พันธะเปปไทด์เป็นพันธะโควาเลนต์ชนิดหนึ่งที่พบได้เฉพาะภายในโมเลกุลโปรตีน พันธะเหล่านี้รวมกรดอะมิโนเข้าด้วยกันเพื่อสร้างโซ่เปปไทด์ซึ่งรวมตัวกันเพื่อสร้างโปรตีน พันธะโควาเลนต์เกิดขึ้นเมื่ออะตอมหนึ่งภายในโมเลกุลแบ่งปันอิเล็กตรอนหนึ่งสองหรือสามอะตอมกับอะตอมจากโมเลกุลอื่น พันธบัตรประเภทนี้มีความแข็งแกร่งและสามารถทำลายได้ยาก
โปรตีนทั้งหมดทำจากโซ่ของกรดอะมิโนที่ยึดติดกันในวิธีที่เฉพาะเจาะจง กรดอะมิโนส่วนใหญ่มีกลุ่มคาร์บอกซิลเดี่ยว (-COOH) อยู่ด้านหนึ่งและกลุ่มอะมิโน (-NH 2 ) อยู่อีกด้านหนึ่ง กรดอะมิโนที่อยู่ติดกันสามารถสร้างพันธะเปปไทด์เมื่อกลุ่มคาร์บอกซิลของกรดกลุ่มหนึ่งเข้าร่วมกับกลุ่มอะมิโนอีกกลุ่มหนึ่ง
เมื่อพันธะเปปไทด์เกิดขึ้นระหว่างกรดอะมิโนโมเลกุลของน้ำจะหายไป ปฏิกิริยาประเภทนี้เรียกว่าปฏิกิริยาการควบแน่น โมเลกุลของน้ำ (H 2 O) สร้างขึ้นโดยการสูญเสียไฮดรอกซิล (-OH) จากกลุ่มคาร์บอกซิลและอะตอมไฮโดรเจน (H) จากกลุ่มอะมิโน ความจริงที่ว่ากรดอะมิโนทั้งหมดจะรวมตัวกันด้วยวิธีนี้เป็นหนึ่งในปัจจัยที่กำหนดรูปร่างของโปรตีนที่ถูกสร้างขึ้น
พันธะเปปไทด์เดี่ยวเกิดขึ้นระหว่างการจับคู่กรดอะมิโนแต่ละครั้ง โปรตีนนั้นเรียกว่าโพลีเปปไทด์เนื่องจากมักประกอบด้วยกรดอะมิโนหลายร้อยและหลายร้อยที่รวมตัวกันเป็นโซ่เปปไทด์ ซึ่งหมายความว่าโปรตีนมีพันธะเปปไทด์มากมาย
ในการทำลายพันธะเปปไทด์จะต้องเกิดปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสซึ่งตรงกันข้ามกับปฏิกิริยาการควบแน่น ปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสเกิดขึ้นเมื่อแยกโปรตีนออกเป็นโซ่เปปไทด์หรือเปปไทด์เป็นกรดอะมิโนเดี่ยว ในการไฮโดรไลซิสโมเลกุลของน้ำจะถูกเพิ่มเข้าไปในพันธะเปปไทด์ทำให้น้ำแยกตัว กลุ่มไฮดรอกซิล (-OH) ยึดติดกับกลุ่มคาร์บอกซิลของกรดอะมิโนหนึ่งตัวและอะตอมไฮโดรเจน (H) ยึดติดกับกลุ่มอะมิโนอื่น ๆ
พันธบัตรของเปปไทด์นั้นมีความเสถียรอย่างมากซึ่งหมายความว่าพวกมันยากที่จะแตกหัก นี่เป็นเรื่องสำคัญอย่างยิ่งสำหรับโปรตีนเนื่องจากมีบทบาทสำคัญในรูปแบบของสิ่งมีชีวิตส่วนใหญ่ ตัวอย่างเช่นโปรตีนที่เรียกว่าเอนไซม์ควบคุมปฏิกิริยาเคมีเกือบทั้งหมดในสิ่งมีชีวิต นอกจากนี้รูปร่างของโปรตีนก็มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการทำงานของโปรตีนนั้น คำสั่งของกรดอะมิโนที่ทำขึ้นโปรตีนรวมถึงความแข็งแรงของพันธะเปปไทด์เป็นปัจจัยในการกำหนดและรักษารูปร่างของโปรตีนแต่ละชนิด
