บางส่วนของการรักษาที่ดีที่สุดสำหรับการติดเชื้อของเชื้อรารวมถึงการรักษาแบบ over-the-counter, การเยียวยาที่บ้านและยาต้านเชื้อราตามใบสั่งยาที่มีความแข็งแรง การรักษาที่แตกต่างกันอาจถูกใช้เพื่อรักษาโรคชนิดต่าง ๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพซึ่งอาจรวมถึงเท้าของนักกีฬาการติดเชื้อเล็บหรือการติดเชื้อยีสต์ การรักษาด้วยการติดเชื้อราอาจใช้เวลาเป็นส่วนใหญ่ต้องใช้เวลาหลายวันของการรักษาในขณะที่บางคนต้องการการรักษาเป็นเวลาหลายสัปดาห์เพื่อกำจัดการติดเชื้อ
การเยียวยาที่เคาน์เตอร์ขายยานั้นมีอยู่มากมายสำหรับการรักษาโรคติดเชื้อรา ในสหรัฐอเมริกาบางส่วนของสิ่งเหล่านี้เคยเสนอขายตามใบสั่งยาเท่านั้น การติดเชื้อราบ่อยครั้งควบคู่ไปกับการให้ความรู้สาธารณะในการรักษาโรคติดเชื้อเหล่านี้ทำให้ยาบางตัวได้รับการอนุมัติให้ซื้อโดยไม่ต้องมีใบสั่งยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งกรณีที่มีการรักษาด้วยการติดเชื้อยีสต์หลายชนิดที่มีขายทั่วไปในร้านค้าและร้านขายยาอเมริกัน
เป็นเวลาหลายศตวรรษที่บางคนได้รับการรักษาด้วยการติดเชื้อราที่บ้าน ตัวอย่างหนึ่งดังกล่าวรวมถึงการใช้น้ำส้มสายชูแอปเปิ้ลไซเดอร์กับเว็บไซต์ของการติดเชื้อซึ่งหลายคนอ้างว่ามีประสิทธิภาพโดยเฉพาะอย่างยิ่งในการรักษาเล็บหรือการติดเชื้อเล็บเท้า การรักษาโรคติดเชื้อจากเชื้อราในลักษณะที่ถือว่ามีความปลอดภัยค่อนข้างเช่นนี้โดยทั่วไปจะไม่มาพร้อมกับผลข้างเคียงใด ๆ ที่รู้จักกัน อย่างไรก็ตามวิธีนี้สามารถใช้เวลานานกว่าเพื่อให้ได้ผลลัพธ์ที่ต้องการกว่าการรักษาด้วยยาต้านเชื้อราอื่น ๆ
การติดเชื้อราบางตัวจะต้องได้รับการปฏิบัติอย่างจริงจังเพื่อป้องกันไม่ให้เชื้อราแพร่กระจาย ตัวอย่างเช่นนี้อาจเป็นกรณีที่รุนแรงของจ๊อคคันซึ่งบางครั้งก็มีลักษณะเป็นผื่นพองและมีอาการคันที่รุนแรง ในกรณีที่รุนแรงน้อยกว่าจ๊อคคันอาจปรับปรุงได้โดยใช้วิธีการรักษาแบบเดิม ๆ แต่กรณีที่รุนแรงกว่านั้นจำเป็นต้องได้รับการดูแลจากแพทย์ การติดเชื้อราที่รุนแรงเช่นนี้มักได้รับการรักษาด้วยครีมต้านเชื้อราที่มีความแข็งแรงตามใบสั่งแพทย์
การติดเชื้อราในคนที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอโดยเฉพาะอย่างยิ่งในคนที่ติดเชื้อเอดส์หรือเอชไอวีค่อนข้างรุนแรงและอาจเป็นอันตรายถึงชีวิตได้ ในขณะที่คนส่วนใหญ่ฟื้นตัวจากการติดเชื้อประเภทนี้โดยไม่มีผลกระทบใด ๆ แต่ไม่ได้รับการรักษา แต่การติดเชื้อสามารถนำไปสู่การติดเชื้อแบคทีเรียที่เป็นอันตรายได้ ผู้เชี่ยวชาญแนะนำให้บุคคลที่สงสัยว่าติดเชื้อของเชื้อราและผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกไม่ได้พยายามที่จะรักษาตัวเองด้วยการรักษาที่เคาน์เตอร์หรือการเยียวยาที่บ้าน แต่ผู้เชี่ยวชาญด้านสุขภาพแนะนำให้บุคคลดังกล่าวขอความสนใจจากแพทย์ทันทีเพื่อลดโอกาสที่การติดเชื้อจะแย่ลงและเพื่อให้แน่ใจว่าได้รับการรักษาและรักษาอย่างเหมาะสม
