การเลือกน้ำยาฆ่าเชื้อแผลโดยทั่วไปแล้วเป็นเรื่องของการตรวจแผลและเลือกวิธีการรักษาที่มีความแข็งแรงและสม่ำเสมอ ปัจจุบันมีน้ำยาฆ่าเชื้อแผลหลายสิบชนิดที่แตกต่างกันตั้งแต่การรักษาแบบสเปรย์ไปจนถึงน้ำยาฆ่าเชื้อตามธรรมชาติเช่นน้ำผึ้ง อายุและความไวต่อผิวหนังของผู้ป่วยอาจเป็นปัจจัยสำคัญในการเลือกน้ำยาฆ่าเชื้อที่เป็นแผล ตัวอย่างเช่นครีมที่รุนแรงมากสำหรับผิวที่บอบบางอาจทำอันตรายมากกว่าดี ไม่ควรได้รับบาดเจ็บสาหัสที่บ้าน แต่จะต้องใช้ผ้าสะอาดเช็ดทำความสะอาดและส่งถึงแพทย์หรือช่างเทคนิคโดยเร็วที่สุด
การพิจารณาประเภทของการบาดเจ็บเป็นหนึ่งในส่วนที่สำคัญที่สุดในการเลือกน้ำยาฆ่าเชื้อที่เป็นแผล ตัวอย่างเช่นสเปรย์ทรีทเม้นอาจถูกนำไปใช้กับรอยถลอกที่ตื้นและถลอก โดยทั่วไปบาดแผลและแผลควรได้รับการรักษาด้วยน้ำยาฆ่าเชื้อที่มีความหนาคล้ายเจลแทน ไม่ควรให้ยาฆ่าเชื้อที่มีบาดแผลหยดลงในบาดแผลโดยตรงและบาดแผลเนื่องจากสามารถฆ่าเซลล์ซ่อมแซมภายในบาดแผลและชะลอเวลาในการรักษา ร่างกายอาจมีปฏิกิริยาไม่ดีต่อน้ำยาฆ่าเชื้อทำให้เกิดการติดเชื้อภายในแผล
น้ำยาฆ่าเชื้อบาดแผลที่ดีที่สุดบางตัวที่ใช้กับบาดแผลที่ลึกกว่านั้นคือทำให้ผิวนวลหนา สิ่งเหล่านี้สามารถแพร่กระจายไปรอบ ๆ ขอบของแผลโดยไม่มีอันตรายมากที่พวกเขาจะวิ่งหรือหยดลงในพื้นที่เปิด การใช้การรักษาที่หนาขึ้นด้วยวิธีนี้จะช่วยฆ่าเชื้อโรคที่ติดเชื้อบนผิวหนังบริเวณที่ได้รับบาดเจ็บ ควรครอบคลุมพื้นที่เพื่อส่งเสริมความชุ่มชื้นและช่วยซ่อมแซมผิวตัวเองได้เร็วขึ้น
แผลไหม้ต้องใช้น้ำยาฆ่าเชื้อที่อ่อนโยนและอ่อนโยน โดยทั่วไปแล้วกรดบอริกจะอ่อนโยนพอที่จะนำไปใช้กับเยื่อเมือกในร่างกายและมักจะลดการอักเสบและทำให้ผิวหนังเย็นลง น้ำผึ้งยังเป็นน้ำยาฆ่าเชื้อแผลที่อ่อนโยนมาก การวิจัยแสดงให้เห็นว่ามันช่วยฆ่าเชื้อแบคทีเรียที่เป็นอันตรายบนและรอบ ๆ แผลในขณะที่ชุ่มชื่นบริเวณที่ได้รับบาดเจ็บ ผู้ที่มีผิวแพ้ง่ายเช่นเด็กหรือผู้สูงอายุอาจได้รับประโยชน์จากการใช้กรดบอริกหรือน้ำผึ้งเป็นยาฆ่าเชื้อแผล
อายุและความไวก็มีบทบาทสำคัญในการเลือกน้ำยาฆ่าเชื้อที่เป็นแผล ยกตัวอย่างเช่นการถูแอลกอฮอล์และไอโอดีนควรหลีกเลี่ยงหากผู้ป่วยอายุน้อยมากอายุมากหรือมีแนวโน้มที่จะเป็นโรคเรื้อนกวางและผิวหนังระคายเคือง สารละลายเจือจางของน้ำกลั่นและไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ 3% มักจะทำงานได้ดีในกรณีเหล่านี้ ผู้ที่มีผิวบอบบางมากอาจไม่สามารถใช้น้ำยาฆ่าเชื้อได้เลย สำหรับผู้ป่วยดังกล่าวอาจเป็นการดีที่สุดที่จะล้างพื้นที่เบา ๆ ด้วยสบู่อ่อน ๆ และเคลือบด้วยปิโตรเลียมเจลลี่และผ้าพันแผล
