ความแตกต่างของโครงสร้างและหน้าที่ของไรโบโซมชนิดต่าง ๆ กำลังได้รับการวิจัยและแก้ไขอย่างต่อเนื่อง แต่ปัจจุบันมีสองวิธีที่สามารถจำแนกได้ วิธีแรกคือการจำแนกพวกเขาตามชนิดของเซลล์ที่พวกเขาอาศัยอยู่: archaeal, eukaryotic หรือ eubacterial ออร์แกเนลล์ในเซลล์ประเภทเฉพาะเหล่านี้มีความแตกต่างในสัดส่วนขนาดและโปรตีนต่อกรด ribonucleic (RNA) วิธีที่สองที่ไรโบโซมถูกจัดประเภทเกี่ยวข้องกับว่าพวกมันถูกผูกไว้กับเมมเบรนหรือยังคงลอยอยู่ภายในเซลล์ คำศัพท์ที่ใช้อธิบายการจำแนกประเภทนี้คือ“ ขอบของเมมเบรน” และ“ ฟรี” ตามลำดับ
ความแตกต่างระหว่าง archaeal, eukaryotic, และ eubacterial organelles สามารถมองเห็นได้ถ้าเซลล์หมุนตัวในเครื่องหมุนเหวี่ยง แต่ละประเภทมีรูปแบบและอัตราการตกตะกอนที่ไม่เหมือนใครเมื่อเซลล์แยกออกจากกันในห้องปฏิบัติการ วัดในหน่วย Svedberg ซึ่งแสดงอัตราการตกตะกอนสะสมไรโบโซมแบคทีเรียอยู่ในระดับ 70 Svedberg ขณะที่ไรโบโซมอาร์คีออลและยูคาริโอตอยู่ในระดับ 80 Svedberg เพื่อแยกความแตกต่างเพิ่มเติมแต่ละประเภทยังแตกต่างกันในขนาดและอัตราส่วนของโปรตีนต่อ RNA ตัวอย่างเช่นประเภทยูคาริโอตวัดระหว่าง 25 ถึง 35 นาโนเมตร (นาโนเมตร) และมีอัตราส่วนโปรตีน 1: 1 ในขณะที่ชนิดอื่นวัดต่างกัน
โครงสร้างของไรโบโซมที่ถูกผูกกับเมมเบรนและอิสระนั้นเหมือนกัน พวกเขาแตกต่างกันในการกระจายเชิงพื้นที่เท่านั้น อย่างไรก็ตามมีการกระทำบางอย่างที่ประเภทหนึ่งสามารถดำเนินการได้เมื่ออยู่ในที่เดียวหรืออีกประเภทหนึ่ง ที่ถูกผูกไว้กับ reticulum endoplasmic หยาบ (คร่าว ๆ ER) มีความสามารถในการผลิตโปรตีนและเอนไซม์ที่สามารถนำมาใช้อย่างง่ายดายโดยเยื่อหุ้มเซลล์พลาสมาหลักของเซลล์ สายโปรตีนที่ผลิตขึ้นใหม่สามารถแทรกเข้าไปใน ER แบบหยาบได้โดยไรโบโซมที่ยึดด้วยเมมเบรนทำให้เวลาและทรัพยากรที่ใช้ในการขนส่งสั้นลง ประเภทนี้ยังรับผิดชอบโปรตีนส่วนใหญ่ที่ส่งออกจากการตกแต่งภายในเซลล์
ชนิดอิสระทำให้โปรตีนที่จำเป็นจำนวนหนึ่งเช่นที่จำเป็นสำหรับการผลิตฮีโมโกลบินซึ่งชนิดของเมมเบรนที่ถูกผูกไว้ไม่สามารถทำได้ ไรโบโซมฟรีเป็นสิ่งจำเป็นเมื่อเซลล์มีการเติบโตอย่างรวดเร็วหรือทำซ้ำเนื่องจากสามารถเคลื่อนที่และเคลื่อนย้ายได้ง่าย พวกเขามักจะพบในกลุ่มเล็ก ๆ ภายในพลาสซึมของเซลล์และในกรณีนี้พวกเขาสามารถเรียกว่า polyribosomes ไรโบโซมฟรีพบมากในเซลล์ที่ไม่ส่งออกโปรตีนจำนวนมากเนื่องจากความใกล้ชิดกับ ER แบบหยาบเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกระบวนการนี้
