มีหลายทางเลือกในการรักษาสำหรับผู้ที่ต้องการบรรเทาจากแผลเปื่อยที่เจ็บปวด ครีมทาหน้า, น้ำยาบ้วนปากและยาบางชนิดเป็นยารักษาแผลเปื่อยที่ใช้กันมากที่สุด ยารักษาแผลเปื่อยเหล่านี้ประกอบด้วยสเตอรอยด์และยาแก้ปวด นอกจากนี้แพทย์หลายคนรักษาแผลเปื่อยด้วยการบริหารอาหารเสริมเช่นสังกะสีและกรดโฟลิก
มีเฉพาะครีมที่ใช้ในการรักษาแผลเปื่อย ในหลายกรณียารักษาโรคปากนกกระจอกของสายพันธุ์นี้สามารถซื้อได้โดยไม่ต้องมีใบสั่งยาถึงแม้ว่าในบางกรณีจำเป็นต้องมีใบสั่งยา ครีมทาผิวบางชนิดมีเบนโซเคนซึ่งเป็นยาชาเฉพาะที่เหมาะสำหรับบรรเทาอาการปวดที่เกิดจากอาการปากนกกระจอก ครีมทาอื่น ๆ ที่มี amlexanox ซึ่งเป็นยารักษาแผลเปื่อยที่ช่วยลดระยะเวลาที่ใช้ในการรักษาแผล ในบางกรณีครีมทาผิวประกอบด้วยสารสเตียรอยด์ชนิดหนึ่งเรียกว่าฟลูโอซิโนไนด์ซึ่งทำหน้าที่ยับยั้งกระบวนการทางเคมีของร่างกายที่ทำให้เกิดการระคายเคืองผิวหนัง
ครีมทายอดนิยมชนิดหนึ่งที่มีสารละลายกรดซัลฟิวริกฟีนอลิก วิธีการแก้ปัญหานี้ทำให้แผลเปื่อยสามารถกำจัดเนื้อเยื่อที่ผิดปกติได้ การใช้วิธีแก้ปัญหาเฉพาะที่นี้อาจส่งผลให้เกิดการตายของโรคปากนกกระจอกภายในหนึ่งสัปดาห์
การบ้วนปากโดยทั่วไปนั้นกำหนดให้กับผู้ป่วยที่มีแผลเปื่อยมาก น้ำยาบ้วนปากมีสองประเภทที่ใช้บ่อย ปากล้างที่มี dexamethasone ซึ่งเป็นเตียรอยด์ที่ช่วยลดอาการบวมเป็นหนึ่งในตัวแปรของยารักษาแผลเปื่อยชนิดนี้ ตัวแปรอื่น ๆ ประกอบด้วยยาปฏิชีวนะที่รู้จักกันในชื่อ tetracycline ซึ่งเป็นวิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพสำหรับการติดเชื้อแบคทีเรีย ในขณะที่ tetracycline อาจลดเวลาในการรักษาและจำนวนความเจ็บปวดที่เกี่ยวข้องกับแผลเปื่อยได้อย่างมีประสิทธิภาพ แต่ก็อาจส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนสีของฟันในผู้ป่วยเด็กอย่างถาวรและทำให้ผู้ป่วยมีความเสี่ยงต่อการติดเชื้อ
ในหลายกรณียารักษาช่องปากที่สร้างขึ้นเพื่อรักษาอาการเจ็บป่วยที่ไม่เกี่ยวข้องมีประโยชน์เมื่อใช้เป็นยารักษาโรคปากนกกระจอก ตัวอย่างเช่นยารักษาโรคในช่องปากที่มีโดดเดี่ยวการรักษาที่แพร่หลายสำหรับอิจฉาริษยาเป็นวิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพสำหรับการลดระยะเวลาและความเจ็บปวดจากอาการเจ็บคอ นี่ก็เป็นจริงสำหรับ colchicine ยาโรคเกาต์ สเตียรอยด์ยังสามารถใช้เป็นยารักษาโรคปากเปื่อยที่มีประสิทธิภาพแม้ว่าพวกเขามักจะใช้เพื่อรักษาแผลที่ไม่ตอบสนองและต่อเนื่องที่รุนแรง
บางครั้งแทนที่จะใช้วิธีการทางการแพทย์แบบดั้งเดิมแพทย์ชอบที่จะรักษาแผลเปื่อยด้วยอาหารเสริม โดยทั่วไปเหล่านี้รวมถึงสังกะสีกรดโฟลิก cobalamin (B12) และเหล็ก หากสงสัยว่ามีการขาดสารอาหารเป็นสาเหตุของโรคปากนกกระจอกอาหารเสริมประเภทนี้สามารถพิสูจน์ได้ว่าเป็นวิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพ


