โดยทั่วไปจะปลอดภัยที่จะมีคลองรากฟันในระหว่างตั้งครรภ์ คลองรากฟันเกี่ยวข้องกับการกำจัดเส้นประสาทและเยื่อกระดาษที่เสียหายออกจากฟันของผู้ป่วย บ่อยครั้งรังสีเอกซ์ที่ผู้หญิงอาจต้องการก่อนระหว่างหรือหลังคลองรากฟันเป็นแหล่งที่มาของความกังวลในระหว่างตั้งครรภ์ แต่มักไม่แสดงถึงความเสี่ยงที่สำคัญ ผู้หญิงมักจะกังวลเกี่ยวกับยาที่ใช้ในการทำให้มึนงงปากสำหรับคลองรากฟัน แต่พวกเขาก็มักจะปลอดภัยเช่นกัน นอกจากนี้ผู้หญิงไม่จำเป็นต้องกังวลเกี่ยวกับสารเคมีที่ใช้ในการชลประทานหรือเรซินที่นำมาใช้ในคลองรากเนื่องจากพวกเขามักไม่เป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์ที่กำลังพัฒนา
หลายคนคิดว่าการมีคลองรากฟันในระหว่างตั้งครรภ์นั้นอันตรายและควรหลีกเลี่ยงเมื่อเป็นไปได้ อย่างไรก็ตามความจริงก็คือว่ามันมักจะปลอดภัยที่จะมีคลองรากฟันในระหว่างตั้งครรภ์ ที่จริงแล้วการมีคลองรากฟันอาจช่วยปกป้องสุขภาพของลูกน้อยที่กำลังพัฒนา นี่เป็นเพราะความจริงที่ว่าฟันที่ไม่แข็งแรงสามารถติดเชื้อได้หากไม่ถูกรักษา การติดเชื้อชนิดนี้มีศักยภาพที่จะรุนแรงมากจนส่งผลกระทบต่อส่วนอื่น ๆ ของร่างกาย แต่การรักษาฟันช่วยกำจัดความเสี่ยงนี้
ความกังวลหลักของผู้หญิงเกี่ยวกับการมีคลองรากฟันในระหว่างตั้งครรภ์อาจเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับรังสีเอกซ์ อย่างไรก็ตามในกรณีส่วนใหญ่ความเสี่ยงต่อการพัฒนาเด็กมีน้อย รังสีเอกซ์ที่จำเป็นสำหรับการรักษาคลองรากฟันมีวัตถุประสงค์เพื่อที่ปากของผู้หญิงมากกว่าที่หน้าท้องของเธอซึ่งพวกเขาสามารถส่งผลกระทบต่อลูกน้อยของเธอ นอกจากนี้ทันตแพทย์มีแนวโน้มที่จะให้เสื้อกั๊กตะกั่วที่ผู้หญิงสามารถใช้เพื่อป้องกันหน้าท้องของเธอหากเธอต้องการรังสีเอกซ์ในระหว่างตั้งครรภ์ ถึงกระนั้นก็ตามทันตแพทย์มักจะแนะนำให้ผู้หญิงรอให้มีการเอ็กซเรย์ตามปกติจนกระทั่งหลังคลอด เฉพาะผู้ที่จำเป็นอย่างยิ่งสำหรับคลองรากฟันหรือกระบวนการทางทันตกรรมอื่น ๆ เท่านั้นที่จะดำเนินการในระหว่างตั้งครรภ์
เท่าที่เกี่ยวข้องกับยาและสารเคมีที่ใช้ในระหว่างคลองรากส่วนใหญ่ถือว่าปลอดภัย ยาที่ใช้ในการมึนปากระหว่างคลองรากมักจะไม่ผ่านรกหรือเป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์ที่กำลังพัฒนา ของเหลวที่ใช้ในการชำระล้างปากของผู้ป่วยอาจมีโซเดียมไฮโดรคลอไรด์หรือสารเคมีที่คล้ายกัน แต่ปริมาณที่ใช้สำหรับคลองรากฟันมักจะน้อยเกินไปที่จะส่งผลเสียต่อทารกในครรภ์ เช่นเดียวกันเรซินที่ใช้ในระหว่างขั้นตอนของคลองรากฟันมักจะไม่เป็นภัยคุกคามต่อสุขภาพของทารก
