เอนไซม์เป็นโปรตีนที่ซับซ้อนที่ช่วยเร่งปฏิกิริยาทางเคมีของร่างกาย เอนไซม์บำบัดใช้ในการรักษาโรคเช่นโรคปอดเรื้อรังและหลายเส้นโลหิตตีบ ผลิตภัณฑ์เสริมอาหารและยารักษาโรคหลายชนิดมีเอนไซม์อย่างน้อยหนึ่งชนิด การใช้งานเพิ่มเติมรวมถึงการตรวจหาการปรากฏตัวของโรคความรุนแรงของโรคและการตรวจสอบการตอบสนองการรักษา
เอ็นไซม์นั้นพบได้แทบทุกที่จากทั้งพืชและสัตว์ อย่างไรก็ตามมีบางอย่างที่ไม่ได้ผลิตโดยร่างกายมนุษย์ที่จำเป็นสำหรับการทำงานบางอย่าง เซลลูเลสเป็นตัวอย่างสำคัญของสิ่งนี้ผลิตโดยพืชและช่วยในการย่อยอาหารเท่านั้น อะไมเลส, เปปซินและไลเปสเป็นเอนไซม์ย่อยอาหารอื่น ๆ ที่มักใช้ในอาหารเสริม
การกำหนดใช้ในยาป้องกันมีความสำคัญของการวิจัยและการศึกษาของเอนไซม์ต่าง ๆ เอนไซม์บำบัดพบว่ามีประโยชน์ในการรักษาชนิดของการอักเสบ การทำความสะอาดกระแสเลือดของเศษซากและการป้องกันการจับตัวเป็นก้อนที่ไม่เหมาะสมเป็นประโยชน์ของเอนไซม์โปรตีนบางชนิดเช่น nattokinase serrapeptase ยังเป็นที่รู้จักกันในนาม serratiopeptidase ให้การรักษาสภาพเช่นโรคไซนัสอักเสบเรื้อรังและโรค carpal อุโมงค์
หนึ่งในการใช้ต้นของเอนไซม์รักษาคือการยับยั้งหรือป้องกันการอุดตันของเลือดที่เกิดจากการผลิตไฟบรินมากเกินไป มันถูกพบว่าเมื่อ Streptokinase หรือเอ็นไซม์ที่คล้ายกันถูกจัดการในไม่ช้าหลังจากเริ่มมีอาการของกล้ามเนื้อหัวใจตายหรือโรคหัวใจวาย, ความเสียหายต่อหัวใจจะลดลง ปัญหารวมถึงศักยภาพในการเกิดปฏิกิริยาการแพ้และการสลายตัวของเอนไซม์อย่างรวดเร็วได้ยับยั้งการพัฒนาของการใช้เอนไซม์ในสภาพแวดล้อมการรักษา
ในช่วงหลายทศวรรษที่ผ่านมาการใช้เอนไซม์ในการรักษาพัฒนาขึ้นเมื่อนักวิจัยได้รับความเข้าใจเพิ่มเติมว่าระบบภูมิคุ้มกันระบบย่อยอาหารและระบบประสาททำงานร่วมกันอย่างไร คนที่ทุกข์ทรมานจากปัญหาที่ค่อนข้างน้อยเช่นการแพ้แลคโตสกับผู้ที่มีความผิดปกติอย่างรุนแรงเช่นออทิสติกอยู่ในหมู่ผู้ที่อาจได้รับประโยชน์จากเอนไซม์ในการรักษา เอนไซม์หรือเอนไซม์เฉพาะที่จำเป็นสำหรับการรักษาจะแตกต่างกันไปและควรพิจารณาผลข้างเคียงก่อนเริ่มการรักษา
การช่วยในการย่อยอาหารอาจเป็นการใช้งานเอนไซม์ที่แพร่หลายที่สุดในปี 2011 พวกเขาสามารถบรรเทาปัญหาที่เกิดจากการเจริญเติบโตของแบคทีเรียที่มากเกินไปหรือไม่เพียงพอในลำไส้ เอ็นไซม์ย่อยไฟเบอร์เช่นเซลลูเลสสามารถใช้ยับยั้งการเจริญของยีสต์แคนดิดา อาหารเสริมที่มีเอ็นไซม์จะถูกนำไปใช้ในการทำงานเช่นสลายไขมันเช่นในกรณีของไลเปสหรือเสริมสร้างสมรรถภาพทางจิต


