ระบบโครงร่างคือการรองรับร่างกาย ช่วยปกป้องอวัยวะต่าง ๆ และช่วยยึดเอ็นเอ็นกล้ามเนื้อและเอ็นกล้ามเนื้อที่เคลื่อนไหวได้ แม้ว่าระบบโครงกระดูกทั้งชายและหญิงจะมีจำนวนกระดูกเท่ากัน แต่ก็มีความแตกต่างกัน ความแตกต่างระหว่างระบบโครงร่างเพศชายและเพศหญิงเป็นโครงสร้างและรวมถึงพื้นที่เช่นกระดูกเชิงกรานกะโหลกและแขนขา มวลและการพัฒนาของกระดูกเป็นสองส่วนเพิ่มเติมของความแตกต่างในระบบโครงร่าง
หนึ่งในพื้นที่ของความแตกต่างระหว่างระบบโครงกระดูกชายและหญิงคือกระดูกเชิงกราน กระดูกเชิงกรานของผู้หญิงและบริเวณอุ้งเชิงกรานมีรูปร่างที่แตกต่างจากเพศชายเนื่องจากกระดูกเชิงกรานของผู้หญิงถูกสร้างขึ้นเพื่อให้กระบวนการคลอดบุตร บริเวณอุ้งเชิงกรานของผู้หญิงมีลักษณะเป็นวงกลมมากขึ้นและกระดูกเชิงกรานนั้นมีขนาดเล็กลงและกว้างขึ้น ในทางตรงกันข้ามอุ้งเชิงกรานของชายจะไม่ตื้นเขิน
ความแตกต่างของโครงสร้างระหว่างระบบโครงร่างเพศชายและเพศหญิงก็ชัดเจนในกะโหลกศีรษะเช่นกัน ส่วนที่ยื่นออกมาเล็ก ๆ ที่พบบนด้านหลังของกะโหลกศีรษะที่เรียกว่าโหนกท้ายทอยภายนอกมีความชัดเจนมากขึ้นในกะโหลกศีรษะของผู้ชายมากกว่ากะโหลกศีรษะของผู้หญิง กระดูกขากรรไกรของกะโหลกศีรษะผู้หญิงก็กลมกว่าในขณะที่กระดูกขากรรไกรตัวผู้เป็นสแควร์ กระดูกโหนกแก้มของกะโหลกศีรษะหญิงนั้นไม่เด่นชัดเท่ากับกะโหลกศีรษะของผู้ชาย ลักษณะเหล่านี้สร้างคุณสมบัติที่แตกต่างที่สร้างความแตกต่างในโครงสร้างใบหน้าชายและหญิง
กระดูกที่ทำให้แขนขาของโครงกระดูกนั้นแสดงความแตกต่างระหว่างระบบโครงกระดูกตัวผู้และตัวเมียด้วย ท่อนแขนรัศมีและกระดูกเป็นกระดูกทั้งสามที่ทำให้แขนในขณะที่กระดูกน่องกระดูกหน้าแข้งและกระดูกต้นขาเป็นกระดูกขา ในเพศชายกระดูกเหล่านี้มักจะยาวกว่าและหนากว่าในตัวเมีย กระดูกนิ้วเรียกว่า phalanges มักมีขนาดใหญ่กว่าตัวผู้ในตัวเมีย อย่างไรก็ตามผู้ชายบางคนมีกระดูกสั้นกว่าผู้หญิง
มวลโดยรวมก่อให้เกิดความแตกต่างระหว่างระบบโครงร่างเพศชายและเพศหญิง โครงกระดูกชายมักหนักและใหญ่กว่ามาก แม้ว่ามวลของโครงกระดูกสามารถเป็นจุดอ้างอิงทั่วไปได้ แต่ก็ไม่สามารถใช้คนเดียวได้ มีผู้ชายบางคนที่เล็กกว่าปกติและจะมีโครงกระดูกเล็กกว่า นอกจากนี้ยังมีผู้หญิงบางคนที่มีโครงกระดูกสูงกว่าค่าเฉลี่ย เพื่อพิจารณาว่าโครงกระดูกเป็นชายหรือหญิงต้องพิจารณาความแตกต่างที่สำคัญอื่น ๆ พร้อมกับพันธุศาสตร์และชาติพันธุ์
ความแตกต่างระหว่างระบบโครงร่างเพศชายและเพศหญิงยังได้รับอิทธิพลจากการพัฒนาของกระดูก ฮอร์โมนมีบทบาทอย่างมากต่อการเติบโตของกระดูก สำหรับผู้ชายฮอร์โมนเพศชายเป็นฮอร์โมนที่มีผลต่อการเจริญเติบโตของกระดูกและรูปร่างในขณะที่ฮอร์โมนเพศหญิงที่มีอิทธิพลต่อการพัฒนากระดูกเรียกว่าสโตรเจน ในช่วงวัยแรกรุ่นระดับฮอร์โมนหญิงจะสูงกว่ามากและระดับเทสโทสเทอโรนสำหรับเพศชายทำให้กระดูกเพศหญิงหยุดพัฒนาเมื่ออายุ 18 และการเจริญเติบโตของผู้ชายจะหยุดลงเมื่ออายุ 21
