ผลข้างเคียงจากยาฝังใต้ผิวหนังเป็นของหายากและก่อให้เกิดภัยคุกคามเพียงเล็กน้อยด้วยวิธีการที่ได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางว่าเป็นวิธีการคุมกำเนิดที่ปลอดภัยและน่าเชื่อถือ เช่นเดียวกับขั้นตอนการผ่าตัดใด ๆ ความเจ็บปวดเป็นหนึ่งในผลข้างเคียงของการทำหมันที่เป็นไปได้ซึ่งอาจเกิดการอักเสบและการติดเชื้อได้ ผลข้างเคียงของการทำหมันที่เป็นไปได้อื่น ๆ เช่นการลดลงของความใคร่หรือหย่อนสมรรถภาพทางเพศเป็นไปได้ แต่ก็เป็นเรื่องแปลกและสามารถรักษาได้ ผู้ชายบางคนพัฒนาปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันต่อสเปิร์มของตัวเองซึ่งอาจมีผลกระทบต่อสุขภาพของพวกเขา ผลข้างเคียงของการทำหมันที่รุนแรงที่สุดคือความคงทนของมัน ซึ่งแตกต่างจากวิธีการคุมกำเนิดอื่น ๆ การทำหมันเป็นมาตรการตลอดชีวิตและไม่ได้กลับรายการได้อย่างง่ายดาย
อาการปวดหลังผ่าตัดเป็นผลข้างเคียงที่น่าจะเกิดขึ้นมากที่สุด เว็บไซต์ของแผลจะเจ็บในวันหลังการผ่าตัด ความเจ็บปวดนี้จะบรรเทาลงภายในหนึ่งสัปดาห์และโดยปกติแล้วนักฆ่าความเจ็บปวดที่เคาน์เตอร์จะเพียงพอสำหรับการจัดการความเจ็บปวด
การติดเชื้อและการอักเสบเป็นผลข้างเคียงที่เป็นไปได้ทำหมันเช่นกัน คาดว่าจะมีอาการผื่นแดงและบวม แต่หากอาการเหล่านี้ไม่หายไปภายในหนึ่งสัปดาห์หรือหากมีอาการไข้ควรไปพบแพทย์ ผู้ชายคนนั้นอาจพัฒนาเป็น granuloma ซึ่งเป็นก้อนเล็ก ๆ ที่ไม่มีการสร้างขึ้นโดยการรั่วไหลของสเปิร์มจาก vas deferens ที่ถูกตัดขาดซึ่งสามารถทำให้เกิดการอักเสบและติดเชื้อในพื้นที่ได้ หากสงสัยว่ามีผลข้างเคียงของการทำหมันเหล่านี้แนะนำให้ปรึกษาแพทย์
ภูมิคุ้มกันต่อเซลล์อสุจิเป็นไปได้หลังจากทำหมันโดยมีผู้ชายบางคนผลิตแอนติบอดีที่เป้าหมายสเปิร์ม นักวิจัยได้ตั้งข้อกังวลว่าการโจมตีของร่างกายในเซลล์ของตัวเองอาจนำไปสู่เงื่อนไขอื่น ๆ ที่อาจร้ายแรงรวมถึงโรคข้ออักเสบ, หลอดเลือด, โรคหัวใจ, เบาหวาน, หลายเส้นโลหิตตีบและมะเร็ง ผลการศึกษายังสรุปไม่ได้และไม่มีการยืนยันความเชื่อมโยงระหว่างเงื่อนไขเหล่านี้กับการทำหมัน
ผู้ชายบางคนรายงานความสนใจทางเพศที่ลดลงและบางคนรายงานว่าสมรรถภาพทางเพศผิดปกติหลังทำหมัน อย่างไรก็ตามการทำหมันไม่ได้มีผลต่อระดับของการผลิตฮอร์โมนเทสโทสเทอโรนและไม่ส่งผลต่อความไวหรือการทำงานทางกายภาพใด ๆ ผลข้างเคียงที่เกี่ยวกับการทำหมันชายที่เกี่ยวกับแรงขับทางเพศและการหย่อนสมรรถภาพทางเพศมักจะเป็นอารมณ์ในธรรมชาติ
Vasectomies ไม่สามารถย้อนกลับได้ง่ายและควรดำเนินการเฉพาะกับผู้ชายที่มั่นใจว่าพวกเขาไม่ต้องการมีลูกเพิ่มอีก ในบางกรณีมีการพยายามกลับรายการ แต่ขั้นตอนไม่น่าเชื่อถือ บางคนเลือกเก็บน้ำอสุจิในธนาคารสเปิร์มในกรณีที่มีการเปลี่ยนแปลงของหัวใจ แต่นี่เป็นตัวเลือกที่แพง
แม้ว่าการทำหมันจะให้การคุมกำเนิดที่เชื่อถือได้มาก แต่ก็ไม่ได้ให้การป้องกันในระดับเดียวกันกับวิธีอื่น ยกตัวอย่างเช่น Vasectomies ไม่เสนอการป้องกันโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ใด ๆ ผู้สมัครทำหมันที่เหมาะคือชายคู่สมรสที่ตัดสินใจร่วมกับคู่ครองของเขาที่จะไม่มีลูกอีกต่อไป
