ระบบประสาทของลำไส้คือเครือข่ายของเซลล์ประสาทซึ่งเป็นเซลล์ประสาท สารเคมีที่เรียกว่าสารสื่อประสาท และโปรตีนพิเศษที่ตั้งอยู่ทั่วระบบทางเดินอาหาร บางครั้งมันถูกเรียกว่าระบบประสาทของลำไส้หรือ "สมอง" หรือ "ใจ" ของลำไส้ แต่เพราะจริง ๆ แล้วมันเริ่มจากจุดเริ่มต้นจนถึงจุดสิ้นสุดของระบบทางเดินอาหารจึงไม่ได้ถูก จำกัด อยู่ที่กระเพาะอาหาร พื้นที่ เซลล์ประสาทและสารสื่อประสาทที่มีอิทธิพลต่อเซลล์ประสาทไม่เพียง แต่อยู่ในสมองซึ่งเป็นระบบประสาทส่วนกลาง แต่ยังอยู่ในเยื่อบุของหลอดอาหารกระเพาะอาหารลำไส้เล็กและลำไส้ใหญ่ การสังเกตผลของการรักษาและยาในระบบทางเดินอาหารทำให้นักประสาทวิทยาและผู้ให้บริการด้านการแพทย์คนอื่น ๆ นึกถึงระบบประสาทของลำไส้ในฐานะ "สมอง" ตัวที่สองที่สื่อสารกับและส่งผลต่อสมองหลัก
ในระหว่างการพัฒนาของตัวอ่อนระบบประสาทของลำไส้จะเกิดขึ้นจากเนื้อเยื่อก้อนเดียวกันซึ่งเกิดขึ้นที่ระบบประสาทส่วนกลาง เนื้อเยื่อนั้นเรียกว่ายอดประสาท ความจริงที่ว่าระบบทั้งสองนี้ใช้แหล่งกำเนิดเดียวกันทำให้ไม่น่าแปลกใจที่จะพบว่าพวกมันมีเซลล์ชนิดเดียวกันสารสื่อประสาทโปรตีนในสมอง - และระบบหนึ่งมีผลต่อระบบอื่น ตัวอย่างเช่นสารบางอย่างที่ส่งผลต่อสมองหรือสภาพจิตใจของบุคคลก็มีผลต่อระบบประสาทลำไส้เช่นกัน ยาเสพติดเช่นยากล่อมประสาทมีอิทธิพลต่อสารสื่อประสาทที่เรียกว่า serotonin ที่ตั้งอยู่ในระบบประสาทส่วนกลางเช่นเดียวกับในระบบประสาทลำไส้
แม้ว่ายากล่อมประสาทจะทำงานในด้านจิตใจของบุคคล แต่ก็สามารถทำงานในระบบทางเดินอาหารทำให้เกิดการรบกวนเช่นท้องร่วงหรือคลื่นไส้ รูปเฮโรอีนและมอร์ฟีนในบรรดายาที่อาจรบกวนการย่อยอาหารปกติ เห็นได้ชัดว่าสิ่งที่เกิดขึ้นในระบบประสาทส่วนกลางจะสะท้อนอยู่ในระบบประสาทลำไส้ทำให้นักประสาทวิทยาบางคนสงสัยว่าการติดยาอาจเป็นเรื่องของการพึ่งพาในทั้งสองระบบ การเชื่อมต่อนี้เกิดขึ้นได้ง่ายเมื่อพูดถึงระบบประสาทของลำไส้ในแง่ที่เป็นรูปเป็นร่าง
เมื่อบุคคลเผชิญกับสถานการณ์ที่น่ากลัวและเป็นอันตรายสมองของระบบประสาทส่วนกลางตอบสนองโดยการปล่อยฮอร์โมนเพื่อช่วยให้บุคคลตอบสนองต่อความเครียดที่เกิดขึ้นทันที นี่คือวิธีการตัดสินใจ "สู้รบหรือหนี" และเป็นหลักฐานว่าแม้จะไม่เกี่ยวข้องกับยาเสพติดสภาพจิตใจของบุคคลก็ส่งผลต่อระบบประสาทลำไส้ ประสาทรับความรู้สึกที่อยู่ในกระเพาะอาหารได้รับผลกระทบจากการปล่อยฮอร์โมนความเครียดซึ่งเป็นสาเหตุที่ทำให้ "ผีเสื้อ" ในกระเพาะอาหารสามารถผลิตได้ในเวลาดังกล่าว
