การผ่าตัดแปลงเพศตามเพศเป็นการผ่าตัดเฉพาะทางโดยศัลยแพทย์เฉพาะทางจำนวน จำกัด มันจะดำเนินการเมื่อผู้ป่วยต้องการที่จะนำเพศทางกายภาพของเขาหรือเธอให้สอดคล้องกับลักษณะเพศจิต ในกรณีของผู้ป่วยเพศชายผลของการทำศัลยกรรมจะทำให้ร่างกายของผู้ป่วยเป็นผู้หญิงและผู้ป่วยเพศหญิงสามารถได้รับร่างกายของผู้ชายหลังจากการผ่าตัดหลายครั้ง บางแง่มุมของการผ่าตัดแปลงเพศใหม่นั้นมีการรุกรานสูงและใช้เวลาในการพักฟื้นช้า การฝึกอบรมที่เหมาะสมสำหรับศัลยแพทย์ที่ทำการผ่าตัดอาจใช้เวลาหลายปี
เป้าหมายของการผ่าตัดแปลงเพศใหม่คือการให้ร่างกายใหม่แก่ผู้ป่วย หลังจากชุดการผ่าตัดเสร็จสิ้นผู้ป่วยจะรู้สึกสะดวกสบายมากขึ้นในร่างกายของเขาหรือเธอ การผ่าตัดเป็นสุดยอดของการรักษานานหลายปีซึ่งรวมถึงการดูแลผู้ป่วยทางจิตสำหรับการบำบัดทางเพศและการรักษาด้วยฮอร์โมน กระบวนการทั้งหมดมักจะเรียกว่าการเปลี่ยนและผู้ป่วยที่เป็นที่รู้จักกันว่าเพศหรือเพียงแค่ทรานส์ ผู้ย้ายถิ่นฐานบางคนเลือกที่จะไม่รับการผ่าตัดแปลงเพศในขณะที่คนอื่นรู้สึกว่ามันเป็นส่วนสำคัญในกระบวนการรักษา
ในกรณีของการเปลี่ยนเพศหญิงเป็นชายการผ่าตัดแปลงเพศตามเพศนั้นรวมถึงการผ่าตัดเต้านมออกสองครั้งและการผ่าตัดบริเวณขาหนีบอีกครั้ง โดยปกติเนื้อเยื่อของเต้านมเริ่มหดตัวลงเนื่องจากการรักษาด้วยฮอร์โมนและการตัดเนื้อเยื่อเต้านมออกจะเป็นการกำจัดเนื้อเยื่อเต้านมเพิ่มเติม การกู้คืนจากการผ่าตัดมะเร็งเต้านมเป็นกระบวนการที่มีความยาวและเกี่ยวข้องกับการวางท่อระบายน้ำเพื่อการผ่าตัดเชิงกลยุทธ์เพื่อให้ของเหลวไม่ได้ถูกสร้างขึ้นที่บริเวณการผ่าตัด ผู้ป่วยบางรายยังเลือกใช้การดูดไขมันเพื่อลดสะโพกและต้นขาผู้หญิงที่มีลักษณะเฉพาะ
ผู้ป่วยที่เกิดมาเป็นเพศชายมักจะเติบโตเต้านมอันเป็นผลมาจากฮอร์โมนที่พวกเขาใช้ในระหว่างกระบวนการเปลี่ยนผ่าน หากผู้ป่วยไม่พอใจกับเต้านมของเธอศัลยแพทย์อาจเสนอการเสริมเต้านม ในบางกรณีเต้านมโตไม่สม่ำเสมอและศัลยแพทย์แก้ไขปัญหานี้โดยการลดหนึ่งหรือเพิ่มอีกหลังจากประเมินสถานการณ์กับผู้ป่วย ในบางกรณีผู้ป่วยอาจได้รับการเสริมเช่นการปลูกถ่ายสะโพกเพื่อรูปร่างร่างกายของเธอยิ่งขึ้นเป็นส่วนหนึ่งของการผ่าตัดกำหนดเพศของเธอ
การผ่าตัดในบริเวณขาหนีบสะท้อนให้เห็นถึงทักษะพิเศษ แม้ว่าผู้ป่วยจะได้รับการผ่าตัดแปลงเพศทางเพศมาตั้งแต่ปี 1950 เทคนิคที่ใช้ในการสร้างอวัยวะเพศที่เหมือนจริงและใช้งานได้นั้นสมบูรณ์แบบในปี 1980 และ 1990 เท่านั้น ศัลยแพทย์ทั่วโลกมีจำนวน จำกัด เสนอการผ่าตัดและเฉพาะผู้ป่วยที่ได้รับการรักษาอย่างเต็มรูปแบบด้วยจิตแพทย์และแพทย์ต่อมไร้ท่อ หากผู้ป่วยแสดงให้เห็นถึงความมุ่งมั่นในการเปลี่ยนแปลงเขาหรือเธอจะได้รับการผ่าตัดแปลงเพศทางเพศซึ่งไม่สามารถกลับคืนสภาพเดิมซึ่งใช้เวลานานหลายชั่วโมงในการสร้างอวัยวะเพศใหม่
