ปฏิกิริยาประเภทต่าง ๆ ต่อยาปฏิชีวนะรวมถึงผลข้างเคียงและอาการแพ้ โดยไกลปฏิกิริยาที่พบบ่อยที่สุดกับยาปฏิชีวนะคือผู้ที่เกี่ยวข้องกับผลข้างเคียงของระบบทางเดินอาหาร ผลข้างเคียงเหล่านี้รวมถึงอาการคลื่นไส้ท้องเสียปวดท้องและปวดท้อง ปฏิกิริยาทั่วไปต่อยาปฏิชีวนะในผู้หญิงคือการพัฒนาของการติดเชื้อในช่องคลอด เพื่อลดความเสี่ยงนี้ผู้ให้บริการด้านสุขภาพหลายคนแนะนำให้ทานอาหารเสริม acidophilus หรือรับประทานโยเกิร์ตที่มีวัฒนธรรมสด
เมื่อผู้ป่วยพัฒนาปฏิกิริยาต่อยาปฏิชีวนะเช่นลมพิษหายใจลำบากหรือเจ็บหน้าอกต้องรีบไปพบแพทย์ฉุกเฉิน ปฏิกิริยาเหล่านี้อาจรุนแรงและจำเป็นต้องได้รับการรักษาอย่างรวดเร็วเพื่อหลีกเลี่ยงภาวะแทรกซ้อนเช่นระบบทางเดินหายใจหรือหัวใจหยุดเต้น ปฏิกิริยาที่รุนแรงต่อยาปฏิชีวนะที่ผลิตอาการเหล่านี้มักจะได้รับการรักษาด้วยการฉีดอะดรีนาลีนหรือการบริหารของยาแก้แพ้
ผื่นที่ผิวหนังยังเป็นปฎิกิริยาทั่วไปต่อยาปฏิชีวนะ ผื่นสามารถผลิตสีแดง, แผล, อาการคันและการอักเสบของผิวหนัง เมื่อสิ่งนี้เกิดขึ้นผู้ให้บริการดูแลสุขภาพอาจแนะนำให้ใช้ยาปฏิชีวนะที่แตกต่างกันหรืออาจหยุดการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะทั้งหมด นอกจากนี้เขายังอาจแนะนำให้ใช้ยาแก้แพ้เฉพาะที่หรือในช่องปากเพื่อบรรเทาอาการผื่นที่เกิดจากยาปฏิชีวนะ
แม้ว่าปฏิกิริยาของยาปฏิชีวนะอาจเกิดขึ้นได้ แต่ก็มักจะไม่รุนแรงและชั่วคราว ยาปฏิชีวนะเป็นที่ยอมรับกันโดยทั่วไปในคนส่วนใหญ่และมีประสิทธิภาพในการป้องกันการติดเชื้อแบคทีเรียของไซนัส, ทางเดินปัสสาวะ, ระบบทางเดินหายใจและผิวหนัง เมื่อมีการสั่งยาปฏิชีวนะต้องสั่งยาทั้งหมดและผู้คนไม่ควรหยุดทานยาปฏิชีวนะเมื่อพวกเขาเริ่มรู้สึกดีขึ้น มีเพียงผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพเท่านั้นที่ควรตัดสินใจหยุดยาปฏิชีวนะ
ปฏิกิริยาต่อยาปฏิชีวนะอาจทำให้เกิดอาการทางระบบประสาทเช่นอาการปวดเส้นประสาทการรู้สึกเสียวซ่าหรือมึนงงในแขนขา เช่นเดียวกับปฏิกิริยาอื่น ๆ และผลข้างเคียงจากยาปฏิชีวนะผู้ให้บริการดูแลสุขภาพจำเป็นต้องได้รับการแจ้งเตือนทันทีเมื่อมีอาการทางระบบประสาทเกิดขึ้น ถึงแม้ว่าอาจจะร้ายแรง แต่ผลเหล่านี้มักจะเกิดขึ้นชั่วคราวและจะแก้ไขได้เมื่อการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะหยุด
ปฏิกิริยาจะสังเกตเห็นได้บ่อยขึ้นเมื่อได้รับยาปฏิชีวนะในช่องปาก, ทางหลอดเลือดดำหรือเข้ากล้ามเนื้อเมื่อเทียบกับยาปฏิชีวนะเฉพาะที่ ถึงแม้จะไม่ธรรมดา แต่ปฏิกิริยาต่อยาปฏิชีวนะเฉพาะที่อาจรวมถึงการระคายเคืองผิวหนังอาการแดงและบวม อาการคันและแผลไหม้อาจเกิดขึ้นได้และเมื่อเกิดปฏิกิริยาเหล่านี้ครีมยาปฏิชีวนะก็ควรถูกล้างออกทันทีและผู้ให้บริการดูแลสุขภาพจะได้รับแจ้ง ปฏิกิริยาของระบบอาจเกิดขึ้นได้ไม่บ่อยนักจากการใช้ยาปฏิชีวนะเฉพาะที่อย่างไรก็ตามมักจะเกิดขึ้นได้เมื่อทาครีมลงบนพื้นที่ขนาดใหญ่ของผิวหนัง
