อวัยวะต่าง ๆ ในระบบกล้ามเนื้อ ได้แก่ กล้ามเนื้อหัวใจกล้ามเนื้อเรียบและกล้ามเนื้อโครงร่าง กล้ามเนื้อสมบูรณ์ประกอบด้วยเส้นใยกล้ามเนื้อเนื้อเยื่อเกี่ยวพันเนื้อเยื่อประสาทและเนื้อเยื่อเลือดถือเป็นอวัยวะเดียว มีอวัยวะประมาณ 600 ในระบบกล้ามเนื้อและกล้ามเนื้อเหล่านี้ประกอบขึ้นประมาณ 40 เปอร์เซ็นต์ของร่างกาย อวัยวะเหล่านี้สามารถแบ่งออกเป็นสี่กลุ่มหลัก: กล้ามเนื้อของขาส่วนล่าง, กล้ามเนื้อลำตัว, กล้ามเนื้อของปลายแขนและกล้ามเนื้อศีรษะและคอ
การใช้กระบวนการหดตัวอวัยวะของระบบกล้ามเนื้อมีหน้าที่ควบคุมการเคลื่อนไหวเกือบทั้งหมดในร่างกาย แม้แต่การเคลื่อนไหวโดยไม่สมัครใจเช่นการหดตัวของปอดสำหรับการหายใจหรือหัวใจสำหรับการไหลเวียนของเลือดจะถูกชี้นำโดยกล้ามเนื้อ การขยับตาการหายใจและการยิ้มนั้นเกิดจากอวัยวะของระบบกล้ามเนื้อ นอกจากการเคลื่อนไหวแล้วอวัยวะของระบบกล้ามเนื้อยังจัดการกับท่าทางและอุณหภูมิของร่างกาย กล้ามเนื้อสามารถให้ความร้อนแก่ร่างกายด้วยการผลิตตัวสั่นซึ่งหดเกร็งอย่างรวดเร็วเกร็งและไม่ได้ตั้งใจซึ่งถูกออกแบบมาเพื่อเพิ่มการเผาผลาญและอุณหภูมิของร่างกายในสภาพที่เย็นจัด
กล้ามเนื้อโครงร่างด้วยความช่วยเหลือของเอ็นเส้นกระดูกและข้อต่อ พวกเขาเป็นอวัยวะที่มีมากที่สุดในระบบกล้ามเนื้อ กล้ามเนื้อโครงร่างบางส่วนมีขนาดเล็กและอื่น ๆ อาจมีขนาดใหญ่ ขนาดแตกต่างกันเช่นกันเพราะกล้ามเนื้อเหล่านี้ใช้เวลากับรูปร่างที่จำเป็นเพื่อให้สอดคล้องกับกรอบของโครงกระดูก กล้ามเนื้อที่มีรูปร่างเหมือนสามเหลี่ยมเรียกว่า deltoids และกล้ามเนื้อที่มีความกว้างมากที่สุดเรียกว่ากล้ามเนื้อ latissimus กล้ามเนื้อโครงร่างคล้ายรูปสี่เหลี่ยมคางหมูและรูปร่างคล้ายสี่เหลี่ยมขนมเปียกปูนเรียกว่ากล้ามเนื้อรูปสี่เหลี่ยมคางหมูและกล้ามเนื้อรูปสี่เหลี่ยมด้านขนานตามลำดับ
การทำงานเป็นชุดกล้ามเนื้อโครงร่างทำให้แน่ใจได้ว่าการเคลื่อนไหวทางกายภาพเช่นการเดินการขยิบตาผงกศีรษะและการเลี้ยวเกิดขึ้นโดยการสังเคราะห์การเคลื่อนไหวแบบดึงและกดของกระดูกกรงซี่โครงกระดูกสันหลังและกะโหลกศีรษะ กล้ามเนื้อเหล่านี้แผ่ขยายไปทั่วโครงกระดูกเหมือนตาข่ายยางที่ไม่มีที่สิ้นสุดช่วยให้ยืดหดได้ การเคลื่อนไหวของกล้ามเนื้อโครงกระดูกเริ่มต้นด้วยการสื่อสารกับสมองเป็นมากกว่าความสามารถทางกายภาพ เส้นใยกล้ามเนื้อในโครงกระดูกมีตัวรับประสาทที่รับและแปลความหมายสัญญาณจากสมองบอกกล้ามเนื้อเพื่อดำเนินการเคลื่อนไหว นอกเหนือจากการควบคุมการเคลื่อนไหวของกล้ามเนื้อแล้วกล้ามเนื้อโครงร่างยังสนับสนุนข้อต่อซึ่งเป็นจุดที่กระดูกมาบรรจบกัน
กล้ามเนื้อหัวใจหดตัวเป็นจังหวะซึ่งปกคลุมผนังหัวใจมีหน้าที่ในการเต้นของหัวใจ อวัยวะหัวใจทั้งหมดในระบบกล้ามเนื้อไม่ได้ตั้งใจและหดตัวโดยอัตโนมัติ กล้ามเนื้อเรียบจะสอดแทรกอวัยวะภายในที่เหลืออยู่เช่นมดลูกในผู้หญิงกระเพาะปัสสาวะและส่วนต่าง ๆ ของระบบย่อยอาหารทำให้กระเพาะอาหารและลำไส้หดตัวเมื่ออาหารผ่านไป เช่นเดียวกับกล้ามเนื้อหัวใจกล้ามเนื้อเรียบก็เป็นไปโดยอัตโนมัติ
