การจำแนกทางวิทยาศาสตร์เป็นระบบที่นักชีววิทยาใช้เพื่อจำแนกสิ่งมีชีวิตทั้งหมดบนโลก เป็นที่รู้จักกันว่า การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ในชีววิทยา หรือการ จัดหมวดหมู่ของ Linnean หลังจาก Carolus Linnaeus (1707-1778) ผู้ที่พยายามครั้งแรกโครงการขนาดใหญ่นี้ ผลงานบุกเบิกคือ Systema Naturae ซึ่งตีพิมพ์ครั้งแรกในปี 1735 ซึ่งวิ่งผ่านสิบสองฉบับตลอดชีวิตของ Linnaeus รุ่นแรกมีไม่กี่พันรายการแบ่งออกเป็นแท็กซ่าตามลักษณะทางกายภาพที่ใช้ร่วมกัน ทุกวันนี้กว่าสองล้านสปีชีส์ได้รับการยอมรับโดยวิทยาศาสตร์แม้ว่าจำนวนพืชสัตว์และเซลล์เดียวบนโลกคาดว่าจะอยู่ระหว่าง 10 ถึง 100 ล้าน
ระบบการจำแนกทางวิทยาศาสตร์ที่ใช้ในชีววิทยาเป็นลำดับชั้นโดยมีการจัดหมวดหมู่แปดระดับ ย้ายจากที่เล็กที่สุดไปหาใหญ่พวกมันคือสปีชีส์สกุลตระกูลคำสั่งคลาสไฟลัมอาณาจักรและโดเมน ยิ่งมีการแบ่งแยกเพิ่มมากขึ้นในระดับเหล่านี้เนื่องจากชีวิตไม่มีภาระผูกพันพิเศษที่จะถูกจัดหมวดหมู่ตามธรรมชาติในระดับแปดระดับเท่านั้น เพื่อให้ตัวอย่างของแต่ละคนพิจารณาตำแหน่งของมนุษย์ในการจำแนกทางวิทยาศาสตร์ มนุษย์เป็นเผ่าพันธุ์ Homo sapiens , สกุล Homo , ตระกูล Hominidae (ลิงใหญ่), สั่งบิชอพ, คลาส Mammalia (สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม), ไฟลัม Chordata (สัตว์มีกระดูกสันหลังและญาติใกล้ชิด), อาณาจักร Animalia (สัตว์), โดเมนยูคาริโอ เซลล์ที่ซับซ้อน)
ระดับสูงสุดของการจำแนกทางวิทยาศาสตร์มีการเปลี่ยนแปลงหลายครั้งในช่วงหลายปีที่ผ่านมา ในปี 1735 ลินเนอัสได้แนะนำอาณาจักรสองอาณาจักรคือ Vegetabilia (พืชและเชื้อรา) และ Animalia ในปี ค.ศ. 1866 นักชีววิทยาชาวเยอรมันเอิร์นส์เฮกเคลได้แนะนำอาณาจักรอื่น Protista สำหรับสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวทั้งหมด ในปี 1937 นักชีววิทยาชาวฝรั่งเศส Edouard Chatton ได้แบ่งชีวิตออกเป็นสอง "อาณาจักร" - Prokaryota และ Eukaryota ตามการสำรวจรายละเอียดของเซลล์ในพืชสัตว์และแบคทีเรีย ปรากฎว่าพืชและสัตว์มีความคล้ายคลึงพื้นฐานในความซับซ้อนของเซลล์และการปรากฏตัวของนิวเคลียสของเซลล์ในขณะที่แบคทีเรียขาดทั้งนิวเคลียสและออร์แกเนลล์ (โครงสร้างภายในเซลล์)
มีการอัปเดตที่สำคัญอีกหลายอย่างตามมาในยุค 50, 60 และ 70 ซึ่งเป็นช่วงเวลาแห่งความก้าวหน้าทางชีววิทยาอย่างรวดเร็ว เฮอร์เบิร์ตโคปแลนด์ได้อัปเดตระบบเป็นสี่ก๊กในปี 1956 เมื่อเขาเปลี่ยนชื่อ Prokaryota เป็น Monera และแบ่ง Eukaryota เป็นสามก๊ก: Protista, Plantae และ Animalia การเปลี่ยนแปลงอีกอย่างเกิดขึ้นในปี 1969 เมื่อโรเบิร์ตวิตเทคเกอร์แยก Protista เป็น Fungi และ Protista ทำให้เชื้อราจัดอยู่ในระดับสูงสุดของตนเองเป็นครั้งแรก
ในปี 1977 Carl Woese และผู้ทำงานร่วมกันของเขาได้แนะนำระบบระดับบนสุดที่แออัดที่สุดโดยมีหกอาณาจักร: Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, Plantae และ Animalia จากนั้นในปี 1990 ระบบได้รับการทำให้เรียบง่ายโดย Woese ลดลงเป็นสามโดเมน: แบคทีเรีย Archaea และ Eukarya หลังคือระบบการจำแนกระดับบนสุดที่ใช้
