เปปไทด์เป็นโซ่โพลีเปปไทด์ขนาดใหญ่ประกอบด้วยกรดอะมิโนมากถึง 50 ชนิดซึ่งสามารถจำแนกได้ตามหน้าที่และโดยการสังเคราะห์ เปปไทด์ทั่วไปบางประเภทที่จำแนกตามหน้าที่ประกอบด้วยฮอร์โมนนิวโรเปปไทด์และอัลคาลอยด์ เมื่อจำแนกตามการสังเคราะห์เปปไทด์อาจเป็นไรโบโซม, nonribosomal และเพพโทนิก ระบบการจำแนกประเภทของเปปไทด์ถือเป็นวิทยาศาสตร์ที่ไม่สมบูรณ์เพราะเปปไทด์หนึ่งอันสามารถอยู่ในหลายกลุ่มพร้อมกันและนักวิทยาศาสตร์ยังคงถกเถียงกันว่าควรจะจำแนกเปปไทด์เป็นโปรตีนหรือโปรตีนเป็นเปปไทด์ นักวิทยาศาสตร์หลายคนยอมรับว่าเปปไทด์นั้นไม่สอดคล้องกับรูปแบบที่เฉพาะเจาะจงในขณะที่โปรตีนนั้นมีความแตกต่างในลักษณะของโครงสร้าง
ฮอร์โมนซึ่งเป็นหนึ่งในการจำแนกประเภทของเปปไทด์ที่พบมากที่สุดในร่างกายมนุษย์เป็นโมเลกุลของสารเฉพาะที่ใช้ในการสื่อสารของเซลล์ ฮอร์โมนมีการระบุเช่นนี้เพราะพวกเขาจะหลั่งและสังเคราะห์โดยทีมงานของเซลล์เฉพาะที่เรียกว่าต่อมไร้ท่อ หลังจากการหลั่งฮอร์โมนเปปไทด์จะเดินทางไปยังอวัยวะเป้าหมายที่พวกมันทำหน้าที่ รูปร่างของฮอร์โมนนั้นเกี่ยวข้องกับผู้รับในเยื่อหุ้มเซลล์ของอวัยวะเป้าหมายที่เกี่ยวข้อง ตัวอย่างเช่นฮอร์โมนเปปไทด์กลูคากอนและอินซูลินมีไซต์ที่มีตัวรับเฉพาะในตับที่ช่วยควบคุมระดับน้ำตาลในเลือด
Neuropeptides เป็นที่แพร่หลายในระบบประสาทส่วนกลางและอุปกรณ์ต่อพ่วงของร่างกายและมีหน้าที่ยับยั้งและ excitatory เฉพาะ Neuropeptides ทำงานในลักษณะเดียวกับสารสื่อประสาทเช่นเซโรโทนินและโดปามีน หนึ่งในคลาสที่รู้จักกันดีที่สุดของ neuropeptides คือ endorphins เอนดอร์ฟินนั้นถูกมองว่าเป็นยาแก้ปวดภายนอกร่างกายซึ่งมักจะถูกเปรียบเทียบกับยามอร์ฟีน
ส่วนหนึ่งของการทำงานของเอ็นดอร์ฟินรวมถึงการยับยั้ง neuropeptide อีกตัวหนึ่งซึ่งเป็นสาร P ซึ่งส่งสัญญาณความเจ็บปวดจากระบบประสาทส่วนปลายไปยังผู้รับในระบบประสาทส่วนกลาง บางครั้งนิวโรเปปไทด์สามารถทำหน้าที่เป็นฮอร์โมนในระบบต่าง ๆ ของร่างกายเช่นกัน
ในการจำแนกเปปไทด์เนื่องจากการสังเคราะห์ส่วนใหญ่เป็นชนิดไรโบโซม เปปไทด์ชนิดนี้ถูกสังเคราะห์เมื่อมีการแปลกรดริบบอนนิวคลีอิก (mRNA) บนเซลล์ ในระหว่างการแปลกระบวนการทางเคมีเกิดขึ้นที่กลุ่มคาร์บอกซิลหนึ่งกลุ่มบนคู่กรดอะมิโนกับกรดอะมิโนตัวอื่นเพื่อสร้างจุดเริ่มต้นของห่วงโซ่กรดอะมิโน เปปไทด์ Ribosomal มักประกอบด้วยกรดอะมิโน 30 ถึง 40 ตัวเข้าด้วยกัน เปปไทด์ที่ไม่ได้อยู่ในรูปแบบของ nonribosomal จะถูกสังเคราะห์เมื่อมีตัวเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์อยู่ เปปไทด์ Peptonic นั้นหายากและเกิดขึ้นในระหว่างกระบวนการย่อยอาหารในร่างกาย
