มีกระบวนการรูทคลองสองประเภทที่แตกต่างกันซึ่งดำเนินการกับผู้ใหญ่ ครั้งแรกที่เกิดขึ้นเมื่อขั้นตอนการดำเนินการกับฟันเป็นครั้งแรก ขั้นตอนที่สองเกิดขึ้นเมื่อศัลยแพทย์ทางทันตกรรมต้องปฏิบัติตามขั้นตอนเดียวกันในฟันเดียวกัน ในบางกรณีเด็ก ๆ อาจต้องเข้ารับการผ่าตัดรักษารากฟัน
คลองรากฟันเป็นช่องว่างด้านในของฟันที่ยื่นลงไปจนถึงปลาย พื้นที่ด้านในของฟันยังเป็นที่รู้จักกันในนามห้องเยื่อกระดาษ ขั้นตอนจะดำเนินการในคลองรากฟันเมื่อการติดเชื้อหรือการสลายตัวมาถึงศูนย์กลางของฟัน ความเสียหายต่อฟันที่เปิดเผยประสาทอาจเป็นสาเหตุของขั้นตอนคลองรากฟัน
ขั้นตอนแรกของการขุดรากฟันเกิดขึ้นเมื่อฟันผ่านการรักษาหรือการบำบัดเป็นครั้งแรก ขั้นตอนมักจะเริ่มต้นเมื่อทันตแพทย์รักษาคลองรากฟันดำเนินการขั้นตอนคลองรากใช้ยาชาในท้องถิ่นเพื่อมึนงงบริเวณนี้ของด้านในของปาก ขั้นตอนนี้ตามด้วยทันตแพทย์ทำการเอ็กซเรย์ของฟันที่เสียหาย ทันตแพทย์อาจใช้เขื่อนยางเพื่อแยกมันออกจากฟันลิ้นและเหงือกโดยรอบ
ทันตแพทย์จะทำการเจาะรูในฟัน สำหรับคลองรากฟันด้านหลังหลุมเจาะลงไปด้านบนของฟัน สำหรับฟันหน้าหลุมจะถูกเจาะที่ด้านหลังเพื่อไม่ให้มองเห็นหลังการรักษา จากหลุมนี้ทันตแพทย์จะทำการลบเนื้อเยื่อที่เสียหายรวมถึงเส้นประสาท เมื่อเขาหรือเธอมั่นใจว่าฟันได้รับการทำความสะอาดอย่างสมบูรณ์แล้วเอ็นโดดอนต์ก็จะปิดผนึกฟัน
ขั้นตอนที่สองของรูทคลองนั้นค่อนข้างคล้ายกับขั้นตอนแรก ความแตกต่างหลักคือในขั้นตอนประเภทที่สองฟันเดียวกันจะทำงานอีกครั้ง ซึ่งอาจเสียค่าใช้จ่ายและเวลามากขึ้น ทันตแพทย์เอ็นโดดอนต์จะต้องทำความสะอาดฟันและลบการบรรจุออกจากขั้นตอนแรกจากนั้นเริ่มขั้นตอนอีกครั้ง
ขั้นตอนคลองรากฟันทารกเป็นสิ่งที่ดำเนินการกับเด็กเมื่อโพรงถึงจุดศูนย์กลางของฟันในปากของเขาหรือเธอ การผ่าตัดคลองรากฟันมีสองประเภท ขั้นตอนการ pulpotomy ต้องการผู้เชี่ยวชาญด้านทันตกรรมเพื่อลบเส้นประสาทออกจากศูนย์กลางของฟัน ขั้นตอนที่สองคือการทำเยื่อกระดาษซึ่งเป็นสิ่งที่ทันตแพทย์จะต้องกำจัดเส้นประสาททั้งหมดที่ทอดยาวจากจุดศูนย์กลางของฟันลงไปที่ราก


