ฝ้ายปลอดเชื้อเป็นผ้าที่ปราศจากสิ่งปนเปื้อนอินทรีย์ที่มีฤทธิ์แรงเช่นแบคทีเรียที่เป็นอันตราย อาจมีการใช้งานสำหรับวัสดุในกระบวนการ "คลีนรูม" อุตสาหกรรมที่ต้องมีสภาพแวดล้อมที่ควบคุมอย่างมีวิจารณญาณ แต่มันก็ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อวัตถุประสงค์ทางการแพทย์เป็นหลัก คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ของฝ้ายโดยเฉพาะอย่างยิ่งคุณภาพที่ไม่แพ้ง่ายทำให้เหมาะสำหรับสิ่งนี้ เทคโนโลยีต่าง ๆ ได้รับการพัฒนาเพื่อทำให้ปราศจากเชื้อ
เส้นใยแต่ละเส้นที่ติดอยู่กับฝักของเมล็ดฝ้ายนั้นมีขนาดบางและยาวเฉลี่ย 1 นิ้ว (2.5 ซม.) เมื่อปั่นเส้นใยจะพันกันแน่นเป็นเกลียวหนาและแข็งแรงเมื่อเทียบกับขนาดของมัน ด้ายสามารถเป็นได้ทั้งถักและทอ มีผลิตภัณฑ์ฝ้ายจำนวนมากที่ใช้ในโรงพยาบาลหรือสถานพยาบาลและส่วนใหญ่จำเป็นต้องได้รับการฆ่าเชื้อเพื่อป้องกันไม่ให้ผู้ป่วยสัมผัสกับเชื้อแบคทีเรียไวรัสและเชื้อโรคที่เป็นอันตรายอื่น ๆ
ผ้าปูที่นอนและชุดขัดตัวของพยาบาลเป็นผลิตภัณฑ์ฝ้ายที่โรงพยาบาลไม่สามารถทิ้งได้หลังจากใช้งานครั้งเดียว อย่างไรก็ตามอาจไม่เพียงพอที่จะทำให้พวกเขาสะอาดเพื่อนำมาใช้ซ้ำ ตัวอย่างเช่นหากมีการใช้งานโดยผู้ป่วยที่รับการรักษาโรคติดเชื้อพวกเขาเป็นอันตรายทางชีวภาพและจะต้องกำจัดร่องรอยอินทรีย์ใด ๆ ของผู้ใช้ก่อนหน้านี้ โรงพยาบาลส่วนใหญ่มีหม้อนึ่งความดันในบ้านเพื่อจุดประสงค์นี้ หม้อนึ่งความดันเป็นเตาอบที่ฆ่าเชื้อด้วยไอน้ำและแรงดันอย่างน้อย 250 °ฟาเรนไฮต์ (121 ° C) เป็นเวลา 15 นาที
ผ้าฝ้ายทอมีคุณสมบัติเหมาะสมอย่างยิ่งกับการใช้งานทางการแพทย์ มันไม่ได้รับผลกระทบจากของเหลวอินทรีย์ส่วนใหญ่ ไม่มีเอกสารการแพ้จากมนุษย์ต่อสิ่งทอ ทออย่างอิสระมันสามารถดูดซับได้สูง ทอแน่นมันเกือบกันน้ำ
หนึ่งในสภาพแวดล้อมที่จำเป็นต้องใช้อุปกรณ์ฆ่าเชื้ออย่างแน่นอนคือห้องปฏิบัติการ มีผลิตภัณฑ์ผ้าฝ้ายทอปลอดเชื้อสองผืนที่ใช้เฉพาะที่นี่: ผ้าขนหนูทอลายทแยงและฟองน้ำสานผ้ากอซ อดีตเป็นผ้าเช็ดตัวอเนกประสงค์ที่ใช้สำหรับยกตัวอย่างเช่นจัดถาดเครื่องมือผ่าตัด ฟองน้ำได้รับการตั้งชื่อเพื่อใช้ในการดูดซับและล้างเลือดส่วนเกินในระหว่างการผ่าตัด ผ้ากอซฝ้ายที่ผ่านการฆ่าเชื้อที่คล้ายกันจะใช้เป็นแผ่นแผลและยังเป็นผ้าพันแผลกาวหมัน
การฆ่าเชื้อในระดับอุตสาหกรรมของผ้าขนหนูในห้องผ่าตัดแบบใช้แล้วทิ้งผ้ากอซผ่าตัดและผ้าพันแผลที่มีกาวเช่นชื่อแบรนด์ Band-Aid®มักใช้การฉายรังสี ภายในห้องที่มีการป้องกันอย่างแน่นหนาผลิตภัณฑ์เหล่านี้รวมถึงเครื่องมือทางการแพทย์อื่น ๆ เช่นเข็มฉีดยาและมีดผ่าตัดมีการสัมผัสกับสารกัมมันตภาพรังสีโคบอลต์ที่เปล่งรังสีแกมมามรณะ แม้ว่ากระบวนการนี้จะเป็นอันตรายทางเทคนิค แต่ก็มีประสิทธิภาพมากและทิ้งผลิตภัณฑ์ฝ้ายปลอดเชื้อที่เป็นอันตราย
