การรักษาถุงน้ำที่มีหนองมักจะเกี่ยวข้องกับการประคบด้วยความอบอุ่นกับพื้นที่และอาจใช้ยาปฏิชีวนะ ถุงที่มีหนองเกิดจากการติดเชื้อแบคทีเรียที่สามารถติดต่อได้สูงและแพร่กระจายไปยังผู้อื่นหรือไปยังสถานที่ต่าง ๆ ในร่างกาย โดยทั่วไปแล้วถุงน้ำจะรักษาอย่างช้า ๆ เว้นเสียแต่ว่าหนองจะไหลไปตามธรรมชาติหรือถูกระบายโดยแพทย์ ถุงที่มีหนองบางครั้งเรียกว่าฝีและสามารถปรากฏที่ใดก็ได้ในร่างกายรวมถึงปาก
ควรประเมินซีสต์กับหนองโดยผู้เชี่ยวชาญด้านสุขภาพที่สามารถแนะนำแผนการรักษาที่มีประสิทธิภาพ การเยียวยาที่บ้านสำหรับการรักษาถุงด้วยหนองรวมถึงการประคบร้อนบนพื้นที่หลายครั้งต่อวัน สิ่งนี้จะช่วยเร่งความเร็วในการรักษาและยังกระตุ้นให้ถุงน้ำไหลออก ไม่แนะนำให้พยายามบีบถุงด้วยหนองหรือพยายามเอาไปแทงที่บ้านเพราะจะช่วยเพิ่มความเสี่ยงในการแพร่เชื้อได้อย่างมาก
ยาปฏิชีวนะเฉพาะที่หรือในช่องปากมักจะถูกกำหนดให้รักษาถุงที่มีหนอง บางครั้งผู้ให้บริการด้านสุขภาพจะกำหนดทั้งสองอย่างร่วมกันโดยเฉพาะอย่างยิ่งถ้าถุงน้ำลึก นอกจากนี้สีและลักษณะของหนองไม่ใช่ตัวบ่งชี้ชนิดหรือความรุนแรงของการติดเชื้อเนื่องจากซีสต์ที่มีหนองขาวจำนวนน้อยสามารถติดเชื้อได้เหมือนกันกับซีสต์ที่มีหนองสีเข้มและหนาจำนวนมาก
สีของหนองในถุงโดยทั่วไปช่วงจากสีขาวเป็นสีน้ำตาลเข้มกับสีของสีเหลืองและสีเขียวในระหว่าง หนองสีชมพูหรือสีแดงเข้มสามารถเกิดขึ้นได้และสิ่งนี้จะเกิดขึ้นเมื่อเลือดผสมกับหนอง นอกจากยาปฏิชีวนะผู้ให้บริการดูแลสุขภาพอาจแนะนำสบู่ต้านเชื้อแบคทีเรีย สุขอนามัยที่ละเอียดถี่ถ้วนเป็นสิ่งสำคัญอย่างยิ่งเมื่อสัมผัสถุงน้ำที่ติดเชื้อเพื่อป้องกันการแพร่กระจาย ควรล้างมือให้สะอาดก่อนและหลังการสัมผัสเชื้อและควรประคบร้อนทุกครั้งหลังการใช้งาน
บางครั้งถุงที่มีหนองอาจรุนแรงจนทำให้เกิดอาการระบบ สิ่งเหล่านี้อาจรวมถึงไข้หนาวสั่นคลื่นไส้และปวดเมื่อยตามร่างกาย นอกจากนี้ยังมีอาการปวดศีรษะเวียนศีรษะและอ่อนเพลีย ผู้ให้บริการดูแลสุขภาพจะต้องได้รับการแจ้งเตือนทันทีเมื่อระบบหรือทั่วร่างกายอาการเกิดขึ้นเพื่อหลีกเลี่ยงความเสี่ยงของการติดเชื้อในเลือด


