กราฟิก คำหมายถึงภาพวาดหรือภาพที่สร้างขึ้นตามกฎของคณิตศาสตร์ โมเลกุล หมายถึงโมเลกุลและส่วนประกอบ ดังนั้นความหมายหนึ่งของ โมเลกุลกราฟิก (MG) คือการศึกษาโมเลกุลผ่านการสร้างภาพของโมเลกุลตัวเองและส่วนประกอบต่างๆ กราฟิกระดับโมเลกุลยังหมายถึงภาพสามมิติของโมเลกุลที่ทำขึ้นเพื่อตรวจสอบพวกเขาและเข้าใจการตอบสนองของพวกเขาในระหว่างปฏิกิริยาและการโต้ตอบ
กราฟิกระดับโมเลกุลมีข้อดีเหนือกว่าแบบจำลองทางกายภาพ แบบจำลองทางกายภาพสามารถทำให้เกิดปัญหาได้เนื่องจากโครงสร้างถูกบดบังมีการแสดงผลที่ผิดพลาดของความยืดหยุ่นการซ้อนทับเป็นไปไม่ได้เกือบหรือพวกมันยุ่งยากเกินไปที่จะทำงานด้วย ปัญหาทั้งหมดนี้สามารถแก้ไขได้ด้วยกราฟิกคอมพิวเตอร์
กุญแจสำคัญในการใช้กราฟิกโมเลกุลคือการศึกษาโปรตีนและกรดนิวคลีอิก ความร่วมมือการวิจัยสำหรับธนาคารข้อมูลโปรตีนชีวภาพโครงสร้าง (RCSB) ธนาคารข้อมูล (PDB) ซึ่งข้อมูลการทดลองกำหนดเกี่ยวกับโครงสร้างของกรดนิวคลีอิกโปรตีนและการประกอบที่ซับซ้อนจะถูกเก็บไว้สำหรับการเข้าถึงทั่วไป ณ วันที่ 27 เมษายน 2010 มีโครงสร้าง 64,932 โครงสร้างในฐานข้อมูล RCSB ทำให้การทำงานของพวกเขาเป็นที่นิยมด้วยการเชื้อเชิญให้ผู้มาเยี่ยมชมสร้างโมเดลไวรัส 3D ที่ Rutgers University ใน Rutgers Day RCSB ยังสนับสนุนการทดลองสร้างแบบจำลองโปรตีนที่ Science Science Olympiads ระดับภูมิภาคในสหรัฐอเมริกา ธนาคารข้อมูลโปรตีนทั่วโลก (wwPDB) เป็นองค์กรระหว่างประเทศที่กลุ่มเช่น RCSB; PDBe สหภาพยุโรป และ PDBj คู่ที่ญี่ปุ่น; เป็นของ
อีกประเด็นหนึ่งที่กราฟิคโมเลกุลมีความสำคัญอย่างยิ่งก็คือการออกแบบยา การออกแบบยาช่วยในระดับโมเลกุลหรือที่เรียกว่าการออกแบบยาช่วยคอมพิวเตอร์ (CADD), การออกแบบโมเลกุลช่วยคอมพิวเตอร์ (CAMD) หรือการออกแบบยาตามโครงสร้าง (SBDD) เป็นหนึ่งในงานวิจัยที่สำคัญของคณะที่เกี่ยวข้องใน ตัวอย่างเช่นความเชี่ยวชาญทางเคมีของมหาวิทยาลัยเวอร์จิเนียคอมมอนเวลธ์ในสาขาวิชาเภสัชศาสตร์
ซอฟต์แวร์เฉพาะทางเพื่อสร้างกราฟิกโมเลกุลเรียกว่า ซอฟต์แวร์ออกแบบโมเลกุล มีให้บริการในแพ็คเกจเชิงพาณิชย์จำนวนหนึ่ง มีบางรุ่นที่อุทิศให้กับการออกแบบยาที่ใช้โมเลกุลกราฟิกเช่นกัน ในการออกแบบยาคุณสมบัติของการ เชื่อมต่อ - ความสามารถในการเชื่อมต่อโมเลกุลที่แสดงกับตัวรับ - เป็นหนึ่งในคุณสมบัติหลักที่แยกความแตกต่างของซอฟต์แวร์ออกแบบยาในรูปแบบซอฟต์แวร์ออกแบบโมเลกุลอื่น ๆ
