มีการรักษาหลายอย่างสำหรับการติดเชื้อในไตซึ่งสามารถใช้เพื่อระบุสาเหตุและอาการของปัญหา ตัวเลือกที่ดีที่สุดสำหรับการรักษาการติดเชื้อเป็นหลักสูตรของยาปฏิชีวนะเพื่อฆ่าเชื้อแบคทีเรียที่รับผิดชอบ ผู้ที่ติดเชื้อซ้ำหรือเรื้อรังอาจต้องใช้ยาปฏิชีวนะเป็นระยะเวลานาน ๆ หรือแก้ไขปัญหาพื้นฐานที่ทำให้เกิดปัญหา หากผู้ป่วยมีอาการไม่สบายหรือเจ็บปวดเนื่องจากการติดเชื้อความร้อนหรือยาแก้ปวดอาจเป็นทางเลือกที่ดีที่สุดในการบรรเทา ผู้ป่วยบางรายอาจต้องการรวมการเยียวยาที่บ้านในการรักษาเช่นการดื่มน้ำปริมาณมากการทานวิตามินซีและการดื่มน้ำแครนเบอร์รี่
ยาปฏิชีวนะถือว่าเป็นสิ่งสำคัญที่สุดในการรักษาโรคไต อาจใช้ยาเช่น amoxicillin, levofloxacin หรือ cephalosporin เพื่อทำลายแบคทีเรีย แพทย์อาจเลือกใช้ยาปฏิชีวนะที่ต่อสู้กับแบคทีเรียหลากหลายชนิดหรือเขาหรือเธออาจทำการทดสอบปัสสาวะหรือเลือดเพื่อตรวจสอบแบคทีเรียเฉพาะที่ทำให้เกิดการติดเชื้อแล้วกำหนดหนึ่งที่มีเป้าหมาย โดยทั่วไปผู้ป่วยจะต้องใช้ยาเป็นเวลาหนึ่งสัปดาห์หรือมากกว่าเพื่อฆ่าแบคทีเรียทั้งหมดแม้ว่าอาการจะเริ่มชัดเจนภายในไม่กี่วัน ในกรณีของการติดเชื้อที่รุนแรงหรือซับซ้อนผู้ป่วยอาจต้องเข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลและให้ยาปฏิชีวนะทางหลอดเลือดดำ
บางคนมีการติดเชื้อในไตที่ไม่ชัดเจนกับการรักษาตามปกติหรือพวกเขาได้รับซ้ำแล้วซ้ำอีก การติดเชื้อเรื้อรังอาจต้องการการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะนานขึ้น ปัญหาที่เกิดซ้ำอาจบ่งบอกถึงปัญหาพื้นฐานเช่นความผิดปกติทางโครงสร้างของท่อปัสสาวะซึ่งควรได้รับการประเมินโดยผู้เชี่ยวชาญเพื่อพิจารณาว่าการผ่าตัดหรือการรักษาอื่น ๆ จำเป็นต้องแก้ไขหรือไม่
การรักษาอีกวิธีหนึ่งสำหรับการติดเชื้อในไตที่ผู้ป่วยส่วนใหญ่ต้องการคือการควบคุมความเจ็บปวดเนื่องจากมักจะทำให้รู้สึกไม่สบายอย่างมีนัยสำคัญ การใช้แผ่นความร้อนกับช่องท้องหรือหลังมักช่วยบรรเทาอาการปวด การใช้ยาเช่น acetaminophen หรือ NSAIDs ยังสามารถบรรเทาอาการปวดเช่นเดียวกับไข้ใด ๆ ที่อาจมีอยู่
การรักษาทางเลือกสำหรับการติดเชื้อในไตอาจช่วยผู้ป่วยบางราย การดื่มน้ำให้เพียงพอและของเหลวอื่น ๆ เป็นสิ่งสำคัญมากเนื่องจากจะช่วยล้างแบคทีเรียออกจากทางเดินปัสสาวะ โดยเฉพาะอย่างยิ่งน้ำแครนเบอร์รี่เป็นความคิดที่ช่วยล้างการติดเชื้อในไต ผู้ป่วยบางรายยังพบว่าการทานวิตามินซีเพิ่มเติมนั้นมีประสิทธิภาพ
