ร่างกายมนุษย์โดยทั่วไปจะขึ้นอยู่กับน้ำตาลกลูโคสน้ำตาลพลังงาน แต่มันยังสามารถใช้กรดไขมันเก็บไว้เป็นทางเลือก ออกซิเดชันของกรดไขมันโดยทั่วไปจำเป็นสำหรับพวกเขาเป็นแหล่งพลังงาน สารจากตับและตับอ่อนทำให้ไขมันหรือไขมันผ่านจากผนังลำไส้เข้าสู่กระแสเลือด เมื่อกรดไขมันถูกออกซิไดซ์การเปลี่ยนแปลงมักจะเกิดขึ้นในระดับอะตอมซึ่งเริ่มต้นจากเอนไซม์ต่าง ๆ สารประกอบดังกล่าวจะต้องถูกกระตุ้นภายในไซโตพลาสซึมของเซลล์ ออกซิเดชันสามารถเกิดขึ้นภายในโครงสร้างของเซลล์ที่เรียกว่าไมโตคอนเดรีย
เมื่อมีความจำเป็นปฏิกิริยาออกซิเดชันของกรดไขมันจะเริ่มขึ้นเมื่อเอนไซม์ทำปฏิกิริยากับโมเลกุล เอนไซม์ที่เรียกว่าคาร์นิทีนจะได้รับสารประกอบไขมันเพื่อข้ามเมมเบรนของไมโตคอนเดรียซึ่งเกิดออกซิเดชัน การเคลื่อนไหวของสารเข้าและออกจากไมโตคอนเดรียมักได้รับการสนับสนุนโดยวงจรการขนส่งคาร์นิทีน โดยทั่วไปพลังงานต่ออะตอมมากกว่าที่ผลิตได้เมื่อใช้คาร์โบไฮเดรตเป็นพลังงาน ไขมันอิ่มตัวและกรดไขมันไม่อิ่มตัวมักจะถูกออกซิไดซ์ในทางเดียวกัน แต่การมีพันธะอะตอมสองครั้งโดยทั่วไปต้องใช้เอนไซม์เพิ่มเติมระหว่างการออกซิเดชั่นของกรดไขมัน
เอนไซม์ที่รับผิดชอบการเกิดออกซิเดชันของกรดไขมันสามารถถูกกระตุ้นโดยฮอร์โมน เซลล์มักปล่อยหยดไขมันเข้าสู่กระแสเลือด สารที่เก็บไว้ในไขมันจะถูกทำลายโดยเอนไซม์ล่วงหน้า การขาดการบริโภคอาหารอย่างเพียงพอและออกกำลังกายเป็นเวลานานอาจทำให้ร่างกายเริ่มปฏิกิริยาเหล่านี้ได้ โดยทั่วไปผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาของเอนไซม์ของกรดไขมันจะถูกย้ายเข้าไปในไมโตคอนเดรียหากค่าพลังงานของเซลล์ต่ำในขณะที่สถานะพลังงานสูงจะยับยั้งการเคลื่อนย้ายเข้าไปในโครงสร้าง โมเลกุลของไขมันมักถูกใช้เพื่อสร้างสารและไขมันอื่นสำหรับเยื่อหุ้มเซลล์แทน
นอกจากพลังงานแล้วน้ำยังถูกผลิตขึ้นในระหว่างการออกซิเดชั่นของกรดไขมัน ปฏิกิริยาที่ทำลายออกซิเจนและปฏิกิริยาเคมีกับ Adenosine Triphosphate (ATP) สามารถทำให้เกิดการก่อตัวของน้ำ องค์ประกอบพิเศษของปฏิกิริยานี้มักจะเป็นประโยชน์ต่อสัตว์ที่อาศัยอยู่ในภูมิอากาศแห้งหรือจำศีล
กรดไขมันออกซิเดชั่นบางครั้งเกิดขึ้นในอัตราที่สูง ตับสามารถตอบสนองโดยการผลิตโมเลกุลพลังงานที่เรียกว่าคีโตนร่างกาย ความไม่สมดุลเช่นที่เกิดขึ้นกับโรคเบาหวานสามารถนำไปสู่ ketoacidosis ซึ่งเซลล์ไม่สามารถออกซิไดซ์โมเลกุลพลังงานตับจำนวนมากและเลือดกลายเป็นกรดมากเกินไป การเกิดออกซิเดชันตามปกติของกรดไขมันจากปลาถั่วเหลืองและเมล็ดมักจะเติมสารที่ร่างกายไม่ได้ผลิตเอง
