เมื่อคนกินอาหารร่างกายจะต้องแปลงอาหารนั้นให้เป็นโมเลกุลที่สามารถเปลี่ยนเป็นพลังงานและสารอาหารดิบได้ ระบบย่อยอาหารของมนุษย์ควบคุมการกระจายตัวของสารอาหารและพลังงานในร่างกายโดยทำให้อาหารมีปฏิกิริยาทางเคมีขณะที่มันเดินทางผ่านทางเดินอาหาร โครงสร้างของระบบย่อยอาหารหรือที่เรียกว่าคลองอาหารช่วยให้อวัยวะต่าง ๆ สลายตัวตามลำดับและแปรรูปอาหาร นอกเหนือจากปากและหลอดอาหารแล้วยังมีอวัยวะหลักสามระบบในระบบย่อยอาหารและอวัยวะเล็ก ๆ อีกมากมาย กระบวนการย่อยอาหารจะเริ่มขึ้นในปากโดยมีน้ำลายออกมาและทำให้อาหารแตกเป็นชิ้นเล็ก ๆ
กระเพาะอาหารเป็นส่วนแรกของโครงสร้างของระบบย่อยอาหารซึ่งประกอบด้วยถุงกลวงของกล้ามเนื้อซึ่งอยู่ด้านล่างไดอะแฟรมและซี่โครง มันถูกแยกออกจากหลอดอาหารและลำไส้เล็กโดยกล้ามเนื้อหูรูดของหลอดอาหารและกล้ามเนื้อหูรูด pyloric ตามลำดับ โครงสร้างของระบบย่อยอาหารต้องการให้อาหารถูกย่อยก่อนที่จะผ่านไปยังส่วนที่เหลือของทางเดินอาหาร ฟิล์มเมือกครอบคลุมเยื่อบุของกระเพาะอาหารเพื่อป้องกันผนังของกระเพาะอาหารจากกรดไฮโดรคลอริกที่ทำลายอาหาร อาหารยังคงอยู่ในกระเพาะอาหารจนกว่าจะผ่านการย่อยทางกายภาพเพื่อให้เหมาะสำหรับการสกัดสารอาหารในลำไส้เล็ก
หลังจากอาหารถูกย่อยสลายในกระเพาะอาหารมันจะผ่านเข้าสู่ลำไส้เล็กในโครงสร้างของระบบย่อยอาหารทันที ลำไส้เล็กมีความยาวโดยเฉลี่ย 20 ฟุต (ประมาณหกเมตร) ลำไส้เล็กทำหน้าที่ย่อยสลายสารเคมีเป็นส่วนใหญ่ผ่านทางเอ็นไซม์ที่ถูกตับอ่อนหลั่งออกมา โปรตีนจะแตกตัวเป็นกรดอะมิโนไขมันจะสลายตัวเป็นกลีเซอรอลและคาร์โบไฮเดรตจะแตกตัวเป็นกลูโคสและน้ำตาลอื่น ๆ ผนังด้านในของลำไส้เล็กนั้นมีเนื้อเยื่อที่คล้ายนิ้วซึ่งเรียกว่า villi ซึ่งจับโมเลกุลอาหารและส่งพวกมันเข้าไปในเส้นเลือดฝอยภายนอกแล้วไปยังเส้นเลือดใหญ่
ลำไส้เล็กเชื่อมต่อกับลำไส้ใหญ่ ลำไส้ใหญ่เป็นส่วนหลักสุดท้ายของโครงสร้างของระบบย่อยอาหารและรับผิดชอบในการดูดซับน้ำส่วนเกินเปลี่ยนขยะให้เป็นอุจจาระและขับถ่ายออก แบคทีเรียที่อาศัยอยู่ในลำไส้เล็กหรือที่เรียกว่าฟลอราลำไส้ดูดซับวัสดุที่เป็นของแข็งที่เหลืออยู่หลังจากสารอาหารและพลังงานทั้งหมดถูกสกัดจากอาหารและเครื่องดื่ม ตามกฎแล้วขยะมูลฝอยใช้เวลาหนึ่งวันในการเดินทางผ่านลำไส้ใหญ่
