การกลายพันธุ์ในยีน prothrombin หรือที่รู้จักกันในชื่อการกลายพันธุ์ของปัจจัยที่สองนั้นมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมดังนั้นพวกมันจึงได้มาจากการถ่ายทอดทางพันธุกรรม ยีนนี้มีหน้าที่ผลิต prothrombin ซึ่งเปลี่ยนเป็น thrombin ในร่างกายดังนั้นข้อบกพร่องนี้บางครั้งเรียกว่าการกลายพันธุ์ของยีน thrombin ในทางกลับกัน Thrombin จะทำการแปลงไฟบรินที่ละลายในน้ำให้เป็นโมเลกุลที่ไม่ละลายน้ำคือไฟบรินซึ่งเป็นองค์ประกอบสำคัญของกลไกการแข็งตัวของเลือด การกลายพันธุ์ของยีน Thrombin เป็นปัจจัยเสี่ยงที่ใหญ่เป็นอันดับสองสำหรับการเกิดลิ่มเลือดหรือลิ่มเลือดลึกภายในหลอดเลือดถัดจากปัจจัย V กลายพันธุ์
การกลายพันธุ์ของยีน thrombin นั้นเป็นกรรมพันธุ์ดังนั้นคน ๆ หนึ่งสามารถมียีนที่กลายพันธุ์ได้หนึ่งหรือสองสำเนาโดยที่มีสองชุดทำให้บุคคลนั้นมีความเสี่ยงต่อการเกิดลิ่มเลือดมากขึ้น การกลายพันธุ์ของยีน Thrombin เป็นการกลายพันธุ์ที่เด่นชัดของ autosomal ซึ่งหมายความว่าบุคคลที่มีการกลายพันธุ์หนึ่งสำเนามีโอกาส 50 เปอร์เซ็นต์ที่จะส่งต่อไปยังลูก ๆ ของเขาหรือเธอ ทั้งชายและหญิงเช่นเดียวกับบุคคลที่มีกรุ๊ปเลือดใด ๆ มีความเสี่ยงเท่ากับการสืบทอดยีนนี้และมีความเสี่ยงที่เกี่ยวข้องของการเกิดลิ่มเลือดถ้าพวกเขาทำ
การกลายพันธุ์นี้ไม่ได้รับมรดกโดยทั่วไปกับการกลายพันธุ์อื่น ๆ และมันเกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์จุดที่ตำแหน่ง 20210 ในยีน prothrombin ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่ 11 ประมาณ 1-2 เปอร์เซ็นต์ของประชากรชาวคอเคเซียนนั้นมีความแตกต่างจากปัจจัยการกลายพันธุ์ที่สองซึ่งหมายความว่าคนเหล่านั้นมียีนที่มีข้อบกพร่องหนึ่งชุด อัตราความชุกของผู้คนในเผ่าพันธุ์อื่นนั้นต่ำกว่ามาก
เมื่อการกลายพันธุ์นี้ได้รับมรดกมันจะชะลอการสลายตัวของ prothrombin messenger RNA ซึ่งจะเป็นการเพิ่มการผลิต prothrombin ซึ่งจะนำไปสู่การเพิ่มขึ้นของ thrombin ในเลือด ในทางกลับกันกระบวนการจับตัวเป็นลิ่มอาจเกิดขึ้นได้ง่ายขึ้นเนื่องจากมีลิ่มเลือดส่วนเกินที่เกี่ยวข้องในการสร้างไฟบรินซึ่งสามารถสิ้นสุดในการเกิดลิ่มเลือด การกลายพันธุ์ของยีน thrombin เพิ่มความเสี่ยงของการเกิดลิ่มเลือดในหลอดเลือดดำลึกประมาณสองถึงสามครั้ง นอกจากนี้ยังมีความเสี่ยงด้านสุขภาพอื่น ๆ จากระดับที่สูงขึ้นของ thrombin โดยเฉพาะอย่างยิ่งการคลอดก่อนกำหนด
การกลายพันธุ์ของยีน Thrombin เพิ่มความเสี่ยงต่อการเกิดลิ่มเลือด แต่ไม่ได้หมายความว่าบุคคลจะพัฒนาความผิดปกตินี้ มีปัจจัยเสี่ยงอื่น ๆ ที่สามารถเพิ่มโอกาสของการเกิดลิ่มเลือดโดยเฉพาะอย่างยิ่งกับสำเนาของยีนกลายพันธุ์ ปัจจัยเสี่ยงเหล่านี้รวมถึงการใช้ยาคุมกำเนิดการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมที่รู้จักกันในชื่อการกลายพันธุ์ปัจจัยวีการตั้งครรภ์การสูบบุหรี่การสูบบุหรี่โรคอ้วนหรือไม่สามารถเคลื่อนไหวได้เป็นเวลานาน
