ผลข้างเคียงของ Glucosamine chondroitin นั้นค่อนข้างหายากและมักจะไม่รุนแรงเมื่อเกิดขึ้นแม้ว่าอาการเชิงลบใด ๆ ที่เริ่มต้นหลังจากทานยานี้ควรรายงานให้แพทย์ทราบเพื่อทำการประเมินทางการแพทย์ต่อไป ผลข้างเคียงของกลูโคซามีน chondroitin ที่รายงานบ่อยที่สุดบางอย่าง ได้แก่ การรบกวนระบบทางเดินอาหารอาการวิงเวียนศีรษะและปวดศีรษะ ผู้ป่วยเบาหวานอาจมีระดับน้ำตาลในเลือดสูงเมื่อใช้อาหารเสริมตัวนี้ ผลข้างเคียงที่รุนแรงที่อาจเกิดขึ้น ได้แก่ อาการหัวใจ, บวม, หรือความทุกข์ในทางเดินหายใจ คำถามหรือข้อสงสัยใด ๆ เกี่ยวกับผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้นของ glucosamine chondroitin ในแต่ละสถานการณ์ควรปรึกษาแพทย์หรือผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์อื่น ๆ
การรบกวนระบบทางเดินอาหารเป็นรายงานผลข้างเคียงของกลูโคซามีน chondroitin ที่พบมากที่สุด อาจมีอาการคลื่นไส้เล็กน้อยถึงปานกลางไม่ว่าจะอาเจียนหรือไม่ก็ตาม การทานยาหรืออาหารนี้กับนมอาจช่วยลดความรุนแรงของอาการนี้ได้ บางคนที่ทานอาหารเสริมนี้อาจมีอาการท้องเสียท้องผูกหรือการสลับระหว่างทั้งคู่ อิจฉาริษยาท้องอืดและท้องอืดเพิ่มขึ้นนอกจากนี้ยังมีรายงานโดยผู้ที่ใช้ยานี้
อาการปวดศีรษะเวียนศีรษะและอาการง่วงนอนเป็นผลข้างเคียงของกลูโคซามีน chondroitin ระดับน้ำตาลในเลือดสูงหรือที่เรียกว่าน้ำตาลในเลือดสูงบางครั้งอาจเกิดขึ้นในผู้ป่วยที่เป็นโรคเบาหวาน ผู้ที่มีภาวะระบบทางเดินหายใจเช่นโรคหอบหืดอาจสังเกตเห็นอาการเพิ่มขึ้นเมื่อทานยานี้ ในขณะที่ผลข้างเคียงเหล่านี้ส่วนใหญ่มักจะไม่รุนแรงอาการใด ๆ ที่ติดตาหรือน่ารำคาญควรปรึกษาแพทย์
ผลข้างเคียงของกลูโคซามีน chondroitin ที่รุนแรงยิ่งขึ้นซึ่งควรรายงานให้แพทย์ทราบทันที ได้แก่ อาการเจ็บหน้าอกหายใจลำบากหรือผมร่วงมาก ควรรายงานการบวมของมือและเท้าทันทีเช่นนี้อาจเป็นสัญญาณของการทำงานของไตที่ลดลง อาการบวมบนใบหน้าโดยเฉพาะอย่างยิ่งหากมาพร้อมกับปัญหาการหายใจหรือกลืนลำบากอาจบ่งบอกถึงปฏิกิริยาการแพ้ที่อาจเป็นอันตรายถึงชีวิตที่เรียกว่าภูมิแพ้ อาการปวดท้องที่เลียนแบบของกรดไหลย้อนควรได้รับการประเมินเพื่อให้แน่ใจว่าไม่มีภาวะแทรกซ้อนทางเดินอาหารที่ร้ายแรง
บางคนอาจไม่สามารถใช้ผลิตภัณฑ์เสริมอาหารกลูโคซามีน chondroitin ได้อย่างปลอดภัย หากผู้ป่วยเหล่านี้ตัดสินใจที่จะใช้ผลิตภัณฑ์เสริมนี้แนะนำให้ตรวจสอบทางการแพทย์อย่างใกล้ชิด ผู้ที่กำลังใช้ยาเช่นเลือดทินเนอร์หรือมีประวัติมีเลือดออกผิดปกติควรใช้ความระมัดระวังอย่างยิ่งเมื่อใช้อาหารเสริมตัวนี้ ผู้ป่วยที่มีอาการแพ้ต่อหอยควรหลีกเลี่ยงการใช้ผลิตภัณฑ์นี้เนื่องจากโดยทั่วไปแล้วจะใช้เปลือกหอยของสัตว์ทะเลเหล่านี้ สตรีมีครรภ์และผู้ที่ให้นมบุตรควรหลีกเลี่ยงยานี้
