การย่อยภายในเซลล์เป็นกระบวนการที่เซลล์ดูดซับสารและทำลายพวกมันภายในเยื่อหุ้มเซลล์ซึ่งตรงข้ามกับการย่อยเซลล์นอกเซลล์ซึ่งเซลล์จะหลั่งเอนไซม์เพื่อแยกส่วนประกอบออกจากผนังเซลล์ ตัวอย่างของทั้งสองสามารถเห็นได้ในสิ่งมีชีวิตบางอย่าง กระบวนการนี้ช่วยให้เซลล์แต่ละเซลล์ได้รับสารอาหารจากสภาพแวดล้อมของพวกเขาสลายการคุกคามและประมวลผลของเสียของตัวเองเช่นเดียวกับการสนับสนุนตัวเองในช่วงเวลาของความอดอยาก
ในการย่อยภายในเซลล์เซลล์สามารถที่จะกลืนวัสดุจากสภาพแวดล้อมภายนอก สำหรับสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวนี่เป็นวิธีการได้รับสารอาหารเพื่อป้อนเซลล์ การใช้การย่อยภายในเซลล์อีกอย่างหนึ่งคือในระบบภูมิคุ้มกันที่เซลล์สามารถกลืนแบคทีเรียไวรัสและสิ่งแปลกปลอมอื่น ๆ และทำลายลงเพื่อต่อต้านพวกมันกำจัดแหล่งที่มีศักยภาพของการติดเชื้อ
การย่อยภายในเซลล์มีสองชนิด การย่อย Heterophagic เกี่ยวข้องกับการทำลายวัตถุนอกเซลล์ในขณะที่การย่อยเซลล์ภายในเซลล์โดยอัตโนมัตินั้นเกี่ยวข้องกับการบริโภคส่วนประกอบจากภายในเซลล์ สิ่งนี้อาจเกิดขึ้นเมื่อเซลล์กำลังหิวโหยและอาจนำไปสู่การสลายซึ่งเป็นที่รู้จักกันว่าการตายของเซลล์หากเซลล์ย่อยสลายมากเกินไปในขณะที่กำลังมองหาพลังงานที่จะทำงาน เซลล์ยังสามารถตั้งโปรแกรมหรือกระตุ้นให้เริ่มย่อยอาหารด้วยตนเองเมื่อพวกมันมีอายุการใช้งานที่ยาวนานกว่าประโยชน์หรือเมื่อพวกมันติดเชื้อ
ในการย่อยอาหารแบบ heterophagic เมื่อเซลล์ได้กลืนเป้าหมายแล้วโครงสร้างภายในเซลล์ที่เรียกว่า lysosomes จะปล่อยเอนไซม์เพื่อสลายเป้าหมาย เอนไซม์ทำหน้าที่เหมือนกรรไกรตัดผ่านโปรตีนสำคัญของวัตถุที่เซลล์ถูกกลืน ขึ้นอยู่กับว่ามันคืออะไรมันอาจถูกแบ่งออกเป็นส่วนประกอบที่ใช้งานได้ซึ่งเซลล์สามารถนำไปรีไซเคิลหรืออาจถูกตัดเป็นของเสียเพื่อการกำจัด ในกรณีของการย่อยสารอาหารมักจะมีของเสียเกิดขึ้นระหว่างทางและสามารถถูกส่งกลับไปที่ผนังเซลล์เพื่อกำจัด
การย่อยภายในเซลล์เกิดขึ้นในทุกระดับของห่วงโซ่อาหารตั้งแต่เซลล์ในวาฬสีน้ำเงินที่ทำงานเพื่อแยกแบคทีเรียออกจากกันไปสู่สิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวในดินที่ทำลายแหล่งอาหารลงในส่วนประกอบที่มีประโยชน์ ในสัตว์หลายเซลล์นั้นยังมีระบบย่อยอาหารสำหรับการย่อยอาหารนอกเซลล์ซึ่งอาหารถูกแบ่งออกเป็นส่วนประกอบที่ใช้งานได้นอกกำแพงเซลล์ด้วยการใช้น้ำย่อยและส่วนประกอบเหล่านี้สามารถผ่านเข้าสู่กระแสเลือดเพื่อกระจายไปทั่วร่างกาย พวกเขาจะผ่านผนังเซลล์ของแต่ละเซลล์เพื่อให้พลังงานและวัสดุจำเป็นอื่น ๆ เพื่อความอยู่รอด
