เพื่อลดความเสี่ยงในการแพร่โรคควรใช้เข็มฉีดยาเพียงครั้งเดียวและผ่านการฆ่าเชื้อก่อนนำมาใช้อีกครั้งเพื่อให้จุลินทรีย์หรือโรคไม่ผ่านระหว่างผู้ป่วย เข็มฉีดยาควรถูกกระโจนลงไปในขวดยาหนึ่งขวดแล้วสอดเข้าไปในคนหรือสัตว์ก่อนที่มันจะถูกถอดชิ้นส่วนและฆ่าเชื้อ วิธีที่ดีที่สุดในการฆ่าเชื้อเข็มฉีดยาคือการได้รับความร้อนสูงแม้ว่าจะมีสารเคมีจำนวนหนึ่งที่สามารถใช้ในการฆ่าเชื้อเข็มฉีดยาเมื่อไม่สามารถเข้าถึงอุปกรณ์ที่เหมาะสมได้
วิธีที่ดีที่สุดในการทำหมันเข็มฉีดยาคือการใช้เครื่องจักรที่รู้จักกันในชื่อ autoclaves ซึ่งมักพบในโรงพยาบาลและห้องปฏิบัติการซึ่งใช้ในการฆ่าเชื้ออุปกรณ์ต่าง ๆ เข็มฉีดยาแก้วซึ่งไม่ค่อยได้ใช้อีกต่อไปสามารถนำไปใส่ในเครื่องเหล่านี้และให้ความร้อนถึงอุณหภูมิ 248 องศาฟาเรนไฮต์ (120 องศาเซลเซียส) เป็นเวลา 15 ถึง 20 นาที เข็มฉีดยาพลาสติกอาจได้รับความเสียหายในความร้อนนี้และมักจะถูกออกแบบให้ทิ้งหลังจากใช้งานครั้งเดียว เข็มที่ใช้ฉีดยาสามารถนำไปวางในเครื่องเหล่านี้เพื่อทำหมันและนำกลับมาใช้ใหม่ได้เช่นกัน สำนักงานหรือคลินิกเล็ก ๆ ของแพทย์ที่ไม่มีหม้อนึ่งความดันของตัวเองมักจะส่งเข็มฉีดยาที่ปนเปื้อนออกมาเพื่อทำหมันและกำจัดอย่างเหมาะสม
อุณหภูมิในหม้อนึ่งความดันสูงกว่าน้ำเดือดอย่างมีนัยสำคัญ ถึงกระนั้นหลอดฉีดยาแก้วที่ต้มก็เป็นวิธีหนึ่งในการฆ่าเชื้อด้วยเข็มฉีดยา วิธีนี้ไม่ได้ผลเท่าการใช้หม้อนึ่งความดันและสามารถแพร่กระจายโรคได้เนื่องจากไม่จำเป็นต้องฆ่าสปอร์ทั้งหมด วิธีนี้ควรใช้ในกรณีฉุกเฉินเท่านั้น ควรเติมแอลกอฮอล์ฟีนอลเล็กน้อยในน้ำเพื่อปรับปรุงการฆ่าเชื้อ เมื่อน้ำเดือดควรฉีดหลอดแก้วทิ้งไว้ประมาณ 15 ถึง 20 นาที
เข็มฉีดยาพลาสติกมักจะถูกออกแบบมาให้ทิ้งหลังจากใช้งานครั้งเดียว อย่างไรก็ตามสิ่งนี้สถานการณ์อาจเกิดขึ้นได้ซึ่งบุคคลนั้นจำเป็นต้องนำเข็มฉีดยากลับมาใช้ใหม่ หากเป็นกรณีนี้เคล็ดลับที่ดีที่สุดสำหรับการฆ่าเชื้อด้วยเข็มฉีดยาคือการล้างออกด้วยน้ำและสารฟอกขาว
เพื่อดำเนินการฆ่าเชื้อด้วยเข็มฉีดยาด้วยน้ำและสารฟอกขาวควรเติมเข็มฉีดยาครึ่งหนึ่งด้วยส่วนผสมและเขย่าอย่างแรงก่อนที่จะพ่นของเหลวออก กระบวนการนี้ควรทำซ้ำจนกว่าจะไม่พบร่องรอยของเลือดหรือยาในหลอดฉีดยาก่อนที่จะถูกล้างออกด้วยน้ำบริสุทธิ์หลายครั้ง สิ่งนี้จะไม่กำจัดไวรัสแบคทีเรียหรือสิ่งปนเปื้อนอื่น ๆ ทั้งหมดและควรดำเนินการในกรณีฉุกเฉินเมื่อไม่มีเข็มฉีดยาที่ผ่านการฆ่าเชื้อแล้วเท่านั้น
