คาร์บอนิลเหล็กเป็นอาหารเสริมที่ให้กับผู้ป่วยที่มีระดับธาตุเหล็กในเลือดไม่หมด ในกรณีส่วนใหญ่คนได้รับธาตุเหล็กเพียงพอจากอาหารที่พวกเขากินและบางกรณีที่ไม่รุนแรงของโรคโลหิตจางเหล็กสามารถรักษาได้ด้วยอาหาร หากผู้ป่วยไม่สามารถเพิ่มระดับธาตุเหล็กผ่านการควบคุมอาหารแพทย์อาจสั่งอาหารเสริมธาตุเหล็กเช่นเหล็กคาร์บอนิลตามระยะเวลาที่กำหนดเพื่อเพิ่มระดับธาตุเหล็ก
การใช้งานทั่วไปสำหรับอาหารเสริมนี้คือการเติมระดับธาตุเหล็กในกระแสเลือดของบุคคล ผู้ป่วยที่มีภาวะโลหิตจางจากการขาดธาตุเหล็กอาจมีอาการอ่อนเพลียอย่างรุนแรงและเรื้อรังและเด็กที่มีภาวะดังกล่าวจะมีอาการเจริญเติบโต ผู้ป่วยต้องการธาตุเหล็กที่เพียงพอในอาหารเพื่อให้ระดับธาตุเหล็กกลับคืนสู่ภาวะปกติเนื่องจากสภาพร่างกายไม่ได้แก้ไขเอง หากใช้เหล็กคาร์บอนิลเพื่อให้ระดับเหล็กอยู่ในระดับปกติผู้ป่วยสามารถหยุดรับได้เมื่อมีการเติมเหล็กโดยปกติหลังจากผ่านไปสองสามเดือน
นอกจากนี้ยังเป็นเรื่องปกติที่ผู้ป่วยจะได้รับเหล็กคาร์บอนิลเป็นอาหารเสริมในระหว่างตั้งครรภ์ ผู้หญิงที่ตั้งครรภ์หรือให้นมบุตรมักมีธาตุเหล็กในกระแสเลือดต่ำ แม้ว่าสำนักงานคณะกรรมการอาหารและยาแห่งสหรัฐอเมริกา (FDA) ยังไม่ได้ทำการศึกษาอย่างเป็นทางการเกี่ยวกับการใช้ธาตุเหล็กในผู้หญิงที่กำลังตั้งครรภ์ แต่อาหารเสริมจะได้รับตามปกติ การใช้เหล็กคาร์บอนิลไม่ส่งผลกระทบต่อระดับของธาตุเหล็กในน้ำนมแม่และปลอดภัยสำหรับผู้หญิงที่จะใช้ในขณะที่พยาบาลเด็ก
ในบางกรณีแพทย์อาจกำหนดเหล็กคาร์บอนิลเพื่อป้องกันการสูญเสียธาตุเหล็ก ผู้ป่วยที่มีเงื่อนไขทางการแพทย์บางอย่างหรือผู้ที่ใช้ยาบางอย่างอาจประสบการสูญเสียธาตุเหล็ก ผู้ป่วยเหล่านี้อาจได้รับธาตุเหล็กเสริมเพื่อความไม่ประมาท
ในทุกกรณีมันเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องใช้เหล็กคาร์บอนิลตรงตามที่แพทย์ การใช้ยาเกินขนาดอาจเป็นอันตรายและอาจนำไปสู่ความตาย มียาหลายชนิดที่สามารถโต้ตอบกันและมีเงื่อนไขทางการแพทย์บางประการที่ห้ามใช้ดังนั้นจึงเป็นเรื่องสำคัญที่ผู้ป่วยจะต้องหารือเกี่ยวกับการใช้ผลิตภัณฑ์เสริมธาตุเหล็กกับแพทย์ ไม่ใช่เรื่องปกติที่ผู้ป่วยจะต้องอยู่ในอาหารเสริมเหล็กคาร์บอนิลเป็นเวลานานแม้ว่าการใช้ยาเป็นเวลาหกเดือนหรือมากกว่านั้นเป็นเรื่องปกติ
