เนื้อเยื่อ microarrays หรือที่เรียกว่า TMAs เป็นตัวเลือกของแกนเนื้อเยื่อที่เตรียมในบล็อกพาราฟินและจัดเรียงในรูปแบบอาเรย์ที่แม่นยำ ส่วนเนื้อเยื่อวิทยาของอาเรย์สามารถตัดออกจากบล็อกพาราฟินส่งผลให้เนื้อเยื่อบางชิ้นของอาเรย์ที่เตรียมโดยพาราฟินสามารถวางบนสไลด์กล้องจุลทรรศน์ปกติได้ เนื้อเยื่อไมโครเรย์ใช้ในการทดสอบที่หลากหลายในตัวอย่างเนื้อเยื่อจำนวนมากที่อยู่ในสไลด์กล้องจุลทรรศน์เดียวซึ่งช่วยให้สามารถทำการทดลองได้อย่างรวดเร็วและแม่นยำ ยกตัวอย่างเช่นนักวิทยาศาสตร์มักใช้เนื้อเยื่อ microarrays เพื่อตรวจสอบการแสดงออกของยีนในปกติและเนื้อเยื่อทางพยาธิวิทยาเพื่อใช้พันธุศาสตร์ในการวินิจฉัยโรคต่างๆ
ห้องปฏิบัติการที่แตกต่างกันหลายแห่งซึ่งส่วนใหญ่เป็นงานวิจัยทางชีววิทยาและสุขภาพใช้เนื้อเยื่อไมโครเรย์เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความแม่นยำซึ่งพวกเขาสามารถทำการทดลองต่าง ๆ ในตัวอย่างเนื้อเยื่อ ยกตัวอย่างเช่น Immunohistochemistry เป็นกระบวนการที่สารเรืองแสงติดอยู่กับแอนติบอดีซึ่งสัมผัสกับตัวอย่างเนื้อเยื่อใน microarray แอนติบอดีผูกกับแอนติเจนที่จำเพาะในตัวอย่างเนื้อเยื่อและนักวิจัยสามารถระบุการจับนี้เนื่องจากตัวแทนเรืองแสง แอนติบอดีจำเพาะบางชนิดจะจับกับแอนติเจนที่จำเพาะดังนั้นระดับการจับสามารถให้ข้อมูลมากมายเกี่ยวกับแอนติเจนที่อยู่ในตัวอย่างเนื้อเยื่อที่กำหนด แอนติเจนต่างกันอาจมีอยู่ในเซลล์ปกติหรือพยาธิวิทยา; การเข้าใจความแตกต่างสามารถช่วยให้การวินิจฉัยโรคถูกต้องและอาจให้ข้อมูลที่สามารถใช้ในการหาวิธีรักษาโรคต่างๆ
เทคนิคที่คล้ายกันที่ใช้กันทั่วไปกับเนื้อเยื่อ microarrays เรียกว่า Fluorescent in situ hybridization หรือ FISH ใน FISH โพรบเรืองแสงจะจับกับส่วนต่าง ๆ ของโครโมโซมและสามารถใช้เพื่อค้นหาข้อมูลเกี่ยวกับการแต่งหน้าทางพันธุกรรมของแต่ละบุคคล ยกตัวอย่างเช่นวิธีนี้สามารถใช้เพื่อระบุเครื่องหมายทางพันธุกรรมสำหรับโรคต่างๆ ทั้ง FISH และ immunohistochemistry เป็นวิธีการที่ใช้กันทั่วไปในการวินิจฉัยและระบุการรักษาโรคมะเร็ง
ตัวอย่างเนื้อเยื่ออาจเป็นเรื่องยากที่จะได้รับในปริมาณที่มีนัยสำคัญและเนื้อเยื่อ microarrays มักจะใช้เวลาค่อนข้างนานในการเตรียมตัวดังนั้นนักวิจัยจะต้องแน่ใจว่าตัวอย่างของพวกเขายังคงไม่บุบสลายและเตรียมไว้อย่างถูกต้อง ตัวอย่างเช่นเนื้อเยื่อจะต้องดำเนินการอย่างรวดเร็วในพาราฟินเพื่อป้องกันการสลายตัว นักวิจัยบางคนเลือกที่จะซื้อ microarrays เนื้อเยื่อที่ทำไว้ล่วงหน้าแทนที่จะผลิตเองเพื่อหลีกเลี่ยงข้อผิดพลาดในขณะที่เตรียม microarrays เนื้อเยื่อของตัวเอง ข้อควรพิจารณาอีกประการคือจำนวนตัวอย่างที่จะวางบนสไลด์เดียว สามารถวางแกนเนื้อเยื่อจำนวนหลายร้อยแผ่นไว้ในสไลด์เดียว แต่อาจเป็นการยากที่จะติดตามและทดสอบตัวอย่างขนาดเล็กจำนวนมากได้อย่างแม่นยำ
