วิทยาการเข้ารหัสลับของระบบคือการใช้การเข้ารหัสเพื่อซ่อนข้อมูลบนคอมพิวเตอร์ ระดับของความซับซ้อนของการเข้ารหัสดังกล่าวเพิ่มขึ้นเมื่อเวลาผ่านไป แต่ก็ยังแตกต่างกันอย่างกว้างขวาง Microsoft ใช้การเข้ารหัสระบบวลีในบางรุ่นของ Windows สำหรับการตั้งค่าที่สามารถกำหนดระดับความปลอดภัยของคอมพิวเตอร์ให้เป็นไปตามมาตรฐานอย่างเป็นทางการสำหรับคอมพิวเตอร์รัฐบาล
การเข้ารหัสแบบแรก ๆ ที่มีมาก่อนคอมพิวเตอร์เพียง แต่เกี่ยวข้องกับการแทนที่ตัวอักษรแต่ละตัวด้วยตัวอักษรรหัสตามรูปแบบที่สอดคล้องกัน ระบบอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับการใช้คำรหัสเพื่อแทนที่คำสั่งหรือข้อมูลบางส่วน สิ่งนี้มีข้อได้เปรียบที่ใช้งานได้ง่ายและใช้งานง่ายหากผู้รับรู้ว่าระบบรหัสถูกใช้งาน แต่เป็นการยากที่จะถอดรหัสสำหรับผู้อ่านที่ไม่ได้รับอนุญาต
อย่างไรก็ตามระบบดังกล่าวไม่เพียงพอสำหรับเทคโนโลยีคอมพิวเตอร์ นี่เป็นเพราะแคร็กระบบเข้ารหัสที่รู้จักกันว่าอัลกอริทึมหรือรหัสลับเป็นกระบวนการที่มีความยาว แต่ไม่ซับซ้อน ตัวอย่างเช่นหากระบบแทนที่ตัวอักษรแต่ละตัวด้วยตัวอักษรอื่นมันสามารถแก้ไขได้โดยเพียงแค่ลองใช้ความเป็นไปได้แต่ละครั้งจนกว่าจะพบทั้งระบบและข้อความที่เข้ารหัส สิ่งนี้จะใช้เวลานานเกินไปสำหรับคนส่วนใหญ่ที่จะรำคาญ แต่เป็นงานที่คอมพิวเตอร์สามารถทำได้อย่างรวดเร็ว
วิทยาการเข้ารหัสลับสมัยใหม่ส่วนใหญ่ทำงานตามบรรทัดที่คล้ายกัน แต่ใช้อัลกอริทึมที่ซับซ้อนมากขึ้น สิ่งนี้จะเพิ่มเวลาที่ใช้ในการถอดรหัสอัลกอริทึม ปัญหาหนึ่งที่ยังคงมีอยู่คือการพัฒนาความเร็วในการคำนวณและความเร็วของการประมวลผลอย่างรวดเร็วหมายถึงอัลกอริทึมที่ครั้งหนึ่งเคยมีความซับซ้อนมากจนไม่สามารถเอาชนะลมล้าสมัยได้ อัลกอริธึมบางอย่างถูกทำลายโดยธนาคารแห่งเกมคอนโซล
บางทีการพัฒนาที่สำคัญที่สุดในการเข้ารหัสระบบคือการพัฒนาระบบกุญแจสาธารณะและส่วนตัว ก่อนหน้านี้คนที่เข้ารหัสข้อมูลจะต้องให้อัลกอริทึมการเข้ารหัสหรือ "คีย์" ให้กับผู้รับที่ต้องการ หากแฮ็กเกอร์ถูกดักจับพร้อมกับข้อมูลพวกเขาจะพบว่าการถอดรหัสข้อมูลนั้นง่ายกว่ามาก
ระบบที่ทันสมัยเกี่ยวข้องกับผู้รับการสร้างอัลกอริทึมไม่ใช่ผู้ส่ง ผู้รับสร้างพับลิกคีย์ที่แจ้งว่าควรเข้ารหัสข้อมูลอย่างไรและไพรเวตคีย์ที่เกี่ยวข้องที่ระบุว่าจะถอดรหัสการเข้ารหัสนั้นอย่างไร พวกเขาจัดหากุญแจสาธารณะให้ผู้ส่งจากนั้นเข้ารหัสข้อมูลตามที่ร้องขอ ณ จุดนี้เฉพาะผู้รับเท่านั้นที่สามารถถอดรหัสข้อมูลได้
Windows XP และผู้สืบทอดมีการตั้งค่าที่ปรับแต่งได้สำหรับการเข้ารหัสระบบ สิ่งที่น่าสังเกตมากที่สุดคือ "เป็นไปตามมาตรฐาน FIPS" นี่คือมาตรฐานการประมวลผลข้อมูลของรัฐบาลกลางซึ่งเป็นชุดของกฎที่ต้องปฏิบัติตามในระบบคอมพิวเตอร์ที่ใช้โดยหน่วยงานของรัฐบาลกลาง กฏเกณฑ์กำหนดให้อัลกอริทึมการเข้ารหัสแต่ละรายการได้รับการอนุมัติให้ใช้งานภายใต้มาตรฐาน
