ผลข้างเคียงที่รายงานโดยทั่วไปของไนโตรกลีเซอรีน ได้แก่ ปวดศีรษะเวียนศีรษะและมึนศีรษะ หากใช้ไนโตรกลีเซอรีนในรูปแบบฉีดอาการอาจรวมถึงการระคายเคืองผิวหนังบริเวณที่ฉีด อาการคลื่นไส้และอาเจียนก็เป็นผลข้างเคียงที่พบบ่อยของไนโตรกลีเซอรีน ผลข้างเคียงที่รุนแรงมากขึ้นอาจรวมถึงการมองเห็นภาพซ้อนการพูดไม่ชัดหรือปฏิกิริยาแพ้ที่อาจเป็นอันตรายถึงชีวิตซึ่งเรียกกันว่าภูมิแพ้ คำถามหรือข้อกังวลใด ๆ เกี่ยวกับการตอบสนองต่อไนโตรกลีเซอรีนเป็นรายบุคคลควรปรึกษากับแพทย์หรือผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์อื่น ๆ
ไนโตรกลีเซอรีนเป็นยาที่ใช้รักษาอาการเจ็บหน้าอกและจัดการกับสภาพหัวใจที่หลากหลาย ผลข้างเคียงของยานี้มักจะไม่รุนแรงแม้ว่าอาการที่น่ารำคาญใด ๆ ที่เกิดขึ้นหลังจากรับไนโตรกลีเซอรีนควรรายงานไปยังแพทย์เพื่อรับการประเมินทางการแพทย์เพิ่มเติม ผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดของไนโตรกลีเซอรีน ได้แก่ อาการปวดหัวและเวียนศีรษะ อาการวิงเวียนศีรษะหรือวิงเวียนศีรษะที่เกี่ยวข้องกับการใช้ยานี้มักจะไม่รุนแรงและไม่คงอยู่นานกว่าสองสามชั่วโมง อย่างไรก็ตามอาการปวดหัวอาจรุนแรงและมักต้องใช้ยาตามใบสั่งแพทย์เพื่อบรรเทาอาการปวด
ในบางกรณีอาจให้ไนโตรกลีเซอรีนในรูปแบบของการฉีด การระคายเคืองผิวหนังเช่นสีแดงและบวมบริเวณที่ฉีดจะพบได้บ่อยและจะหายไปภายในไม่กี่ชั่วโมง แพทย์ควรประเมินอาการบวมบวมปวดหรือรอยแดงที่ยื่นออกมาจากบริเวณที่ฉีด อาจรู้สึกแสบร้อนใต้ลิ้นเล็กน้อยหากใช้ไนโตรกลีเซอรีนในรูปแบบลิ้น
ผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้นจากไนโตรกลีเซอรีนที่ผิดปกติทว่าอาจรวมถึงการมองเห็นไม่ชัดการพูดพร่ามัวหรือคลื่นไส้ การเต้นของหัวใจผิดปกติอาการเจ็บหน้าอกที่แย่ลงหรือเป็นลมควรได้รับการปฏิบัติอย่างเร่งด่วนเนื่องจากอาการเหล่านี้อาจบ่งบอกถึงปัญหาที่รุนแรงและอาจเป็นอันตรายถึงชีวิตด้วยหัวใจ จุดอ่อนหรือเท้าบวมหรือมือบวมอย่างรุนแรงควรรายงานให้ผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์ทราบทันที
Anaphylaxis เป็นหนึ่งในผลข้างเคียงของไนโตรกลีเซอรีนที่หายาก อาการมักมีผื่น ลมพิษ; และบวมของใบหน้าริมฝีปากหรือลำคอ การหายใจอาจเป็นเรื่องยากหรือเป็นไปไม่ได้และผู้ป่วยอาจหมดสติได้ ความช่วยเหลือทางการแพทย์ฉุกเฉินเป็นเรื่องเร่งด่วนหากสิ่งนี้เกิดขึ้นเนื่องจากการขาดออกซิเจนสามารถพิสูจน์ได้ว่าเป็นอันตรายถึงชีวิตภายในไม่กี่นาทีโดยไม่มีการแทรกแซงทางการแพทย์ทันที ต้องเข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลเกือบตลอดเวลาและอาจจำเป็นต้องได้รับการดูแลเช่นการรักษาด้วยออกซิเจนจนกว่าอาการของผู้ป่วยจะทรงตัว
