มีความแตกต่างหลายประการในการเสริมแคลเซียมคาร์บอเนตและแคลเซียมซิเตรตเช่นวิธีที่ร่างกายดูดซึมได้ง่ายปริมาณแคลเซียมที่ใช้งานได้ต่อสารประกอบและราคาโดยรวมของผลิตภัณฑ์ แคลเซียมทั้งสองชนิดใช้เพื่อให้มั่นใจว่าร่างกายมีแร่ธาตุที่จำเป็นเพียงพอรวมถึงการรักษาอาการแสบร้อนกลางอกหรือยาแก้ท้องเฟ้อเมื่อจำเป็น แม้จะมีความแตกต่างกัน แต่ผลิตภัณฑ์เสริมแคลเซียมเหล่านี้เป็นที่ทราบกันดีว่าก่อให้เกิดอาการท้องผูกในผู้ป่วยบางรายและปริมาณที่แนะนำโดยรวมสำหรับการบริโภคประจำวันคือ 1,000 มก. ถ่ายอย่างน้อยสองครั้งในระหว่างวัน ที่ดีที่สุดคือถามแพทย์สำหรับคำแนะนำการใช้ยาเฉพาะเนื่องจากจำนวนอาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับปัจจัยต่าง ๆ เช่นเพศอายุและปัญหาที่เกี่ยวข้องกับสุขภาพ
หนึ่งในความแตกต่างที่สำคัญที่สุดระหว่างแคลเซียมคาร์บอเนตและแคลเซียมซิเตรตคือการดูดซึมและการทนต่อร่างกายของพวกเขา ผู้เชี่ยวชาญด้านการแพทย์ส่วนใหญ่แนะนำให้ใช้แคลเซียมซิเตรตในระบบย่อยอาหาร นอกจากนี้ยังแนะนำว่าแคลเซียมซิเตรตมีโอกาสน้อยที่จะทำให้เกิดอาการท้องผูกเพราะอวัยวะย่อยอาหารสามารถทนต่อมันได้ดีกว่า สำหรับผู้ป่วยที่มีเงื่อนไขที่ลดความสามารถในการผลิตกรดในกระเพาะอาหารแคลเซียมซิเตรตก็ถือว่ามีประสิทธิภาพมากกว่าเช่นกัน
ความแตกต่างที่ได้รับการยอมรับกันทั่วไปในแคลเซียมคาร์บอเนตและแคลเซียมซิเตรตคือปริมาณแคลเซียมที่มีอยู่ในสารประกอบแคลเซียม แคลเซียมคาร์บอเนตมีธาตุแคลเซียมประมาณ 40% ในขณะที่แคลเซียมซิเตรตมีเพียง 21% เท่านั้น คุณภาพของธาตุแคลเซียมนั้นเหมือนกันดังนั้นผู้ป่วยจะต้องทานแคลเซียมซิเตรตเพิ่มขึ้นเพื่อให้ผลการรักษาเหมือนกับผลิตภัณฑ์แคลเซียมคาร์บอเนตแท็บเล็ตน้อยลง ผู้ป่วยอาจเลือกรุ่นคาร์บอเนตเพื่อความสะดวกมากขึ้นหรือเภสัชกรหรือแพทย์อาจกำหนดให้ผู้ป่วยที่ทนได้ดี
ราคาของแคลเซียมคาร์บอเนตและแคลเซียมซิเตรตมักจะแตกต่างกันเช่นกัน ในหลายกรณีแคลเซียมซิเตรตมีราคาแพงกว่าผลิตภัณฑ์แคลเซียมคาร์บอเนตซึ่งอาจเป็นเพราะชื่อเสียงของคาร์บอเนตในเรื่องของอาการท้องผูกและความจริงที่ว่าร่างกายดูดซึมได้ง่าย สิ่งสำคัญคือต้องทราบว่าเพื่อให้ได้รับปริมาณแคลเซียมอย่างเต็มรูปแบบจำเป็นต้องรับแคลเซียมซิเตรตมากกว่าแคลเซียมคาร์บอเนตและน่าจะส่งผลให้มีค่าใช้จ่ายสูงขึ้น ผู้ป่วยหลายรายทดลองกับผลิตภัณฑ์แคลเซียมสองประเภทเพื่อพิจารณาว่าแบบใดที่เหมาะกับความต้องการและงบประมาณของพวกเขามากที่สุด
