เยื่อบุลำไส้เรียกอีกอย่างว่าเยื่อบุกระเพาะอาหารคือเยื่อบุของทางเดินอาหาร มันล้อมรอบลูเมน, ช่องว่างกลวงที่ศูนย์กลางของทางเดินอาหารที่ผ่าน เยื่อเมือกจะหลั่งเมือกที่ปกป้องเซลล์และช่วยให้อาหารเคลื่อนที่ไปตามทางเดินอาหาร
เยื่อบุลำไส้เป็นชั้นในสุดของสี่ชั้นในทางเดินอาหาร มันล้อมรอบด้วย submucosa ชั้นนี้รองรับเยื่อบุและเชื่อมต่อกับชั้นของกล้ามเนื้อที่ล้อมรอบและเคลื่อนย้ายอาหารผ่านทางเดินอาหาร ชั้นสุดท้ายรอบนอกเป็นชั้นของเนื้อเยื่อปกคลุม สิ่งนี้เรียกว่า Adventitia หรือ serosa ขึ้นอยู่กับตำแหน่งในร่างกาย serosa ครอบคลุมอวัยวะไปข้างหน้าของเยื่อบุช่องท้องในขณะที่ Adventitia ถูกพบอยู่ด้านหลัง
เยื่อบุลำไส้นั้นสามารถแบ่งออกเป็นสามชั้นเพิ่มเติม ชั้นที่หันหน้าไปทางลูเมนประกอบด้วยเยื่อบุผิว เลเยอร์นี้ครอบคลุมในช่องเล็ก ๆ ที่เรียกว่า foveolae ซึ่งเชื่อมต่อกับท่อส่งของเหลวและเมือก สารอาหารจะถูกดูดซึมผ่านเยื่อบุผิว
ชั้นต่อไปของเยื่อบุลำไส้คือแผ่นโพรพีเนียซึ่งรองรับเยื่อบุผิว ต่อมที่ผลิตเมือกและสารคัดหลั่งทางเดินอาหารก็อยู่ในชั้นนี้เช่นกัน ในลำไส้เล็กนั้นแผ่นโพรพีเมียยังมีท่อน้ำเหลืองส่วนกลาง
ชั้นสุดท้ายและชั้นนอกสุดคือ lamina muscularis mucosae ชั้นบาง ๆ ของกล้ามเนื้อนี้จะแยก lamina propria และ submucosa ออกมา นอกจากนี้ยังโค้งงอเบา ๆ ทำให้เยื่อบุกระเพื่อมดังนั้นผลิตภัณฑ์ของต่อมในแผ่นโพรพีเมียจะถูกขับออกไปในรู การเคลื่อนไหวอย่างต่อเนื่องของชั้นนี้ยังทำให้เยื่อบุผิวสัมผัสกับเนื้อหาของลูเมนช่วยในการดูดซับสารอาหาร
การทำงานของเยื่อบุลำไส้แตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับตำแหน่งในระบบทางเดินอาหาร ในหลอดอาหารจะเคลื่อนไหวอาหารโดยไม่ช่วยในการย่อยอาหาร ในกระเพาะอาหารนั้นจะต้องทนต่อค่า pH ต่ำของกรดในกระเพาะอาหาร ในลำไส้เล็กจะดูดซับสารอาหารในขณะที่ลำไส้ใหญ่นั้นจะสกัดน้ำออกทำให้ของเสียถูกขับออกมา
เมื่อฟังก์ชั่นเปลี่ยนแปลงโครงสร้างก็เปลี่ยนแปลงเช่นกัน ในกระเพาะอาหารต่อมหลั่งไม่เพียง แต่เมือก แต่ยังกรดในกระเพาะอาหาร ต่อมที่อวัยวะหรือฐานของกระเพาะอาหารยังหลั่งฮอร์โมนเปปซินอนิกซึ่งกลายเป็นเอนไซม์เปปซิน ในลำไส้ผิวของเยื่อบุลำไส้จะถูกพับและย่นเพื่อเพิ่มพื้นที่ผิวของมันทำให้มันสัมผัสกับการย่อยอาหารมากขึ้น
