ไวรัสเอชไอวี (HIV) ซึ่งเป็นสาเหตุของโรคภูมิคุ้มกันบกพร่อง (AIDS) เป็นโรคที่ซับซ้อนในการควบคุม ยาต้านเชื้อเอชไอวีกำหนดลักษณะเฉพาะของไวรัส เมื่อไวรัสกลายพันธุ์ได้ง่ายลักษณะเหล่านี้สามารถเปลี่ยนแปลงได้และการดื้อต่อยาเอชไอวีสามารถเกิดขึ้นได้ อัตราการกลายพันธุ์ที่สูงหมายถึงบุคคลที่มีเชื้อ HIV ไม่ได้มีเชื้อไวรัสเพียงสายพันธุ์เดียว ไวรัส myriad ทุกสายพันธุ์มีคุณสมบัติแตกต่างกันไปและทุกอย่างมีศักยภาพที่จะปรับตัวเข้ากับยา
ไวรัสนี้ทำจากกรด ribonucleic และเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มไวรัสที่เรียกว่า retroviruses มันมีข้อมูลทางพันธุกรรมไม่เพียงพอที่จะทำซ้ำด้วยตัวเองดังนั้นจึงใช้เครื่องจักรของเซลล์โฮสต์ จีโนมของไวรัสผลิตผลิตภัณฑ์โปรตีนที่สำคัญ ยีนของไวรัสมีแนวโน้มที่จะกลายพันธุ์และการเปลี่ยนแปลงตามลำดับเหล่านี้สามารถผลิตผลิตภัณฑ์โปรตีนที่เปลี่ยนแปลง ผลิตภัณฑ์โปรตีนที่มีการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้มีความสำคัญในการต่อต้านยา
ยาเสพติดเอชไอวีกำหนดเป้าหมายไปยังพื้นที่เฉพาะบนอนุภาคไวรัสหรือบนผลิตภัณฑ์ทางพันธุกรรมของพวกเขา เป้าหมายยาสำคัญคือเอนไซม์ที่ผลิตโดยไวรัส ตัวอย่างเช่นส่วนสำคัญของการทำซ้ำ HIV คือเอนไซม์ reverse transcriptase เอนไซม์นี้ใช้เครื่องจักรของเซลล์โฮสต์ในการทำซ้ำตัวเอง เป้าหมายของเอนไซม์ที่สำคัญอีกประการหนึ่งคือโปรตีเอสซึ่งจะตัดโซ่โปรตีนของไวรัสที่มีความยาวเป็นผลิตภัณฑ์ที่มีประโยชน์เช่น transcriptase แบบย้อนกลับและโมเลกุลโครงสร้าง
ระบบกำหนดเป้าหมายยาที่มีประสิทธิภาพตัวหนึ่งผูกติดอยู่กับที่ทำงานของเอนไซม์และป้องกันไม่ให้ทำซ้ำ การกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมในจีโนมของไวรัสสามารถทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของไซต์ที่มีการเคลื่อนไหวนี้ ยาเสพติดนั้นอาจจะไม่สามารถผูกกับเว็บไซต์และป้องกันเอนไซม์
กลไกการดื้อยาต้านไวรัสเอชไอวีอีกอย่างหนึ่งคือการปรับเปลี่ยนโครงสร้างของยาเพื่อให้มันไร้ประโยชน์ ตัวอย่างเช่นยาอาจมีจีโนมของไวรัสเพื่อป้องกันไม่ให้ยีนแสดงออกและโปรตีนจากไวรัสที่จำเป็น การกลายพันธุ์ในจีโนมสามารถทำให้เว็บไซต์ที่มีผลผูกพันกับยาเสพติดจำไม่ได้ จีโนมกลายพันธุ์ยังสามารถผลิตเอนไซม์ที่สามารถเปลี่ยนโครงสร้างของยาที่ถูกผูกไว้ซึ่งสามารถทำให้ไม่เป็นอันตรายต่อการแสดงออกของยีน
สูตรการรักษาเอชไอวีโดยทั่วไปจะใช้ส่วนผสมของยาเพื่อควบคุมความก้าวหน้าของการติดเชื้อเอชไอวี แม้แต่ยาสามตัวหรือมากกว่านั้นก็ไม่สามารถกำจัดเชื้อแต่ละสายพันธุ์ที่มีอยู่ในผู้ติดเชื้อรายเดียวได้ การกลายพันธุ์ที่ป้องกันไม่ให้ยาออกฤทธิ์อาจมีอยู่ในสายพันธุ์ของไวรัสและเมื่อสายพันธุ์ที่ไวต่อเชื้อถูกฆ่าทิ้งสายพันธุ์ที่ดื้อต่อจะเข้ายึดครองและทวีคูณ
อนุภาคของไวรัสสองชนิดยังสามารถแลกเปลี่ยนวัสดุทางพันธุกรรมในขณะที่ทำซ้ำซึ่งเป็นไวรัสตัวใหม่ที่อาจต้านทานต่อยา การดื้อยาของเชื้อเอชไอวีสามารถพัฒนาได้ในผู้ติดเชื้อซึ่งเป็นที่รู้จักกันในชื่อการดื้อยาที่ได้รับหรือสามารถถ่ายทอดจากคนหนึ่งไปสู่อีกคนหนึ่ง การไม่ทำตามสูตรยาอย่างถูกต้องสามารถกระตุ้นให้เกิดการดื้อต่อยาได้


