ไบโอดีเซลเป็นสารที่คล้ายกับน้ำมันดีเซลที่มีส่วนประกอบของปิโตรเลียมยกเว้นผลิตจากแหล่งพืชเช่น microalgae และ coconuts แทนที่จะเป็นปิโตรเลียม ในขณะที่ไบโอดีเซลสามารถเกิดขึ้นเองตามธรรมชาติในบางสถานการณ์ แต่สถานการณ์เหล่านี้หายากและอาจใช้เวลาเป็นปี ๆ เครื่องปฏิกรณ์ไบโอดีเซลจะลดระยะเวลาและทำให้กระบวนการกึ่งอัตโนมัติหรือแบบอัตโนมัติเพื่อให้สามารถสร้างไบโอดีเซลในเชิงพาณิชย์ได้ หน่วยปฏิกรณ์ไบโอดีเซลมีสองประเภทหลักคือแรงเฉือนและคลื่นอัลตราโซนิก ทั้งสองทำงานกับไบโอดีเซลในรูปแบบต่าง ๆ แต่ทั้งคู่นำไปสู่การสร้างไบโอดีเซลจำนวนมากโดยมีงานเพียงเล็กน้อยในส่วนของผู้ปฏิบัติงานเครื่องปฏิกรณ์
ไบโอดีเซลทั้งหมดเริ่มเป็นวัตถุดิบจากพืช วัตถุดิบบางอย่าง ได้แก่ สาหร่าย, มะพร้าวและน้ำมันพืชที่ใช้แล้วหรือบริสุทธิ์ จากนั้นเครื่องปฏิกรณ์ไบโอดีเซลจะทำงานบนวัตถุดิบเพื่อทำให้เกิดปฏิกิริยาเคมีที่เรียกว่า ในกระบวนการนี้วัตถุดิบจะถูกแยกออกเป็นสองสาร: กลีเซอรีนและเมทิลเอสเทอร์
กลีเซอรีนเป็นผลพลอยได้จากกระบวนการและเป็นแอลกอฮอล์หวาน หลังจากการผลิตกลีเซอรีนจะถูกใช้โดยอุตสาหกรรมอื่นเพื่อสร้างมอยเจอร์ไรเซอร์หรือสบู่ดังนั้นกลีเซอรีนจะไม่สูญเปล่าหรือถูกโยนทิ้งไป สารอื่น ๆ คือเมทิลเอสเตอร์เป็นชื่อทางเคมีของไบโอดีเซล ในขั้นตอนนี้ไบโอดีเซลจะถูกกลั่นเพิ่มเติมเพื่อสร้างเชื้อเพลิงชีวภาพอื่น ๆ ผสมกับน้ำมันดีเซลเพื่อสร้างการผสมผสานของน้ำมันดีเซลที่ให้ทั้งความยั่งยืนและการใช้งานในอุณหภูมิเย็นหรือใช้ทันทีโดยไม่ต้องผสมหรือประมวลผลเพิ่มเติม
เครื่องปฏิกรณ์ไบโอดีเซลแบบอุลตร้าโซนิคใช้คลื่นอุลตร้าโซนิคเพื่อทำฟองสบู่ไบโอดีเซล ฟองถูกผลิตและยุบเนื่องจากคลื่นอัลตราโซนิกทำให้เกิดปฏิกิริยาจากความร้อนและความดันที่ทำให้ transesterificate วัตถุดิบ เครื่องปฏิกรณ์ไบโอดีเซลแบบอุลตร้าโซนิกมักจะใช้สำหรับความต้องการขนาดใหญ่หรือเชิงพาณิชย์เนื่องจากยูนิตเหล่านี้มีเวลาในการสร้างไบโอดีเซลในปริมาณที่น้อย หน่วยเหล่านี้มีแนวโน้มที่จะต้องใช้งานน้อยลงจากผู้ปฏิบัติงานและทำงานที่ความเร็วอัตโนมัติมากกว่าเครื่องปฏิกรณ์แรงเฉือน
เครื่องปฏิกรณ์ไบโอดีเซลแบบเฉือนใช้ในห้องปฏิบัติการที่ต้องการไบโอดีเซลจำนวนเล็กน้อยสำหรับการทดสอบสามารถใช้ในบ้านโดยบุคคลที่มีคุณสมบัติและสามารถนำไปใช้ในเชิงพาณิชย์ได้ หน่วยเหล่านี้ใช้ความร้อนและลดขนาดหยดของวัตถุดิบไบโอดีเซลเพื่อทำให้เกิดการเปลี่ยนรูป โดยปกติไบโอดีเซลจะใช้เวลาประมาณ 30 นาทีถึงสี่ชั่วโมงในการทำ หน่วยเหล่านี้ต้องการงานเพิ่มเติมจากผู้ปฏิบัติงาน แต่หน่วยงานนั้นมีความหลากหลายมากขึ้นเกี่ยวกับการสร้างผลตอบแทนที่แตกต่างกันและทำงานได้ดีขึ้นกับวัตถุดิบที่เป็นของแข็ง
