Autotransplantation คือการปลูกถ่ายอวัยวะซึ่งผู้บริจาคก็เป็นผู้รับเช่นกัน การปลูกถ่ายจากคนอื่นเรียกว่า allotransplantaion รูปแบบที่พบบ่อยที่สุดของการปลูกถ่ายอัตโนมัติคือการปลูกถ่ายผิวหนัง ธนาคารแห่งเลือดที่จะใช้โดยบุคคลเดียวกันในภายหลังก็เป็นเรื่องธรรมดาเช่นกัน
การปลูกถ่ายอวัยวะอัตโนมัติครั้งแรกของมนุษย์คือการปลูกถ่ายผิวหนังในปีพ. ศ. 2366 ตั้งแต่นั้นมามีการปลูกถ่ายอวัยวะอัตโนมัติหลายครั้ง การปลูกถ่ายอัตโนมัติมีความเป็นไปได้ในการรักษาโรคเงื่อนไขและการบาดเจ็บมากมาย
ในบางกรณีของการผ่าตัดหัวใจชิ้นส่วนของหัวใจจะต้องได้รับการแก้ไขด้วยเนื้อเยื่อจากส่วนอื่น สิ่งนี้มักจะจำเป็นต้องปรับโครงสร้างของหัวใจ เนื้องอกและข้อบกพร่อง แต่กำเนิดของหัวใจเป็นสาเหตุที่พบบ่อยที่สุดสำหรับการผ่าตัดหัวใจประเภทนี้
การย้ายเส้นเลือดอัตโนมัติเป็นขั้นตอนทั่วไป การผ่าตัดบายพาสหัวใจเป็นตัวอย่างหนึ่งของการปลูกถ่ายหลอดเลือดดำอัตโนมัติ มันอาจจะถูกใช้เพื่อแทนที่ส่วนหนึ่งของหลอดเลือดดำที่เสียหายเช่นในกรณีของปากทาง
ธนาคารเลือดจากสายสะดือจะทำในกรณีที่ทารกควรพัฒนาโรคต่อไปในชีวิตที่สามารถรักษาได้โดยใช้เซลล์ต้นกำเนิดที่พบในเลือด หนึ่งในโรคดังกล่าวคือ Hodgkins lymphoma กระบวนการ autotransplant ชนิดนี้มีประสิทธิภาพในการรักษาโรคเลือดและไขกระดูก
การเปลี่ยนฟันอัตโนมัติอาจมีประโยชน์เช่นกัน หากฟันถูกกระแทกสามารถเคลื่อนย้ายจากตำแหน่งอื่นเพื่อแทนที่ได้ ความกังวลหลักเกี่ยวกับเรื่องนี้คือการจัดตำแหน่งที่เหมาะสมของการกัดหลังการผ่าตัด การปลูกถ่ายโดยอัตโนมัติทางทันตกรรมยังสามารถใช้เพื่อเติมช่องว่างที่เหลือจากฟันที่ไม่มีมา แต่กำเนิดซึ่งทำให้เกิดปัญหาเกี่ยวกับการกัด
ประโยชน์หลักของการเปลี่ยนถ่ายโดยอัตโนมัติเหนือการถ่ายโอนข้อมูลคือการยอมรับได้ง่าย ไม่จำเป็นต้องใช้สารกระตุ้นภูมิคุ้มกันซึ่งจะต้องดำเนินการในกรณีของ allotranplants แม้ว่าผู้บริจาคและผู้รับมีการจับคู่ที่ดีการปฏิเสธเนื้อเยื่ออาจเกิดขึ้น ธนาคารเลือดก่อนการผ่าตัดมักจะทำโดยผู้ที่มีกรุ๊ปเลือดที่หายากโดยเฉพาะและผู้ที่อาจไม่พบผู้บริจาคที่ตรงกัน นอกจากนี้ยังไม่มีโอกาสที่เนื้อเยื่อของผู้บริจาคจะติดเชื้อไวรัสเอชไอวีหรือไวรัสตับอักเสบเนื่องจากการผ่าตัดปลูกถ่าย
ความเสี่ยงที่สำคัญของการปลูกถ่ายโดยอัตโนมัติคือการติดเชื้อ การติดเชื้อเป็นความเสี่ยงในการผ่าตัดใด ๆ และความเสี่ยงจากการถอนขนด้วยตนเองจะลดลงเล็กน้อยเนื่องจากเนื้อเยื่อไม่ได้มาจากผู้บริจาคที่ไม่ระบุชื่อ ความเสี่ยงที่พบได้ทั่วไปน้อยกว่านั้นเกี่ยวข้องกับร่างกายที่รับเนื้อเยื่อ บางครั้งหลอดเลือดอาจไม่เข้ากับเนื้อเยื่อใหม่ ในกรณีนี้ต้องทำซ้ำขั้นตอน โดยทั่วไปความเสี่ยงของการถ่ายโอนอัตโนมัติอยู่ในระดับต่ำและผลลัพธ์ที่ได้ก็ดี
