มีประเด็นและคำถามมากมายเกี่ยวกับจริยธรรมของยีนบำบัดโดยรอบ ยีนบำบัดเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงรายละเอียดทางพันธุกรรมของบุคคลซึ่งเป็นเหมือนชุดของคำแนะนำหรือพิมพ์เขียวสำหรับบุคคลที่ไม่ซ้ำกันนั้น หนึ่งในข้อกังวลทางจริยธรรมเกี่ยวข้องกับว่ามันถูกต้องตามกฎหมายหรือไม่ที่จะทำการเปลี่ยนแปลงดังกล่าวโดยเฉพาะอย่างยิ่งถ้าพวกเขาอาจส่งผลกระทบต่อคนรุ่นต่อไปในอนาคต ข้อกังวลอื่น ๆ เกี่ยวกับจริยธรรมของยีนบำบัดเกี่ยวข้องกับการประยุกต์ใช้เทคนิค หลายคนรู้สึกว่าเป็นที่ยอมรับได้ที่จะใช้เพื่อรักษาความผิดปกติที่เป็นอันตราย แต่ไม่ใช่เพื่อเพิ่มคุณสมบัติพื้นฐานของบุคคล นอกจากนี้ยังมีข้อกังวลเกี่ยวกับการเข้าถึงการรักษาที่มีราคาแพงเหล่านี้และความเสี่ยงของการถูกสงวนไว้สำหรับคนรวย
หนึ่งในความกังวลหลักเกี่ยวกับจริยธรรมของยีนบำบัดเกี่ยวข้องกับการมีอยู่ของการปฏิบัติตัวเองและไม่ว่าจะเป็นที่ยอมรับทางศีลธรรม การบำบัดด้วยยีนทุกประเภทเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงรายละเอียดทางพันธุกรรมของบุคคลอย่างถาวร การบำบัดด้วยยีนชนิดหนึ่งที่เรียกว่า germline ยีนทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงไปสู่ลูกหลานและลูกหลานในอนาคต ฝ่ายตรงข้ามของการฝึกแสดงการจองเกี่ยวกับความเสี่ยงของผลข้างเคียงระยะยาวที่ไม่รู้จักและปัญหาการพัฒนาสำหรับคนรุ่นอนาคตและเชื่อว่าจำเป็นต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมก่อนที่จะรับความเสี่ยงเหล่านี้ บางคนก็มีปัญหากับการบำบัดด้วยยีนในพื้นที่ทางศาสนาเพราะพวกเขามองว่าเป็นการดัดแปลงการออกแบบของพระเจ้า ผู้สนับสนุนการบำบัดด้วยยีนอ้างถึงศักยภาพมหาศาลในการช่วยชีวิตและกำจัดความผิดปกติทางพันธุกรรมและดูเหมือนว่าจะรู้สึกว่าผลตอบแทนคุ้มค่ากับความเสี่ยง
ข้อกังวลอย่างจริงจังอีกประการเกี่ยวกับจริยธรรมของยีนบำบัดคือมันมีศักยภาพที่จะถูกนำไปใช้ในทางที่ผิด บุคคลหลายคนยอมรับว่าสามารถเป็นประโยชน์ในการรักษาความผิดปกติที่เป็นอันตรายต่อชีวิต อย่างไรก็ตามมีข้อกังวลว่าสิ่งนี้อาจนำไปสู่การใช้เพื่อกำจัดความแตกต่างจากอุดมคติของสังคม บางคนมีความกังวลว่าการบำบัดด้วยยีนอาจเป็นจุดเริ่มต้นของพันธุวิศวกรรมเพื่อสร้างมนุษย์ที่“ สมบูรณ์แบบ” ข้อกังวลอีกประการหนึ่งคือการใช้ยีนบำบัดในทางที่ผิดเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของบุคคลดังนั้นการเปลี่ยนแปลงความสามารถเช่นสติปัญญาความเร็วหรือการประสานงาน นักวิจัยและสมาคมการแพทย์อเมริกันยอมรับว่าการใช้ยีนบำบัดเช่นนี้เป็นการละเมิดจริยธรรมและไม่ควรได้รับอนุญาต
นอกจากนี้ยังมีประเด็นเกี่ยวกับค่าใช้จ่ายในการรักษาที่เกี่ยวข้องกับจริยธรรมของยีนบำบัด เมื่อพิจารณาถึงลักษณะการทดลองของยีนบำบัดราคาแพงมากและมักจะไม่ครอบคลุมโดยประกันสุขภาพ ค่าใช้จ่ายทำให้การรักษาด้วยยีนบำบัดไม่สามารถเข้าถึงได้สำหรับบุคคลส่วนใหญ่เนื่องจากโดยทั่วไปจะมีราคาไม่แพงสำหรับคนรวยเท่านั้น มีความกังวลว่าการรักษาด้วยยีนอาจกลายเป็นการรักษาพิเศษที่สงวนไว้สำหรับชนชั้นสูงที่ร่ำรวยโดยที่คนอื่นปฏิเสธการเข้าถึง เพื่อให้สอดคล้องกับหลักจรรยาบรรณทางการแพทย์หลายคนในวงการแพทย์มีความมุ่งมั่นที่จะทำให้ทุกคนสามารถเข้าถึงได้โดยไม่คำนึงถึงสถานะทางเศรษฐกิจและสังคม
