โปรหลักของการใช้ยาปฏิชีวนะสำหรับอาการปวดฟันคือการกำจัดของฟลอร่าฟันใด ๆ ที่อาจเติบโตในและรอบ ๆ ฟัน สิ่งนี้จะช่วยลดปริมาณความรู้สึกไม่สบายที่ผู้ป่วยรู้สึกเช่นเดียวกับการป้องกันปัญหาทางการแพทย์ที่เป็นไปได้มากมาย ในหลายกรณีมันเป็นวิธีที่คุ้มค่าที่สุดสำหรับการรักษาอาการปวดฟัน ข้อเสียของการใช้ยาปฏิชีวนะสำหรับอาการปวดฟันรวมถึงอาการแพ้ที่เป็นไปได้เลือดออกและปวดหัว ในบางกรณีผู้ป่วยรายงานว่ามีปัญหาการมองเห็นอาเจียนและปวดมากขึ้น
ทันตแพทย์หลายคนสั่งให้ยาแก้ปวดฟันหากปวดเกิดจากการติดเชื้อแบคทีเรีย การติดเชื้อหากปล่อยทิ้งไว้โดยไม่ถูกตรวจสามารถแพร่กระจายไปยังส่วนอื่น ๆ ของร่างกายรวมถึงสมอง หากสิ่งนี้เกิดขึ้นผู้ป่วยมีความเสี่ยงสูงในการพัฒนาสภาพทางการแพทย์ที่รุนแรงมากขึ้น ยาปฏิชีวนะสามารถกำจัดแบคทีเรียที่เป็นอันตรายทั้งในและรอบ ๆ ฟันและเหงือกอย่างสมบูรณ์ สิ่งนี้สามารถนำไปสู่การบรรเทาที่ยั่งยืนในไม่กี่วัน
นอกเหนือจากการบรรเทายาปฏิชีวนะมักจะเป็นทางเลือกที่ถูกกว่าการผ่าตัดทางทันตกรรม ผู้ป่วยสามารถหลีกเลี่ยงการถอนฟันที่ติดเชื้อหากใช้ยาปฏิชีวนะเป็นตัวเลือกที่เหมาะสม การรักษายังถือว่าเป็นตัวเลือกที่สะดวกกว่าการผ่าตัดเนื่องจากต้องใช้เวลาในการลงทุนน้อยกว่ามาก
เช่นเดียวกับยาอื่น ๆ การทานยาปฏิชีวนะเพื่อรักษาอาการปวดฟันมีข้อเสีย แพทย์มักจะถามผู้ป่วยเกี่ยวกับเงื่อนไขทางการแพทย์ที่มีมาก่อนหรือยาอื่น ๆ ที่ผู้ป่วยอาจใช้ก่อนที่จะเขียนใบสั่งยา ยาปฏิชีวนะสามารถมีปฏิสัมพันธ์ที่เป็นอันตรายกับยาอื่น ๆ ที่ก่อให้เกิดความเสียหายต่อผู้ป่วยมากกว่าดี เงื่อนไขบางอย่างแย่ลงโดยยาปฏิชีวนะเนื่องจากยาสามารถกำจัดแบคทีเรียที่ดีที่ป้องกันปัญหาร้ายแรงมากขึ้น ตัวอย่างเช่นการติดเชื้อยีสต์จะแย่ลงเมื่อใช้ยาบางชนิด โดยทั่วไปหญิงตั้งครรภ์ควรหลีกเลี่ยงยาปฏิชีวนะเนื่องจากยาอาจเป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์
ผลข้างเคียงเชิงลบของยาปฏิชีวนะอาจแตกต่างกันไปตามประเภทของยาเสพติด ตัวอย่างเช่น Amoxicillin เป็นที่ทราบกันดีว่าทำให้เกิดอาการท้องร่วงในผู้ป่วย ในทางตรงกันข้าม Penicillin อาจทำให้เกิดอาการคลื่นไส้และการพัฒนาของการเคลือบสีดำบนลิ้น ปฏิกิริยาการแพ้ยาปฏิชีวนะอาจทำให้เกิดอาการบวมในเหงือกซึ่งในทางกลับกันจะเพิ่มแรงกดดันต่อฟันที่ติดเชื้อและทำให้ผู้ป่วยรู้สึกไม่สบายมากขึ้น ยาปฏิชีวนะที่มีขนาดใหญ่อาจทำให้ตับหรือไตถูกทำลายในระยะยาว
