หนึ่งในวิธีหลักในการป้องกันโรคไข้เหลืองคือการได้รับวัคซีน แต่เช่นเดียวกับการฉีดวัคซีนส่วนใหญ่อาจมีผลข้างเคียง ผลข้างเคียงของวัคซีนไข้เหลืองที่พบมากที่สุดบางชนิดก็มีความอ่อนโยนเช่นอาการไข้หวัดการอักเสบบริเวณที่ฉีดและไข้ต่ำ ผลข้างเคียงที่รุนแรงมากขึ้น ได้แก่ การอาเจียนคอเคล็ดและอาการชัก นอกจากนี้บางคนอาจพบว่าพวกเขาแพ้ภูมิคุ้มกันโรคไข้เหลืองพัฒนาลมพิษบวมใบหน้าและหายใจลำบาก แม้จะมีผลกระทบด้านลบที่เป็นไปได้ แต่ผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์หลายคนบอกว่าความเสี่ยงที่จะเกิดจากไข้เหลืองนั้นรุนแรงกว่าผลข้างเคียงของวัคซีน
คนส่วนใหญ่ที่พัฒนาผลข้างเคียงของวัคซีนไข้เหลืองจะมีอาการของโรคไข้หวัดใหญ่ เหล่านี้มักจะรวมถึงอาการปวดหัวหนาวสั่นและปวดกล้ามเนื้อ ไข้ต่ำและไออาจเกิดจากการฉีดวัคซีนไวรัสไข้เหลือง การระคายเคืองใกล้บริเวณที่ฉีดอาจเกิดขึ้นได้เช่นกันเช่นมีรอยแดงบวมและปวดบริเวณนั้น ผลข้างเคียงของวัคซีนไข้เหลืองเหล่านี้ควรได้รับการพูดคุยกับแพทย์ แต่โดยทั่วไปจะไม่ได้รับการพิจารณาอย่างจริงจังและควรหายไปเอง
ผลข้างเคียงจากวัคซีนไข้เหลืองอื่น ๆ ต้องการการรักษาพยาบาลทันทีเนื่องจากพวกเขาไม่ได้ไปด้วยตัวเอง ตัวอย่างเช่นบางคนมีอาการตึงบริเวณหลังหรือคอรวมถึงอาเจียนและไม่สามารถปรับสมดุลได้ ความรู้สึกอาจอยู่ในความระส่ำระสายส่งผลต่อการมองเห็นและทำให้ดวงตาไวต่อแสงเช่นเดียวกับทำให้ยากต่อการพูด ผลลัพธ์เหล่านี้อาจนำไปสู่ปัญหาที่ร้ายแรงยิ่งขึ้นเช่นอาการชัก ผลข้างเคียงอื่น ๆ ส่งผลกระทบต่อจิตใจมากกว่าร่างกายเพราะการสูญเสียความจำการเปลี่ยนแปลงพฤติกรรมและความสับสนสามารถเกิดขึ้นได้หลังจากฉีดวัคซีนป้องกันโรคไข้เหลือง
ผู้ที่แพ้วัคซีนอาจสังเกตเห็นผลข้างเคียงที่แตกต่างจากประสบการณ์ของคนอื่น หนึ่งในสัญญาณที่เห็นได้ชัดเจนที่สุดของโรคภูมิแพ้คืออาการบวมของใบหน้าเช่นริมฝีปากและลิ้น ในบางกรณีคออาจบวมทำให้หายใจลำบากหลังจากฉีดวัคซีน ในขณะที่หนึ่งในผลข้างเคียงของวัคซีนไข้เหลืองที่พบมากที่สุดคือรอยแดงที่บริเวณที่ฉีดวัคซีนที่แพ้วัคซีนมักจะเป็นลมพิษทั่วร่างกายส่วนใหญ่ไม่ใช่เฉพาะบริเวณที่ฉีดวัคซีน อาการแพ้เหล่านี้รับรองว่าจะต้องพบแพทย์ทันทีโดยเฉพาะเมื่อหายใจลำบาก
