จำนวนของภาวะแทรกซ้อนที่แตกต่างกันของการใส่ท่อช่วยหายใจเป็นไปได้ หากผู้ป่วยต้องการความช่วยเหลืออย่างเร่งด่วนในการหายใจพวกเขามักใส่ท่อช่วยหายใจโดยการใส่ท่อหายใจเข้าไปในปากซึ่งจะถูกส่งผ่านไปยังหลอดลม หลอดนี้มักจะเรียกว่าเป็นท่อช่วยหายใจ หลังจากใส่ท่อช่วยหายใจเครื่องช่วยหายใจสามารถสูบลมเข้าและออกจากปอด ภาวะแทรกซ้อนของการใส่ท่อช่วยหายใจสามารถเกิดขึ้นได้จากกระบวนการใส่ท่อเนื่องจากท่อสามารถทำลายระบบทางเดินหายใจหรือระบบทางเดินอาหาร ผู้ป่วยที่ใส่ท่อช่วยหายใจมีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นสำหรับการติดเชื้อเช่นปอดบวมและไซนัสอักเสบและการสนับสนุนการหายใจระยะยาวด้วยท่อช่วยหายใจอาจทำให้เกิดความเสียหายต่อระบบทางเดินหายใจทำให้การหายใจในอนาคตยากขึ้น
การสอดท่อเข้าไปในตัวอาจทำให้เกิดอันตรายกับผู้ป่วยในระหว่างขั้นตอนนี้ หลอดสามารถสร้างความเสียหายให้กับสายเสียงทำให้เกิดปัญหากับการพูดคุยหลังจากผู้ป่วยถูกนำออกจากเครื่องช่วยหายใจ ในบางครั้งหลอดสามารถผ่านเข้าไปในหลอดอาหารได้แทนที่จะเข้าไปในหลอดลมทำให้น้ำตาไหลลงในหลอดอาหาร สิ่งนี้อาจส่งผลให้มีเลือดออกภายในทางเดินอาหารและอาจทำให้เกิดปัญหากับการกลืนหลังจากถอดท่อช่วยหายใจออก
เมื่อเวลาผ่านไปและด้วยการดูแลผู้ป่วยที่ใส่ท่อช่วยหายใจอย่างไม่เหมาะสมทำให้เกิดการติดเชื้อในปอดที่เรียกว่าโรคปอดบวม บ่อยครั้งที่อาการนี้ซึ่งเป็นหนึ่งในภาวะแทรกซ้อนของการใส่ท่อช่วยหายใจเรียกว่าปอดอักเสบที่เกี่ยวข้องกับเครื่องช่วยหายใจ การติดเชื้อชนิดนี้พัฒนาขึ้นเนื่องจากปอดของผู้ป่วยที่ใส่ท่อช่วยหายใจมีการป้องกันน้อยกว่าเมื่อเทียบกับผู้ที่หายใจตามปกติเพราะมีการสูบลมเข้าไปในปอดโดยตรง หลายครั้งที่การติดเชื้อเหล่านี้ยากต่อการรักษาเพราะเกิดจากเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อยาในโรงพยาบาล
อีกโรคแทรกซ้อนของการติดเชื้อของการใส่ท่อช่วยหายใจคือไซนัสอักเสบอาการที่เกิดจากการอักเสบและการระคายเคืองของไซนัส ผลข้างเคียงนี้เกิดขึ้นเนื่องจากการระบายน้ำในโพรงไซนัสมักบกพร่องจากการมีท่อช่วยหายใจ ผู้ป่วยอาจมีหรือไม่มีอาการของการติดเชื้อนี้ มันเป็นสิ่งสำคัญทางคลินิก แต่เนื่องจากการติดเชื้อของโพรงไซนัสอาจทำให้เกิดไข้ การศึกษาภาพเช่นการสแกนเอกซ์เรย์คอมพิวเตอร์ (CT) จะทำการสแกนเพื่อระบุไซนัสอักเสบ
ผู้ป่วยที่ต้องอยู่บนเครื่องช่วยหายใจเป็นระยะเวลานานสามารถสัมผัสกับภาวะแทรกซ้อนอื่นของการใส่ท่อช่วยหายใจ การปรากฏตัวของหลอดพลาสติกจากปากไปยังปอดสามารถทำลายกระดูกอ่อนที่รองรับระบบทางเดินหายใจลดความสมบูรณ์ของโครงสร้าง ส่วนต่าง ๆ ของระบบทางเดินหายใจรวมถึงหลอดลมอาจแคบลงเนื่องจากการปรากฏตัวของหลอด เป็นผลให้ผู้ป่วยสามารถพัฒนาหายใจดังเสียงฮืด ๆ และหายใจถี่ ด้วยเหตุนี้ผู้ป่วยที่คาดหวังว่าจะต้องการความช่วยเหลือในการหายใจนานกว่าหนึ่งสัปดาห์มักถูกเปลี่ยนจากการใส่ท่อช่วยหายใจทางปากเป็นการใส่ท่อช่วยหายใจผ่านหลอดลม
