ผลข้างเคียงทั่วไปของการผ่าตัดโดยทั่วไปจะขึ้นอยู่กับชนิดของการผ่าตัดที่ทำ ระเหยของเยื่อบุโพรงมดลูก, การระเหยของการเต้นของหัวใจและการระเหยด้วยความร้อนเป็นบางส่วนของการผ่าตัดระเหยที่พบมากที่สุดและมีผลข้างเคียงที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้นที่เกี่ยวข้องกับแต่ละขั้นตอน ผลข้างเคียงเหล่านี้อาจรวมถึงตะคริวเลือดอุดตันและรอยช้ำ เช่นเดียวกับการผ่าตัดความเจ็บปวดรอยแดงบริเวณที่ผ่าตัดและการติดเชื้ออาจเป็นผลข้างเคียงของการระเหย
การผ่าตัดด้วยคลื่นความถี่เพิ่มขึ้นเนื่องจากความถี่ของการบุกรุกที่น้อยกว่า แม้ว่าจะมีผลข้างเคียงมากมายจากการระเหย แต่ผลข้างเคียงนั้นน้อยกว่าการผ่าตัดที่มีความยาวมาก ยกตัวอย่างเช่นการผ่าตัดเยื่อบุโพรงมดลูกแทนการผ่าตัดมดลูก การกู้คืนจากการผ่าตัดด้วยการระเหยจะน้อยกว่าขั้นตอนการรุกรานที่มากขึ้น
Endometrial Ablation เป็นขั้นตอนการผ่าตัดที่เยื่อบุโพรงมดลูกออกจากมดลูก ผลข้างเคียงที่พบบ่อยของการระเหยของ endometrium ได้แก่ ตกขาวตะคริวประจำเดือนและปัสสาวะบ่อย ผู้ป่วยยังอาจพบปัญหาการเจาะมดลูกหรือปัญหาลำไส้ซึ่งเป็นผลข้างเคียงที่พบได้น้อย เลือดออกรุนแรงปวดหลังส่วนล่างหรือตะคริวในช่องท้องอาจเป็นสัญญาณของภาวะแทรกซ้อนที่รุนแรงยิ่งขึ้นต่อการผ่าตัดและควรได้รับการแก้ไขโดยแพทย์ผู้เชี่ยวชาญ
การระเหยของหัวใจนำกล้ามเนื้อหัวใจที่ผิดปกติซึ่งอาจทำให้ผู้ป่วยมีภาวะหัวใจเต้นผิดจังหวะ ผู้ป่วยที่ได้รับการผ่าตัดประเภทนี้อาจได้รับผลข้างเคียงจากการระเหยของกล้ามเนื้อหัวใจเช่นเลือดอุดตันเลือดออกและภาวะใหม่ ผลข้างเคียงอื่น ๆ และที่อาจรุนแรงกว่าของการระเหยของหัวใจรวมถึงหลอดเลือดตีบปอดและการเจาะเนื้อเยื่อหัวใจรวมถึงเส้นเลือดและผนังของหัวใจ หายใจถี่, ไอของเลือดหรือเจ็บหน้าอกอาจเป็นสัญญาณของภาวะแทรกซ้อนที่ร้ายแรงและควรได้รับการดูแลจากแพทย์ผู้เชี่ยวชาญทันที
การระเหยด้วยความร้อนเป็นวิธีการทั่วไปในการกำจัดเส้นเลือดขอดที่ขาของผู้ป่วย อาการปวด, เลือดอุดตันและอาการฟกช้ำเป็นผลข้างเคียงที่พบบ่อยของการระเหยที่ใช้ในการรักษาเส้นเลือดขอด ผู้ป่วยบางรายอาจรู้สึกเหนื่อยหลังจากทำหัตถการ ผลข้างเคียงที่พบได้น้อยกว่าสำหรับผู้ป่วยบางรายคืออาการชาตามหน้าแข้ง
แม้ว่าความเสียหายที่หายากมากโรคหลอดเลือดสมองและเส้นประสาทได้รับผลข้างเคียงที่ร้ายแรงที่เกี่ยวข้องกับการผ่าตัดระเหย การศึกษาพบว่าคนส่วนใหญ่อาจเป็นผู้สมัครที่ดีสำหรับการระเหย ผู้ที่มีอาการแพ้อาหารความผิดปกติของการแข็งตัวของเลือดหรือการติดเชื้อที่เกิดขึ้นซ้ำ ๆ สามารถพูดคุยกับแพทย์เกี่ยวกับความเสี่ยงและผลประโยชน์ที่เกี่ยวข้องกับการผ่าตัดด้วยการระเหย


