ไบโอดีเซลเป็นน้ำมันดีเซลที่ผลิตจากส่วนประกอบอินทรีย์เช่นไขมันจากสัตว์น้ำมันบริสุทธิ์หรือน้ำมันปรุงอาหารใช้แล้วและพืชหลายชนิด Microalgae biodiesel ใช้สาหร่ายชนิดหนึ่งที่เรียกว่า microalgae เป็นวัตถุดิบ ไบโอดีเซลประเภทนี้มีข้อดีหลายประการเช่นการสร้างรูปแบบดีเซลที่ยั่งยืนและลดการปล่อยก๊าซคาร์บอน นอกจากนี้ยังมีข้อเสียเช่นต้องการที่ดินเพิ่มเพื่อสร้างสาหร่ายและประสิทธิภาพที่น่าสงสัย
สาหร่ายมีสองชนิดคือสาหร่ายและสาหร่าย ความแตกต่างที่ใหญ่ที่สุดระหว่างสองสิ่งนี้มีขนาดเล็กลงเนื่องจาก macroalgae วัดเป็นนิ้วหรือเซนติเมตรในขณะที่ microalgae เป็นเซลล์เดียวหรือประกอบด้วยเซลล์เพียงเซลล์เดียว แม้จะมีสาหร่ายขนาดใหญ่ แต่ก็ไม่ได้ใช้สำหรับไบโอดีเซล นี่เป็นเพราะน้ำมันที่มีส่วนประกอบของสาหร่ายไม่เหมาะสมสำหรับการสร้างไบโอดีเซล สาหร่ายขนาดเล็กเท่านั้นที่มีน้ำมันที่เหมาะสมสำหรับการผลิตไบโอดีเซล
พืชที่มีการตีอย่างแรงบางชนิดที่ใช้ในการสร้างไบโอดีเซลนั้น ได้แก่ สบู่ดำมะพร้าวและน้ำมันปาล์ม สบู่ดำสร้างน้ำมัน 202 แกลลอน (764 ลิตร) ต่อเอเคอร์ (376 เมตร 4 ), มะพร้าวให้ผลผลิต 287 แกลลอน (1.08 กิโลกรัม) ต่อเอเคอร์, และน้ำมันปาล์มทำให้ 636 แกลลอน (2.4 กิโลกรัม) ต่อเอเคอร์ Microalgae แคระทั้งหมดนี้โดยผลิตจาก 6,283 แกลลอนเป็น 14,641 แกลลอน (23.7 กิโลกรัมถึง 55.4 กิโลกรัม) ต่อเอเคอร์
ผลผลิตที่สูงนี้ไม่เพียงทำให้สาหร่ายไบโอดีเซลมีความยั่งยืนเท่านั้น แต่ยังหมายถึงการปลูกพืชให้น้อยลงเพื่อให้ได้ผลผลิตไบโอดีเซลที่มีขนาดใหญ่ สาหร่ายขนาดเล็กยังสามารถเติบโตได้เกือบทุกที่ดังนั้นจึงไม่จำเป็นต้องมีทุ่งนาหรือพื้นที่พิเศษในการเพาะเลี้ยงสาหร่าย สาหร่ายขนาดเล็กยังสามารถดูดซับการปล่อยก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์ซึ่งจะช่วยลดการปล่อยก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์ในทุกที่ที่สาหร่ายเติบโต
แม้ว่าสิ่งนี้จะทำให้ไบโอดีเซลของสาหร่ายน่าดึงดูด แต่ก็มีข้อเสียบางประการในการเปลี่ยนมาใช้น้ำมันดีเซลชนิดนี้ ในการสร้างไบโอดีเซลให้เพียงพอสำหรับการบริโภคทั่วโลกพื้นที่เพาะปลูกจะต้องถูกแปลงเป็นการปลูกสาหร่ายขนาดเล็กและจำเป็นต้องมีพื้นที่เพาะปลูกมากขึ้นเพื่อตอบสนองความต้องการที่เพิ่มขึ้นของน้ำมันดีเซล Microalgae ยังให้ไนโตรเจนออกไซด์ได้มากกว่าดีเซลที่ใช้ปิโตรเลียม ในฐานะที่เป็นไบโอดีเซลไบโอalgaeไบโอดีเซลไม่สามารถขนส่งผ่านทางท่อ ทำได้โดยบรรทุกโดยรถบรรทุกหรือรางเท่านั้นซึ่งจะเป็นการเพิ่มต้นทุน
เมื่อรวมกับสิ่งนี้ไบโอดีเซลของสาหร่ายขนาดเล็กจะไหลไม่ดีที่อุณหภูมิต่ำและไม่ทำงานได้ดีที่อุณหภูมิต่ำเพราะมันจะข้น ประสิทธิภาพโดยรวมของไบโอดีเซลสาหร่ายขนาดเล็กก็ลดลงเช่นกัน ซึ่งหมายความว่าการประหยัดน้ำมันเชื้อเพลิงจะได้รับผลกระทบในทางลบด้วยเนื่องจากประสิทธิภาพการใช้พลังงานลดลงและจึงจำเป็นต้องมีไบโอดีเซลจากสาหร่ายขนาดเล็กจำนวนมากเพื่อใช้เป็นมอเตอร์
