คอนโทรลเลอร์มอเตอร์สเต็ปเปอร์เป็นวงจรไฟฟ้าที่ใช้ส่งข้อมูลไปยังไดรฟ์สเต็ปเปอร์ซึ่งควบคุมการทำงานของสเต็ปเปอร์มอเตอร์ คอนโทรลเลอร์มอเตอร์อาจรวมอยู่ในการออกแบบไดรฟ์เวอร์ ในบางกรณีไดรเวอร์มอเตอร์สเต็ปจะถูกโปรแกรมด้วยชุดคำสั่งเริ่มต้นที่ไม่เปลี่ยนแปลง ไดรเวอร์เหล่านี้เป็นรูปแบบของคอนโทรลเลอร์มอเตอร์แบบสแตนด์อโลน ในกรณีอื่น ๆ การเขียนโปรแกรมของไดรเวอร์จะถูกเปลี่ยนแปลงโดยคอนโทรลเลอร์มอเตอร์แยกต่างหากเพื่อสร้างการเคลื่อนไหวที่หลากหลาย
ตัวควบคุมมอเตอร์สเต็ปส่งสัญญาณพัลซิ่งไปยังไดรเวอร์สเต็ปเปอร์ คำสั่งสัญญาณสามารถป้อนโดยผู้ควบคุมอุปกรณ์หรืออาจเป็นชุดคำสั่งที่ตั้งโปรแกรมไว้ สัญญาณนี้ถูกตีความเป็นคำสั่งโดยผู้ขับขี่และส่งไปยังมอเตอร์โดยการเพิ่มหรือลดพลังงานของขดลวด
ข้อได้เปรียบของการใช้ตัวควบคุมสเต็ปมอเตอร์แทนที่จะเป็นไดรเวอร์แบบสแตนด์อะโลนนั้นอยู่ในการควบคุมเพิ่มเติมของฟังก์ชั่นของมอเตอร์ ในขณะที่ไดรฟเวอร์สเต็ปเปอร์เบื้องต้นควบคุมจำนวน จำกัด ฟังก์ชั่นคอนโทรลเลอร์มอเตอร์สเต็ปสามารถจัดการการเคลื่อนไหวในระดับที่กว้างขึ้น สามารถใช้ Microstepping, การควบคุมหลายแกนและฟังก์ชั่นอื่น ๆ ได้ด้วยการใช้ตัวควบคุมมอเตอร์ นอกเหนือจากการควบคุมทิศทางของการเคลื่อนไหวแล้วคอนโทรลเลอร์ของมอเตอร์ยังลงทะเบียนและควบคุมความเร็วและระยะทางที่แน่นอนของการเคลื่อนไหว
ในบางกรณีมีการใช้ตัวควบคุมหลายแกน คอนโทรลเลอร์มอเตอร์ชนิดนี้ช่วยให้สามารถควบคุมมอเตอร์หลายตัวได้จากจุดเดียว คอนโทรลเลอร์ stepper มอเตอร์ขั้นสูงเหล่านี้ใช้ในงานที่ต้องการการควบคุมการเคลื่อนไหวแบบซิงโครไนซ์อย่างแม่นยำ ด้วยความสามารถในการควบคุมการทำงานของมอเตอร์หลายตัวในคราวเดียวคอนโทรลเลอร์เหล่านี้สามารถสร้างการเคลื่อนที่ของของไหลที่จำเป็นสำหรับอุปกรณ์การผลิตที่มีความแม่นยำ
สเต็ปเปอร์มอเตอร์และไดรเวอร์มีให้เลือกทั้งแบบไบโพลาร์และยูนิโพลมอเตอร์ เมื่อใช้งานชุดควบคุมมอเตอร์ผู้ควบคุมจะต้องจับคู่กับมอเตอร์และประเภทของไดรเวอร์ที่เหมาะสม ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างทั้งสองประเภทคือจำนวนการพันขดลวดสำหรับแต่ละขั้นตอน
สเต็ปเปอร์มอเตอร์แบบ Unipolar มีขดลวดสองขดสำหรับแต่ละขั้นตอนเนื่องจากกระแสไฟฟ้าเคลื่อนที่ในทิศทางเดียวเท่านั้น สเต็ปปิ้งมอเตอร์ประเภทนี้ต้องการให้ผู้ขับขี่เปิดใช้งานขดลวดคู่แทนที่จะเป็นขดลวดเดี่ยวต่อขั้นตอน มอเตอร์สเต็ปเปอร์แบบสองขั้วช่วยให้กระแสไฟฟ้าไหลทั้งสองทิศทางผ่านขดลวดเส้นเดียวในแต่ละขั้นตอน ไดรเวอร์มอเตอร์สเต็ปปิ้งที่ใช้กับมอเตอร์ประเภทนี้จะต้องเปิดใช้งานหนึ่งขดลวดสำหรับขั้นตอนเดียว ตัวควบคุมมอเตอร์สเต็ปรับผิดชอบในการส่งสัญญาณคนขับเพื่อเปิดใช้งานขดลวดที่ในที่สุดก็สร้างการเคลื่อนไหวที่ต้องการ
