Metronidazole มีประสิทธิภาพในการรักษาอาการลำไส้ใหญ่เมื่อเกิดสภาวะเนื่องจากสิ่งมีชีวิตที่ไวต่อยาต้านการติดเชื้อนี้ การวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการของตัวอย่างอุจจาระสามารถบอกแพทย์ว่ามีสิ่งมีชีวิตอยู่หรือไม่ ลำไส้ใหญ่อักเสบคือการอักเสบของลำไส้ใหญ่มักเรียกว่าลำไส้ใหญ่ บุคคลที่ประสบกับโรคนี้มีอาการท้องอืดและบวมพร้อมกับความเจ็บปวดและอุจจาระที่ปรากฏเป็นสีดำหรือมีเลือด อาการอื่น ๆ ได้แก่ มีไข้หนาวสั่นและร่างกายขาดน้ำเนื่องจากการสูญเสียน้ำ
ผู้ให้บริการด้านสุขภาพมักจะกำหนด metronidazole สำหรับอาการลำไส้ใหญ่อักเสบที่เกิดจากเชื้อจุลินทรีย์ ได้แก่ Clostridium difficile, Giardia lamblia และ Helicobacter pylori หลังการบริโภคร่างกายจะเปลี่ยนแปลงยาต้านจุลชีพนี้เพื่อให้โมเลกุลซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์จุลินทรีย์ เมื่อเข้าไปในสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวโปรตีนในเซลล์จะทำงานในสูตรทำให้เกิดการสร้างอนุมูลอิสระ ปฏิกิริยาเคมีนี้รบกวนการทำงานของเซลล์ปกติและยับยั้งการจำลองแบบทำให้เซลล์ตาย
ขึ้นอยู่กับสิ่งมีชีวิตเฉพาะ metronidazole มีขนาดตั้งแต่ 250 มิลลิกรัมถึง 750 มิลลิกรัมนำมารับประทานในรูปแบบแคปซูลหรือแท็บเล็ตสองถึงสี่ครั้งต่อวันนานสูงสุด 10 วัน ผู้ป่วยที่รับประทานยา metronidazole ในลำไส้ใหญ่ไม่ควรดื่มเครื่องดื่มแอลกอฮอล์หรืออาจมีอาการปวดศีรษะคลื่นไส้และอาเจียน ผู้ผลิตยังแนะนำให้บุคคลที่ละเว้นจากการบริโภคเครื่องดื่มแอลกอฮอล์ถึงสามวันหลังจากเสร็จสิ้นการกําหนด ยาต้านจุลชีพยังช่วยเพิ่มผลของยาทำให้ผอมบางเลือด การใช้ยา metronidazole กับยาที่ถูกเผาผลาญโดยตับมักจะกำจัดยาออกจากร่างกายเร็วเกินไปหรือยับยั้งกระบวนการกำจัดปกติ
ผู้ผลิตไม่รับประกันความปลอดภัยของ metronidazole สำหรับอาการลำไส้ใหญ่บวมในสตรีมีครรภ์หรือให้นมบุตรเนื่องจากความเป็นไปได้ที่ทารกอาจพัฒนาการเกิดและการเจริญเติบโตบกพร่อง ผลข้างเคียงที่พบบ่อย ได้แก่ การสูญเสียความอยากอาหารปวดศีรษะคลื่นไส้และการติดเชื้อยีสต์ บางคนพบกับรสชาติที่เป็นโลหะและไม่ค่อยมีผู้ป่วยที่มีผื่นที่ผิวหนัง อาการไม่พึงประสงค์ที่รุนแรงยิ่งขึ้น ได้แก่ อาการชักและความเสียหายของเส้นประสาทที่แสดงว่ามึนงงหรือรู้สึกเสียวซ่าในแขนขา ผู้ป่วยบางรายอาจพัฒนาโรคไข้สมองอักเสบหรือเยื่อหุ้มสมองอักเสบในขณะที่ใช้ metronidazole สำหรับอาการลำไส้ใหญ่บวม
นอกจาก colitis การใช้ metrodinazole รวมถึงการติดเชื้อที่ใดก็ได้ในร่างกายที่เกิดจากแบคทีเรียที่ไม่ใช้ออกซิเจนเฉพาะสิ่งมีชีวิต amebic หรือจุลินทรีย์โปรโตซัว การติดเชื้อทางเพศสัมพันธ์ที่เรียกว่า Trichomoniasis และเกิดจากสิ่งมีชีวิตที่มีชื่อเดียวกันนั้นสามารถรักษาได้ด้วย metrodinazole พร้อมกับครีมทาเจลหรือโลชั่นบางครั้งแพทย์สั่งจ่ายยาเพื่อรักษาสิว rosacea และช่องคลอดอักเสบจากเชื้อแบคทีเรีย เจลยังสามารถใช้สำหรับจ๊อคคันหรือสภาพผิวที่เรียกว่ารูขุมขน
