Fluoroquinolone resistance เป็นคำที่ใช้ในการอ้างอิงถึงความจริงที่ว่าแบคทีเรียบางชนิดไม่ตอบสนองต่อการรักษาด้วย fluoroquinolone ซึ่งเป็นกลุ่มของยาปฏิชีวนะที่มี ciprofloxacin ในบางพื้นที่อาจมีบุคคลจำนวนมากที่ผู้ใช้ยา fluoroquinolone ไม่มีประสิทธิภาพต่อโรคติดเชื้อเช่น E. coli หรือเชื้อ Salmonella เจ้าหน้าที่สาธารณสุขบางคนเรียกร้องให้แพทย์ใช้ความระมัดระวังในการกำหนดยาบางชนิดเนื่องจากความกังวลเกี่ยวกับการพัฒนาศักยภาพของสายพันธุ์วัณโรคที่แสดงให้เห็นถึงการดื้อต่อ
ยาที่เรียกว่าฟลูออโรควิโนโลนเป็นยาปฏิชีวนะที่ใช้กันมากที่สุดทั้งในมนุษย์และยารักษาสัตว์ แหล่งข้อมูลบางแห่งระบุว่ามีการใช้ยาเหล่านี้อย่างแพร่หลายทางสัตวแพทย์ในประเทศยุโรป ยา fluoroquinolone เช่น ciprofloxacin มีประสิทธิภาพในการรักษาวัณโรคบางชนิดในมนุษย์
การเพิ่มขึ้นของความต้านทาน fluoroquinolone ทั่วโลกกล่าวกันว่าเป็นผลมาจากการใช้ยาประเภทนี้ที่ไม่เหมาะสมสำหรับเงื่อนไขที่รุนแรงน้อยกว่าเช่นหูชั้นกลางอักเสบหรือที่รู้จักกันทั่วไปว่าเป็นโรคหู ในบางกรณีแพทย์อาจสั่งยาฟลูออโรควิโนนเพื่อรักษาโรคติดเชื้อไวรัสซึ่งไม่ตอบสนองต่อยาปฏิชีวนะใด ๆ การใช้งานทั่วไปอีกอย่างที่สามารถนำไปสู่การดื้อต่อฟลูออโรควิโนโลนก็คือการรักษาโรคปอดอักเสบจากชุมชนด้วยยาเช่น
สำหรับแพทย์ผู้เชี่ยวชาญที่ปฏิบัติงานในพื้นที่ที่เชื่อว่ามีความต้านทานต่อฟลูออโรควิโนนสูงมาตรฐานการดูแลคือการใช้ความระมัดระวังเมื่อกำหนดฟลูออคควิโนโลนสำหรับผู้ป่วยที่มีอาการคล้ายโรคปอดบวม การปฏิบัตินี้ขึ้นอยู่กับความเป็นไปได้ที่อาการคล้ายปอดอักเสบอาจเกิดจากวัณโรคที่ไม่ได้รับการวินิจฉัย ในบางกรณีการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะเพียงครั้งเดียวด้วยยา fluoroquinolone อาจทำให้เกิดการดื้อต่อเชื้อวัณโรคในแต่ละบุคคล
Fluoroquinolones ถือเป็นยาปฏิชีวนะในวงกว้างที่มีประสิทธิภาพในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียในธรรมชาติที่รุนแรง ยาเหล่านี้เหมาะอย่างยิ่งสำหรับผู้ป่วยที่ป่วยหนักพอที่จะต้องเข้าโรงพยาบาล ข้อเสียอย่างหนึ่งของยาปฏิชีวนะในวงกว้างคือแนวโน้มที่จะนำไปสู่การพัฒนาสายพันธุ์แบคทีเรียที่ดื้อต่อยา แหล่งข้อมูลสาธารณสุขหลายแห่งแนะนำให้หลีกเลี่ยงการใช้ยา fluoroquinolone สำหรับการติดเชื้อเล็กน้อย
การเติบโตที่เป็นไปได้ของเชื้อวัณโรคที่ดื้อต่อฟลูออคควิโนโลนนั้นเป็นความกังวลในวงการแพทย์โลก เชื้อโรคชนิดอื่น ๆ อีกมากมายได้สร้างสายพันธุ์ที่ดื้อต่อยาเหล่านี้แล้ว เชื้อที่ดื้อยา ได้แก่ สเตรปโตคอกคัสและสแตฟฟิโลคอกคัสบางชนิด
