กายวิภาคของก้านสมองมีหน้าที่ในการทำหน้าที่ของชีวิตขั้นพื้นฐาน มันรวมถึง midbrain, pons และ medulla oblongata กายวิภาคของก้านสมองเป็นส่วนหนึ่งของร่างกายที่เชื่อมต่อสมองกับไขสันหลังและส่วนที่เหลือของระบบประสาท การหายใจความดันโลหิตและการย่อยอาหารเป็นหน้าที่ของกายวิภาคที่บรรจุอยู่ในส่วนของก้านสมอง
การมองเห็นและการได้ยินนั้นควบคุมโดยส่วนของก้านสมองที่รู้จักกันในชื่อสมองส่วนกลางซึ่งอยู่ใต้เยื่อหุ้มสมองสมองโดยตรง substantia nigra ของปมประสาทฐานตั้งอยู่ในบริเวณนี้ของสมอง โดปามีนผลิตในภูมิภาคนี้และพื้นที่ยังควบคุมการเคลื่อนไหว นิวเคลียสสีแดงในสมองส่วนกลางสื่อสารกับเซลล์ประสาทมอเตอร์ สติและความตื่นตัวจะถูกควบคุมผ่านการก่อไขว้กันเหมือนแหซึ่งอยู่ในส่วนนี้
ไกลออกไปจากใต้สมองส่วนกลางในลักษณะทางกายวิภาคของก้านสมองคือบริเวณที่มีลูกพรุน มีการประมวลผลการตีความข้อมูลทางประสาทสัมผัสการได้ยินที่นี่ แย่ก็มีการเชื่อมต่อกับสมองน้อยและมีอิทธิพลต่อการเคลื่อนไหว หน้าที่หลักของโครงสร้างแย่คือการเชื่อมต่อเปลือกสมองและไขกระดูก ฟังก์ชั่นอัตโนมัติที่จำเป็นเช่นการนอนหลับการหายใจหาวและการกะพริบถูกควบคุมโดยโครงสร้างที่เชื่อมต่อกับส่วนนี้
ส่วนที่สามที่สำคัญของกายวิภาคของก้านสมองคือไขกระดูก มันเป็นส่วนล่างของก้านสมองและควบคุมการควบคุมการอาเจียนหัวใจและเลือดและการย่อยอาหาร มีสองส่วนหลักของไขกระดูก oblongata ที่รู้จักกันดีกว่าและต่ำกว่า ส่วนด้านล่างของโครงสร้างเชื่อมต่อโดยตรงกับเส้นประสาทที่อยู่ด้านบนของเส้นประสาทไขสันหลัง กระแสเลือดไหลผ่านที่นี่เพื่อไปให้ถึงและทำให้ออกซิเจนในส่วนที่เหลือของสมอง
การรวมกลุ่มของเส้นประสาทสมองยังเป็นส่วนหนึ่งของกายวิภาคของก้านสมอง เส้นประสาทที่แตกต่างกันเชื่อมต่อกับส่วนต่าง ๆ และรวมกลุ่มขนาดใหญ่แต่ละฟังก์ชั่นการควบคุมเฉพาะของสมองและร่างกาย แต่ละส่วนควบคุมทักษะยนต์ตีความข้อมูลทางประสาทสัมผัสและสื่อสารกับสมองน้อย
โรคและแผลสามารถสร้างความเสียหายให้กับกายวิภาคของสมองโดยทำให้เกิดอาการปวดหัว, ปัญหาการพูด, การหย่อนยานของใบหน้าและการสูญเสียการได้ยิน เนื้องอกได้รับการวินิจฉัยโดยใช้เครื่องถ่ายภาพด้วยคลื่นสนามแม่เหล็ก (MRI) โรคในพื้นที่ทำให้เกิดความอ่อนแอในกล้ามเนื้อ, วิงเวียนและกลืนปัญหา เส้นประสาทสมองส่วนใหญ่เชื่อมต่อผ่านก้านสมองดังนั้นปัญหาในบริเวณนี้จึงร้ายแรงมากและอาจทำให้เกิดปัญหาการหยุดชะงักในชีวิตที่สำคัญ
