ลำไส้เล็กประกอบด้วยส่วนต่าง ๆ สามส่วนคือลำไส้เล็กส่วนต้นลำไส้เล็กส่วนกลางและลำไส้เล็กส่วนต้น ลำไส้เล็กส่วนต้นเป็นจุดเริ่มต้นของลำไส้เล็กและติดอยู่ที่กระเพาะอาหารโดยกล้ามเนื้อหูรูด pyloric เมื่อเทียบกับส่วนที่เหลือของลำไส้เล็กลำไส้เล็กส่วนต้นนั้นสั้นและกว้างโดยมีรูปร่าง C ชัดเจน กายวิภาคของลำไส้เล็กส่วนต้นสะท้อนให้เห็นถึงความจริงที่ว่าการย่อยอาหารส่วนใหญ่เกิดขึ้นที่นั่น
กายวิภาคศาสตร์ขั้นต้นของลำไส้เล็กส่วนต้นสามารถแบ่งย่อยออกเป็นสี่ส่วน สิ่งเหล่านี้ไม่ใช่ส่วนที่แตกต่างกัน แต่ได้รับการติดป้ายเพื่ออธิบายว่าการกระทำที่แตกต่างกันในลำไส้เล็กส่วนต้นเกิดขึ้นได้อย่างไร สี่ส่วนของลำไส้เล็กส่วนต้นเป็นส่วนที่เหนือกว่าส่วนจากมากไปน้อยส่วนแนวนอนและส่วนจากน้อยไปมาก แต่ละส่วนหมายถึงพื้นที่เฉพาะของรูปร่าง C ของลำไส้เล็กส่วนต้น
ส่วนที่เหนือกว่าของลำไส้เล็กส่วนต้นจะเรียกว่าเป็นส่วนแรกและหลอดไฟลำไส้เล็กส่วนต้น มันยาวประมาณ 2 นิ้ว (5 ซม.) โดยที่ 3/4 แรกของนิ้ว (2 ซม.) เป็นมือถือ นี่เป็นลักษณะเฉพาะภายในกายวิภาคของลำไส้เล็กส่วนต้นเนื่องจากส่วนอื่น ๆ ของมันนั้นไม่สามารถเคลื่อนที่ได้ซึ่งติดอยู่กับผนังหน้าท้อง ส่วนที่เหนือกว่าเป็นส่วนประกอบของรูปร่าง C และเริ่มต้นที่กล้ามเนื้อหูรูด pyloric
ส่วนจากมากไปน้อยหรือส่วนที่สองเป็นส่วนที่ยาวที่สุดของกายวิภาคศาสตร์ขั้นต้นของลำไส้เล็กส่วนต้น มันเป็นที่ที่น้ำย่อยจากตับอ่อนและตับถูกขับเข้าไปในลำไส้เล็กส่วนต้น ภายในส่วนนี้และส่วนแนวนอนหรือส่วนที่สามของลำไส้เล็กส่วนต้นอาหารผสมกับน้ำย่อย เอนไซม์ในน้ำย่อยจะย่อยสลายอาหารเป็นโมเลกุลขนาดเล็กซึ่งถูกดูดซึมเข้าสู่กระแสเลือดจากภายในอิลิม
ลักษณะทางกายวิภาคด้วยกล้องจุลทรรศน์ของลำไส้เล็กส่วนต้นแสดงให้เห็นว่ามันมีสี่ชั้นภายในผนังของมันซึ่งเป็นเช่นเดียวกับส่วนที่เหลือของลำไส้เล็ก จากด้านในของลำไส้เล็กส่วนต้นนั้นมีสี่ชั้นคือเยื่อบุ, submucosa, muscularis propria และ serosa Brunner ต่อมนั้นอยู่ในชั้น mucosal ของลำไส้เล็กส่วนต้น ต่อมเหล่านี้จะสร้างเมือกเพื่อหล่อลื่นผนังภายในของลำไส้เล็กส่วนต้นรวมถึงเกลือแร่เพื่อต่อต้าน pH ของอาหารที่ผ่านจากกระเพาะอาหารสู่ลำไส้เล็กส่วนต้น
ผนังของลำไส้เล็กส่วนต้นนั้นถูกพับเก็บอย่างสูงและถูกปกคลุมไปด้วยเส้นโครงขนาดเล็กที่เรียกว่า villi การคาดการณ์เหล่านี้มีกล้ามเนื้อเรียบเพื่อช่วยในการเคลื่อนย้ายอาหารผ่านลำไส้เล็กส่วนต้นรวมถึงการผสมอย่างละเอียดกับน้ำย่อย เอ็นไซม์ย่อยอาหารบางตัวผลิตจากเซลล์ซึ่งอยู่ที่ปลาย Villi
