คลองทางเดินอาหารของมนุษย์หรือที่เรียกว่าทางเดินอาหาร (GI) ประกอบด้วยโครงสร้างทั้งหมดจากปากไปยังทวารหนั โครงสร้างของทางเดินอาหาร ได้แก่ ปากคอหอยหลอดอาหารกระเพาะอาหารลำไส้และทวารหนัก ทางเดิน GI ของมนุษย์ที่เป็นผู้ใหญ่เพศชายวัดได้ประมาณ 20 ฟุต (6.5 เมตร) ทางเดินอาหารสามารถแบ่งออกเป็นทางเดินอาหารส่วนบนและทางเดินอาหารส่วนล่าง
ระบบทางเดินอาหารส่วนบนนั้นประกอบด้วยปากคอหอยหลอดอาหารกระเพาะอาหารและลำไส้เล็กส่วนต้นซึ่งเป็นส่วนบนสุดของลำไส้เล็ก ปากหรือที่เรียกว่าโพรงปากหรือช่องปากมีจำนวนของโครงสร้างที่ช่วยในการย่อยอาหารเริ่มต้นคือต่อมน้ำลายลิ้นและฟัน คอหอยซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของลำคอด้านหลังปากทำหน้าที่ในการควบคุมอาหารโดยตรงสู่หลอดอาหารและป้องกันไม่ให้เข้าสู่หลอดลมหรือหลอดลม
หลอดอาหารจะช่วยเคลื่อนย้ายอาหารที่ติดเครื่องไปทางกระเพาะอาหารผ่านการบีบตัวของกล้ามเนื้อ ขั้นตอนการย่อยที่สองเกิดขึ้นในกระเพาะอาหาร เมื่ออาหารที่ผ่านการย่อยออกมาจากกระเพาะอาหารจะเข้าสู่ลำไส้เล็กส่วนต้นซึ่งน้ำย่อยจากตับและตับอ่อนรวมกัน
ระบบทางเดินอาหารส่วนล่างประกอบด้วยลำไส้ส่วนใหญ่และทวารหนัก ลำไส้จะแบ่งออกเป็นลำไส้เล็กและลำไส้ใหญ่ซึ่งทั้งคู่มีสามส่วนย่อย สองส่วนของลำไส้เล็กจะรวมอยู่ในทางเดินอาหารส่วนล่าง, jejunum และ ilium
jejunum คือส่วนกลางของลำไส้เล็ก มันย้ายอาหารจากลำไส้เล็กส่วนต้นไปยังเชิงกรานผ่าน peristalsis และช่วยในการดูดซึมสารอาหาร การดูดซึมสารอาหารส่วนใหญ่เกิดขึ้นในเชิงกรานซึ่งเรียงรายไปด้วย villi ซึ่งเป็นเส้นคาดการณ์ที่คล้ายนิ้วมือด้วยกล้องจุลทรรศน์ซึ่งเพิ่มพื้นที่ผิวเพื่อการดูดซับที่มากขึ้น โมเลกุลที่ละลายได้ทั้งหมดจะถูกดูดซึมเข้าสู่เลือดในเชิงกราน
ลำไส้ใหญ่ประกอบด้วยลำไส้ใหญ่ส่วนต้นลำไส้ใหญ่และไส้ตรง ลำไส้ใหญ่ส่วนต้นเชื่อมต่อลำไส้เล็กและลำไส้ใหญ่ในขณะที่ลำไส้ใหญ่ดูดซับน้ำและเกลือจากวัสดุที่ย่อยแล้วก่อนที่จะถูกขับออกมาเป็นของเสีย ลำไส้ใหญ่มีสี่ส่วนที่ต่างกัน: ลำไส้ใหญ่จากน้อยไปมาก, ลำไส้ใหญ่ขวาง, ลำไส้ใหญ่จากมากไปหาน้อยและลำไส้ใหญ่ sigmoid ไส้ตรงเป็นพื้นที่จัดเก็บชั่วคราวสำหรับอุจจาระหรือขยะมูลฝอยก่อนที่จะถูกขับออกมา ส่วนสุดท้ายของระบบทางเดินอาหารส่วนล่างคือทวารหนักเป็นทางออกของอุจจาระซึ่งเป็นของเสียจากคลองอาหารจากร่างกาย
ตับถุงน้ำดีและตับอ่อนเป็นอวัยวะส่วนอื่นของระบบย่อยอาหารที่รองรับการทำงานของระบบทางเดินอาหาร ตับผลิตน้ำดีซึ่งช่วยในการสลายของอาหารที่ติดเครื่องในลำไส้เล็กและถุงน้ำดีเก็บน้ำดีชั่วคราว ตับอ่อนจะหลั่งเอนไซม์ย่อยอาหารหลายชนิดเข้าไปในลำไส้เล็กเพื่อช่วยในการย่อยอาหาร
