย ๆ ระบบ แต่ก็หมายความว่ามีโอกาสที่จะถูกละเมิด
ในการเป็นบูตเซกเตอร์นั้นเซกเตอร์นั้นต้องผ่านเกณฑ์เพียงหนึ่งเกณฑ์เท่านั้นซึ่งจะต้องมีลายเซ็นต์ของ 0xAA55 เป็นสองไบต์สุดท้าย ความล้มเหลวในการมีลายเซ็นนี้อาจส่งผลให้เกิดข้อผิดพลาดและคอมพิวเตอร์อาจบูตไม่สมบูรณ์ สิ่งนี้สามารถเกิดขึ้นได้จากหลายสาเหตุรวมถึงไวรัสหรือเซกเตอร์ที่เสียหายจากข้อผิดพลาดทางกายภาพของไดรฟ์เอง
ไวรัสประเภทนี้เป็นเพียงไวรัสที่เข้ามาแทนที่รหัสบูตเซกเตอร์ปกติด้วยรหัสที่เลือกไว้ เนื่องจากบูตเซกเตอร์ถูกโหลดเมื่อใดก็ตามที่คอมพิวเตอร์เริ่มทำงานไวรัสดังกล่าวอาจถูกทำลายอย่างไม่น่าเชื่อและในบางกรณีอาจเป็นการยากที่จะลบอย่างถูกต้อง เนื่องจากไวรัสถูกโหลดเข้าสู่หน่วยความจำทันทีที่คอมพิวเตอร์เริ่มทำงานจึงสามารถแพร่กระจายไปยังทุก ๆ ไดรฟ์หรือดิสก์ที่คอมพิวเตอร์ที่ติดเชื้อเข้ามาติดต่อได้ง่าย
วิธีทั่วไปที่ไวรัสเซกเตอร์สำหรับบูตแพร่กระจายคือการทิ้งดิสก์ที่ติดไวรัสไว้ในดิสก์ไดรฟ์ของคอมพิวเตอร์ เมื่อเปิดเครื่องครั้งถัดไป BIOS จะอ่านบันทึกการบู๊ตปริมาณของดิสก์นั้นรับไวรัสและส่งผ่านไปยังหน่วยความจำ จากที่นั่นสามารถแพร่กระจายไปยังไดรฟ์อื่น ๆ และใส่ดิสก์อื่น ไวรัสสามารถส่งผ่านเครือข่ายได้อย่างไรก็ตามหากไม่ได้รับการป้องกันอย่างเหมาะสมและอาจถูกส่งเป็นสิ่งที่แนบมากับอีเมล
การลบไวรัสบูตเซกเตอร์นั้นต้องการโปรแกรมป้องกันไวรัสที่ดี หลายคนเข้ารหัสเซกเตอร์สำหรับเริ่มระบบเมื่อพวกเขาติดเชื้อดังนั้นจึงไม่ใช่เรื่องที่จะทำการลบไวรัส ด้วยเหตุนี้จึงเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องใช้โปรแกรมป้องกันไวรัสที่ดีซึ่งมีรีจิสทรีของไวรัสจำนวนมากและสามารถลบไวรัสอย่างระมัดระวังโดยไม่ทำให้คอมพิวเตอร์เสียหาย
